More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0001 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0001  chromosomal replication initiation protein  100 
 
 		 498 aa  1013    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0001  chromosomal replication initiation protein  52.42 
 
 		 477 aa  462  1e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.839498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0001  chromosomal replication initiation protein  54.11 
 
 		 453 aa  427  1e-118  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.115024 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0002  chromosomal replication initiation protein  45.5 
 
 		 461 aa  369  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.020385  hitchhiker  0.000000603983 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3373  chromosomal replication initiation protein  43.33 
 
 		 460 aa  363  3e-99  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0003  chromosomal replication initiator protein DnaA  43.79 
 
 		 519 aa  360  3e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000118183  unclonable  1.2245600000000001e-24 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0001  chromosomal replication initiation protein  44.64 
 
 		 482 aa  357  2.9999999999999997e-97  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1342  chromosomal replication initiation protein  43.81 
 
 		 455 aa  352  8e-96  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0011  chromosomal replication initiation protein  43.81 
 
 		 455 aa  352  8e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0809  chromosomal replication initiation protein  40.68 
 
 		 464 aa  351  2e-95  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.54082  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0270  chromosomal replication initiation protein  41.91 
 
 		 452 aa  349  7e-95  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.43885  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  45.49 
 
 		 477 aa  342  5.999999999999999e-93  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0001  chromosomal replication initiation protein  39.92 
 
 		 475 aa  342  1e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0001  chromosomal replication initiation protein  40.47 
 
 		 470 aa  341  2e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0703594  normal  0.628106 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2833  chromosomal replication initiation protein  41.65 
 
 		 448 aa  340  2.9999999999999998e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0001  chromosomal replication initiation protein  40.04 
 
 		 455 aa  338  9.999999999999999e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.632445  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0001  chromosomal replication initiation protein  40.45 
 
 		 509 aa  334  2e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0001  chromosomal replication initiation protein  39.07 
 
 		 460 aa  334  3e-90  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.335135  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2507  chromosomal replication initiation protein  39.22 
 
 		 472 aa  333  4e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000251721  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0002  chromosomal replication initiation protein  41.84 
 
 		 498 aa  333  5e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0001  chromosomal replication initiation protein  38.72 
 
 		 459 aa  332  7.000000000000001e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000386226  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0001  chromosomal replication initiation protein  41.49 
 
 		 473 aa  332  9e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.884369 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0001  chromosomal replication initiation protein  36.76 
 
 		 449 aa  332  1e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0001  chromosomal replication initiation protein  40.5 
 
 		 472 aa  332  1e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.583954  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0001  chromosomal replication initiation protein  38.51 
 
 		 460 aa  332  1e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000724276  unclonable  0.0000176 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0008  chromosomal replication initiation protein  38.51 
 
 		 460 aa  331  2e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0001  chromosomal replication initiation protein  40.04 
 
 		 472 aa  330  2e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0001  chromosomal replication initiation protein  38.51 
 
 		 460 aa  331  2e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000179736  unclonable  0.0000000000313535 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0001  chromosomal replication initiation protein  38.71 
 
 		 462 aa  330  3e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000998931  unclonable  0.00000000000343779 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0001  chromosomal replication initiation protein  38.71 
 
 		 462 aa  330  3e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000562887  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0001  chromosomal replication initiation protein  38.71 
 
 		 462 aa  330  3e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000157699  unclonable  0.0000121376 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0009  chromosomal replication initiation protein  38.51 
 
 		 460 aa  330  3e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000281375  unclonable  0.0000000000600935 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0001  chromosomal replication initiation protein  38.71 
 
 		 462 aa  330  3e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000257358  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0001  chromosomal replication initiation protein  38.21 
 
 		 461 aa  330  4e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000263579  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0001  chromosomal replication initiation protein  38.13 
 
 		 462 aa  330  5.0000000000000004e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000281438  unclonable  0.0000000118337 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0001  chromosomal replication initiation protein  37.69 
 
 		 458 aa  329  9e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000304436  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0001  chromosomal replication initiation protein  40.34 
 
 		 475 aa  328  1.0000000000000001e-88  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.216398 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0001  chromosomal replication initiation protein  40.42 
 
 		 475 aa  328  1.0000000000000001e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1227  chromosomal replication initiation protein  39.17 
 
 		 449 aa  327  4.0000000000000003e-88  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.174697  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0001  chromosomal replication initiation protein  39.71 
 
 		 472 aa  327  4.0000000000000003e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.206184  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0001  chromosomal replication initiation protein  37.31 
 
 		 460 aa  326  5e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0032  chromosomal replication initiation protein  38.92 
 
 		 463 aa  325  8.000000000000001e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000217775  normal  0.251102 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0001  chromosomal replication initiation protein  38.58 
 
 		 462 aa  325  9e-88  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000211976  n/a   
 
 
 
NC_009901  Spea_0001  chromosomal replication initiation protein  37.91 
 
 		 461 aa  325  9e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000102323  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0001  chromosomal replication initiation protein  39.8 
 
 		 501 aa  325  1e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4177  chromosomal replication initiation protein  39.22 
 
 		 462 aa  325  1e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510804  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4153  chromosomal replication initiation protein  39.22 
 
 		 462 aa  325  1e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  7.6269e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0001  chromosomal replication initiation protein  37.86 
 
 		 459 aa  325  1e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000781636  unclonable  0.00000344978 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0002  chromosomal replication initiation protein  39.8 
 
