More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0259 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007798  NSE_0259  chromosomal replication initiator protein DnaA  100 
 
 		 474 aa  968    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.310271  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0809  chromosomal replication initiation protein  58.68 
 
 		 464 aa  535  1e-151  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.54082  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0270  chromosomal replication initiation protein  57.8 
 
 		 452 aa  533  1e-150  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.43885  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0001  chromosomal replication initiation protein  58.21 
 
 		 460 aa  523  1e-147  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.335135  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0003  chromosomal replication initiator protein DnaA  49.68 
 
 		 519 aa  447  1.0000000000000001e-124  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000118183  unclonable  1.2245600000000001e-24 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0001  chromosomal replication initiation protein  46.6 
 
 		 509 aa  411  1e-113  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0001  chromosomal replication initiation protein  45.75 
 
 		 482 aa  409  1e-113  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3373  chromosomal replication initiation protein  45.12 
 
 		 460 aa  409  1e-113  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0001  chromosomal replication initiation protein  43.78 
 
 		 470 aa  394  1e-108  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0703594  normal  0.628106 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2833  chromosomal replication initiation protein  43.45 
 
 		 448 aa  394  1e-108  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0002  chromosomal replication initiation protein  45.56 
 
 		 461 aa  389  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.020385  hitchhiker  0.000000603983 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0001  chromosomal replication initiation protein  44.85 
 
 		 477 aa  390  1e-107  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.839498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  46.27 
 
 		 477 aa  388  1e-106  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1342  chromosomal replication initiation protein  44.99 
 
 		 455 aa  380  1e-104  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0011  chromosomal replication initiation protein  44.99 
 
 		 455 aa  380  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0001  chromosomal replication initiation protein  42.25 
 
 		 475 aa  373  1e-102  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0001  chromosomal replication initiation protein  40.22 
 
 		 449 aa  352  1e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4153  chromosomal replication initiation protein  40.22 
 
 		 462 aa  348  2e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  7.6269e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4177  chromosomal replication initiation protein  40.22 
 
 		 462 aa  348  2e-94  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510804  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0001  chromosomal replication initiation protein  40.43 
 
 		 451 aa  348  2e-94  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00187127  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0001  chromosomal replication initiation protein  40.43 
 
 		 451 aa  348  2e-94  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.000000000123931  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0001  chromosomal replication initiation protein  41.2 
 
 		 450 aa  347  4e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000634969  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0001  chromosomal replication initiation protein  40.55 
 
 		 475 aa  346  6e-94  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.216398 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0001  chromosomal replication initiation protein  38.95 
 
 		 473 aa  346  6e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.884369 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0001  chromosomal replication initiation protein  38.96 
 
 		 472 aa  346  6e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.206184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0001  chromosomal replication initiation protein  38.87 
 
 		 475 aa  343  5e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0001  chromosomal replication initiation protein  38.91 
 
 		 475 aa  343  5e-93  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0001  chromosomal replication initiation protein  39.7 
 
 		 472 aa  343  5e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.583954  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0032  chromosomal replication initiation protein  39.66 
 
 		 463 aa  341  1e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000217775  normal  0.251102 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0001  chromosomal replication initiation protein  39.43 
 
 		 472 aa  341  2e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  39.39 
 
 		 462 aa  340  4e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.138659  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4066  chromosomal replication initiation protein  39.53 
 
 		 466 aa  340  5e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000844177  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4050  chromosomal replication initiation protein  39.53 
 
 		 466 aa  340  5e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0553543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4123  chromosomal replication initiation protein  39.53 
 
 		 466 aa  340  5e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00889574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4172  chromosomal replication initiation protein  39.53 
 
 		 466 aa  340  5e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.049293  normal  0.324603 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0002  chromosomal replication initiation protein  38.81 
 
 		 501 aa  339  5.9999999999999996e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4230  chromosomal replication initiation protein  39.53 
 
 		 466 aa  339  7e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00725647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4223  chromosomal replication initiation protein  38.68 
 
 		 467 aa  339  7e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000066194  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1227  chromosomal replication initiation protein  39 
 
 		 449 aa  338  9.999999999999999e-92  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.174697  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  38.3 
 
 		 464 aa  338  9.999999999999999e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00240104  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03585  chromosomal replication initiation protein  38.68 
 
 		 467 aa  337  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0183504  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  38.68 
 
 		 467 aa  337  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000136922  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5130  chromosomal replication initiation protein  38.68 
 
 		 467 aa  337  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000558594  normal  0.0494414 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4212  chromosomal replication initiation protein  38.68 
 
 		 467 aa  337  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000201887  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03529  hypothetical protein  38.68 
 
 		 467 aa  337  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00951486  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0001  chromosomal replication initiation protein  38.68 
 
 		 467 aa  337  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000185056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3915  chromosomal replication initiation protein  38.68 
 
 		 467 aa  337  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.000000126813  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4067  chromosomal replication initiation protein  38.68 
 
 		 467 aa  337  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000102031  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0001  chromosomal replication initiation protein  39.57 
 
 		 452 aa  337  2.9999999999999997e-91  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0001  chromosomal replication initiation protein  39.57 
 
