More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0001 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_0001  chromosomal replication initiation protein  100 
 
 		 487 aa  984    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.775334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0003  chromosomal replication initiator protein DnaA  42.71 
 
 		 519 aa  351  2e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000118183  unclonable  1.2245600000000001e-24 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3373  chromosomal replication initiation protein  41.42 
 
 		 460 aa  345  1e-93  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2833  chromosomal replication initiation protein  41.47 
 
 		 448 aa  342  9e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0001  chromosomal replication initiation protein  40.91 
 
 		 482 aa  340  4e-92  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0001  chromosomal replication initiation protein  40.78 
 
 		 509 aa  337  3.9999999999999995e-91  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0001  chromosomal replication initiation protein  40.26 
 
 		 470 aa  332  1e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0703594  normal  0.628106 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0001  chromosomal replication initiation protein  40.8 
 
 		 477 aa  332  1e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.839498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0002  chromosomal replication initiation protein  41.04 
 
 		 461 aa  330  5.0000000000000004e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.020385  hitchhiker  0.000000603983 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  40.73 
 
 		 482 aa  325  1e-87  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000460391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0001  chromosomal replication initiation protein  47.09 
 
 		 475 aa  323  4e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1342  chromosomal replication initiation protein  41.02 
 
 		 455 aa  322  9.000000000000001e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0011  chromosomal replication initiation protein  41.02 
 
 		 455 aa  322  9.000000000000001e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0270  chromosomal replication initiation protein  36.07 
 
 		 452 aa  315  9e-85  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.43885  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0809  chromosomal replication initiation protein  35.46 
 
 		 464 aa  311  2e-83  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.54082  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  40.87 
 
 		 477 aa  310  5e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0001  chromosomal replication initiation protein  34.82 
 
 		 460 aa  309  9e-83  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.335135  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0001  chromosomal replication initiation protein  40.76 
 
 		 473 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.884369 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0001  chromosomal replication initiation protein  40.47 
 
 		 475 aa  307  3e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.216398 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0001  chromosomal replication initiation protein  38.78 
 
 		 479 aa  307  3e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0301114  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  36.85 
 
 		 461 aa  306  5.0000000000000004e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.926832  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0001  chromosomal replication initiation protein  39.54 
 
 		 475 aa  305  1.0000000000000001e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0001  chromosomal replication initiation protein  40.21 
 
 		 472 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.583954  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0001  chromosomal replication initiation protein  39.79 
 
 		 472 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.206184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0002  chromosomal replication initiation protein  40.5 
 
 		 498 aa  303  6.000000000000001e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0001  chromosomal replication initiation protein  39.96 
 
 		 472 aa  302  1e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0001  chromosomal replication initiation protein  40.63 
 
 		 475 aa  301  2e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0008  chromosomal replication initiation protein  37.53 
 
 		 460 aa  300  5e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0001  chromosomal replication initiation protein  37.31 
 
 		 460 aa  299  6e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000179736  unclonable  0.0000000000313535 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0006  chromosomal replication initiation protein  37.02 
 
 		 462 aa  299  7e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000403403  unclonable  0.000000000136332 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0001  chromosomal replication initiation protein  37.31 
 
 		 460 aa  299  1e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000724276  unclonable  0.0000176 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0009  chromosomal replication initiation protein  37.31 
 
 		 460 aa  298  1e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000281375  unclonable  0.0000000000600935 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0001  chromosomal replication initiation protein  36.29 
 
 		 452 aa  298  2e-79  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0001  chromosomal replication initiation protein  36.29 
 
 		 452 aa  298  2e-79  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4153  chromosomal replication initiation protein  37.61 
 
 		 462 aa  298  2e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  7.6269e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4177  chromosomal replication initiation protein  37.61 
 
 		 462 aa  298  2e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510804  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0001  chromosomal replication initiation protein  37.69 
 
 		 461 aa  297  2e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000102323  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4223  chromosomal replication initiation protein  37 
 
 		 467 aa  296  5e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000066194  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03585  chromosomal replication initiation protein  37 
 
 		 467 aa  296  6e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0183504  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  37 
 
 		 467 aa  296  6e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000136922  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03529  hypothetical protein  37 
 
 		 467 aa  296  6e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00951486  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4212  chromosomal replication initiation protein  37 
 
 		 467 aa  296  6e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000201887  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3915  chromosomal replication initiation protein  37 
 
 		 467 aa  296  6e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.000000126813  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5130  chromosomal replication initiation protein  37 
 
 		 467 aa  296  6e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000558594  normal  0.0494414 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0001  chromosomal replication initiation protein  36.75 
 
 		 467 aa  296  6e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000185056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4067  chromosomal replication initiation protein  37 
 
 		 467 aa  296  6e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000102031  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  38.09 
 
 		 462 aa  296  7e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.138659  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  37.02 
 
 		 483 aa  295  1e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000328329  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  38.4 
 
 		 464 aa  295  1e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00240104  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0001  chromosomal replication initiation protein  37.34 
 
 		 461 aa  295  1e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000051  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4230  chromosomal replication initiation protein  37.08 
 
 		 466 aa  295  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00725647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4172  chromosomal replication initiation protein  36.86 
 