 		 501 aa  325  1e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.536334 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  39.22 
 
 		 462 aa  324  2e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.138659  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0001  chromosomal replication initiation protein  37.69 
 
 		 465 aa  325  2e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00156244  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0001  chromosomal replication initiation protein  38.84 
 
 		 465 aa  323  3e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00429077  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0001  chromosomal replication initiation protein  41.1 
 
 		 475 aa  323  3e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  37.77 
 
 		 464 aa  323  4e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00240104  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0001  chromosomal replication initiation protein  38.83 
 
 		 451 aa  323  4e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.000000764641  normal  0.435321 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0006  chromosomal replication initiation protein  37.47 
 
 		 462 aa  323  5e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000403403  unclonable  0.000000000136332 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0001  chromosomal replication initiation protein  40.05 
 
 		 450 aa  323  5e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000634969  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002009  chromosomal replication initiator protein dnaA  39.51 
 
 		 468 aa  323  5e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000552796  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0001  chromosomal replication initiation protein  37.96 
 
 		 461 aa  323  6e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000051  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00442  chromosomal replication initiation protein  39.29 
 
 		 468 aa  321  1.9999999999999998e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0002  chromosomal replication initiation protein  39.63 
 
 		 501 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  38.33 
 
 		 483 aa  321  1.9999999999999998e-86  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000328329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0001  chromosomal replication initiation protein  45.4 
 
 		 524 aa  320  3.9999999999999996e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0237228  normal  0.131634 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00010  chromosomal replication initiation protein  37.89 
 
 		 478 aa  320  3.9999999999999996e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.499294  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0001  chromosomal replication initiation protein  36.64 
 
 		 495 aa  319  6e-86  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5130  chromosomal replication initiation protein  38.54 
 
 		 467 aa  319  6e-86  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000558594  normal  0.0494414 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0001  chromosomal replication initiation protein  37.22 
 
 		 452 aa  319  7.999999999999999e-86  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0001  chromosomal replication initiation protein  37.22 
 
 		 452 aa  319  7.999999999999999e-86  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0001  chromosomal replication initiation protein  37.93 
 
 		 467 aa  319  7.999999999999999e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000185056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0013  chromosomal replication initiation protein  36.83 
 
 		 457 aa  319  9e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000224276  hitchhiker  0.000759559 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03585  chromosomal replication initiation protein  38.54 
 
 		 467 aa  318  1e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0183504  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  38.54 
 
 		 467 aa  318  1e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000136922  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0001  chromosomal replication initiation protein  37.19 
 
 		 451 aa  318  1e-85  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.000000000123931  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3915  chromosomal replication initiation protein  38.54 
 
 		 467 aa  318  1e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.000000126813  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4067  chromosomal replication initiation protein  38.54 
 
 		 467 aa  318  1e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000102031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0001  chromosomal replication initiation protein  37.39 
 
 		 452 aa  318  1e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.98376e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0001  chromosomal replication initiation protein  39.26 
 
 		 494 aa  318  1e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.852723  normal  0.138362 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0001  chromosomal replication initiation protein  37.19 
 
 		 451 aa  318  1e-85  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00187127  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03529  hypothetical protein  38.54 
 
 		 467 aa  318  1e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00951486  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4212  chromosomal replication initiation protein  38.54 
 
 		 467 aa  318  1e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000201887  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4223  chromosomal replication initiation protein  38.54 
 
 		 467 aa  317  2e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000066194  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0001  chromosomal replication initiation protein  39.96 
 
 		 499 aa  317  3e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00640124  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0259  chromosomal replication initiator protein DnaA  39.43 
 
 		 474 aa  317  3e-85  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.310271  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  37.03 
 
 		 474 aa  317  3e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00208216  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  37.28 
 
 		 461 aa  316  6e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.926832  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4230  chromosomal replication initiation protein  38.58 
 
 		 466 aa  316  7e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00725647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0001  chromosomal replication initiation protein  36.03 
 
 		 494 aa  316  7e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4050  chromosomal replication initiation protein  38.17 
 
 		 466 aa  315  9.999999999999999e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0553543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4123  chromosomal replication initiation protein  38.17 
 
 		 466 aa  315  9.999999999999999e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00889574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4172  chromosomal replication initiation protein  38.17 
 
 		 466 aa  315  9.999999999999999e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.049293  normal  0.324603 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4066  chromosomal replication initiation protein  38.17 
 
 		 466 aa  315  9.999999999999999e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000844177  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0009  chromosomal replication initiation protein  36.56 
 
 		 468 aa  310  5e-83  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00184157  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0001  chromosomal replication initiator protein, DnaA  36.54 
 
 		 449 aa  308  1.0000000000000001e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  36.94 
 
 		 470 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000133107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00002  Chromosomal replication initiator protein dnaA  43.92 
 
 		 533 aa  308  2.0000000000000002e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000917685  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  36.17 
 
 		 474 aa  308  2.0000000000000002e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0537995  normal  0.168321 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0001  chromosomal replication initiation protein  36.34 
 
 		 468 aa  307  3e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0688864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  35.36 
 
 		 475 aa  306  7e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.202829  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0001  chromosomal replication initiation protein  36.18 
 
 		 473 aa  306  7e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4144  chromosomal replication initiation protein  36.18 
 
 		 473 aa  306  7e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.274258 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>