 		 452 aa  337  2.9999999999999997e-91  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0001  chromosomal replication initiation protein  38.88 
 
 		 451 aa  337  2.9999999999999997e-91  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.000000764641  normal  0.435321 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0001  chromosomal replication initiation protein  38.6 
 
 		 501 aa  336  5e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0002  chromosomal replication initiation protein  38.6 
 
 		 501 aa  336  5e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.536334 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0001  chromosomal replication initiation protein  37.87 
 
 		 465 aa  335  1e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00156244  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0001  chromosomal replication initiation protein  40.8 
 
 		 494 aa  334  2e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.852723  normal  0.138362 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  39.15 
 
 		 483 aa  333  4e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000328329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0001  chromosomal replication initiation protein  39.96 
 
 		 455 aa  331  1e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.632445  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0001  chromosomal replication initiation protein  37.87 
 
 		 465 aa  331  2e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00429077  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  43.42 
 
 		 447 aa  330  3e-89  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  38.31 
 
 		 453 aa  330  3e-89  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000208022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0001  chromosomal replication initiation protein  37.42 
 
 		 495 aa  330  4e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0136  chromosomal replication initiation protein  39.18 
 
 		 452 aa  329  6e-89  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000582235  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  40.82 
 
 		 455 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.738178 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2507  chromosomal replication initiation protein  37.92 
 
 		 472 aa  327  3e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000251721  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0001  chromosomal replication initiation protein  41.09 
 
 		 457 aa  327  4.0000000000000003e-88  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000597417  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0001  chromosomal replication initiation protein  38.95 
 
 		 458 aa  326  5e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000304436  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0002  chromosomal replication initiation protein  38.14 
 
 		 498 aa  325  8.000000000000001e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0001  chromosomal replication initiation protein  41.09 
 
 		 457 aa  325  9e-88  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000458864  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0001  chromosomal replication initiation protein  35.37 
 
 		 524 aa  325  1e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0237228  normal  0.131634 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0001  chromosomal replication initiation protein  37.91 
 
 		 460 aa  324  3e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  37.82 
 
 		 474 aa  323  3e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00208216  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0001  chromosomal replication initiation protein  36.95 
 
 		 506 aa  323  4e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0129481  hitchhiker  0.0000000143408 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0009  chromosomal replication initiation protein  38.25 
 
 		 460 aa  323  5e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000281375  unclonable  0.0000000000600935 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0008  chromosomal replication initiation protein  37.82 
 
 		 460 aa  322  9.000000000000001e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0003  chromosomal replication initiation protein  47.52 
 
 		 510 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0001  chromosomal replication initiation protein  37.47 
 
 		 459 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000781636  unclonable  0.00000344978 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  38.76 
 
 		 461 aa  322  9.999999999999999e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000000704659  normal  0.0525005 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0010  chromosomal replication initiation protein  47.52 
 
 		 506 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.645293  hitchhiker  0.0000364152 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0001  chromosomal replication initiation protein  38.13 
 
 		 450 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0001  chromosomal replication initiation protein  37.31 
 
 		 462 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000998931  unclonable  0.00000000000343779 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0001  chromosomal replication initiation protein  37.69 
 
 		 450 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000447845  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00010  chromosomal replication initiation protein  37.92 
 
 		 478 aa  321  1.9999999999999998e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.499294  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0001  chromosomal replication initiation protein  37.31 
 
 		 462 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000562887  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0001  chromosomal replication initiation protein  37.31 
 
 		 462 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000257358  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0001  chromosomal replication initiation protein  38.03 
 
 		 460 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000179736  unclonable  0.0000000000313535 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0001  chromosomal replication initiation protein  37.61 
 
 		 460 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000724276  unclonable  0.0000176 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0001  chromosomal replication initiation protein  37.31 
 
 		 462 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000157699  unclonable  0.0000121376 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0001  chromosomal replication initiation protein  47.52 
 
 		 505 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.390724  normal  0.0464489 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0003  chromosomal replication initiation protein  39.18 
 
 		 510 aa  320  3e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  unclonable  0.0000000244231  normal  0.247706 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0001  chromosomal replication initiation protein  47.23 
 
 		 494 aa  320  3e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0001  chromosomal replication initiation protein  39.62 
 
 		 499 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00640124  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  36.71 
 
 		 461 aa  320  3.9999999999999996e-86  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.926832  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  47.23 
 
 		 511 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0001  chromosomal replication initiation protein  47.23 
 
 		 511 aa  320  5e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.424003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0001  chromosomal replication initiation protein  47.23 
 
 		 511 aa  319  6e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0001  chromosomal replication initiation protein  47.23 
 
 		 507 aa  319  6e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00366311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0001  chromosomal replication initiation protein  37.82 
 
 		 461 aa  319  6e-86  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000263579  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0001  chromosomal replication initiation protein  37.5 
 
 		 462 aa  319  7e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000281438  unclonable  0.0000000118337 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0006  chromosomal replication initiation protein  37.5 
 
 		 462 aa  318  1e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000403403  unclonable  0.000000000136332 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00010  chromosomal replication initiation protein  46.94 
 
 		 514 aa  318  1e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.373198  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>