 		 466 aa  295  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.049293  normal  0.324603 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4123  chromosomal replication initiation protein  36.86 
 
 		 466 aa  295  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00889574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4050  chromosomal replication initiation protein  36.86 
 
 		 466 aa  295  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0553543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0001  chromosomal replication initiation protein  37.1 
 
 		 461 aa  295  1e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000263579  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4066  chromosomal replication initiation protein  36.86 
 
 		 466 aa  295  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000844177  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0001  chromosomal replication initiation protein  37.26 
 
 		 465 aa  295  2e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00156244  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0001  chromosomal replication initiation protein  37.29 
 
 		 465 aa  294  2e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00429077  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0001  chromosomal replication initiation protein  37.05 
 
 		 462 aa  294  3e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000281438  unclonable  0.0000000118337 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0001  chromosomal replication initiation protein  37.31 
 
 		 451 aa  294  3e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.000000764641  normal  0.435321 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0001  chromosomal replication initiation protein  37.83 
 
 		 450 aa  293  4e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000634969  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0032  chromosomal replication initiation protein  36.54 
 
 		 463 aa  293  4e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000217775  normal  0.251102 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0001  chromosomal replication initiation protein  37.02 
 
 		 462 aa  293  5e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000562887  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0001  chromosomal replication initiation protein  37.02 
 
 		 462 aa  293  5e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000998931  unclonable  0.00000000000343779 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0001  chromosomal replication initiation protein  37.02 
 
 		 462 aa  293  5e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000157699  unclonable  0.0000121376 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0001  chromosomal replication initiation protein  37.02 
 
 		 462 aa  293  5e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000257358  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0001  chromosomal replication initiation protein  36.52 
 
 		 459 aa  293  6e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000781636  unclonable  0.00000344978 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0002  chromosomal replication initiation protein  40.86 
 
 		 501 aa  292  1e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1279  chromosomal replication initiation protein  37.07 
 
 		 524 aa  291  2e-77  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000504678  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0001  chromosomal replication initiation protein  36.52 
 
 		 462 aa  291  2e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000211976  n/a   
 
 
 
NC_008700  Sama_0013  chromosomal replication initiation protein  36.81 
 
 		 457 aa  290  4e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000224276  hitchhiker  0.000759559 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0001  chromosomal replication initiation protein  40.66 
 
 		 501 aa  288  2e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0002  chromosomal replication initiation protein  40.66 
 
 		 501 aa  288  2e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.536334 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0001  chromosomal replication initiation protein  36.58 
 
 		 455 aa  287  2.9999999999999996e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.632445  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  35.83 
 
 		 474 aa  286  7e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00208216  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3033  chromosomal replication initiator protein DnaA  35.85 
 
 		 442 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.949168  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0259  chromosomal replication initiator protein DnaA  33.76 
 
 		 474 aa  285  1.0000000000000001e-75  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.310271  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2507  chromosomal replication initiation protein  35.5 
 
 		 472 aa  285  1.0000000000000001e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000251721  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0001  chromosomal replication initiation protein  33.53 
 
 		 495 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  33.08 
 
 		 516 aa  283  4.0000000000000003e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000003522  unclonable  0.00000000000722922 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0001  chromosomal replication initiation protein  35.19 
 
 		 451 aa  282  8.000000000000001e-75  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.000000000123931  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0001  chromosomal replication initiation protein  35.19 
 
 		 451 aa  282  8.000000000000001e-75  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00187127  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0001  chromosomal replication initiation protein  37.75 
 
 		 516 aa  281  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.962631  hitchhiker  0.00495499 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0001  chromosomal replication initiation protein  46.7 
 
 		 494 aa  281  2e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.852723  normal  0.138362 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0001  chromosomal replication initiation protein  34.18 
 
 		 450 aa  281  2e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000447845  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  37.34 
 
 		 455 aa  280  4e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.738178 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00442  chromosomal replication initiation protein  35.04 
 
 		 468 aa  279  6e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002009  chromosomal replication initiator protein dnaA  35.04 
 
 		 468 aa  279  8e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000552796  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0009  chromosomal replication initiation protein  36.21 
 
 		 468 aa  279  1e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00184157  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0001  chromosomal replication initiation protein  33.62 
 
 		 450 aa  278  2e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  32.84 
 
 		 453 aa  277  3e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000208022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  35.52 
 
 		 467 aa  277  4e-73  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000009849  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0001  chromosomal replication initiation protein  37.37 
 
 		 506 aa  276  4e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0001  chromosomal replication initiation protein  33.91 
 
 		 446 aa  276  5e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000325337  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0001  chromosomal replication initiation protein  34.27 
 
 		 446 aa  276  6e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000594007  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0391  chromosomal replication initiation protein  36.46 
 
 		 524 aa  276  6e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.246214  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0001  chromosomal replication initiation protein  34.27 
 
 		 446 aa  276  6e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000184902  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0001  chromosomal replication initiation protein  37.42 
 
 		 516 aa  276  7e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0192779 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1227  chromosomal replication initiation protein  37.09 
 
 		 449 aa  276  9e-73  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.174697  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0003  chromosomal replication initiation protein  36.59 
 
 		 510 aa  276  9e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  unclonable  0.0000000244231  normal  0.247706 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>