87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1203 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_1203  hypothetical protein  100 
 
 		 128 aa  260  3e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0894  DnaA related protein  50.5 
 
 		 128 aa  80.1  0.000000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0568885  normal  0.192838 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0073  chromosomal replication initiator DnaA domain-containing protein  50 
 
 		 130 aa  74.3  0.0000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.716218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0873  chromosomal replication initiator, DnaA-like  43.04 
 
 		 141 aa  70.9  0.000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0961379  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2688  hypothetical protein  41.25 
 
 		 150 aa  68.2  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.259184  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0571  hypothetical protein  37.23 
 
 		 151 aa  67.4  0.00000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0572  hypothetical protein  36.46 
 
 		 151 aa  65.9  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0875  chromosomal replication initiator DnaA domain-containing protein  35.19 
 
 		 136 aa  63.5  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.386631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2226  DNA replication initiation ATPase  45.07 
 
 		 330 aa  63.2  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.000024836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1775  chromosomal replication initiator, DnaA-like  35.87 
 
 		 131 aa  60.5  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.141537  normal  0.0422167 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1287  hypothetical protein  37.76 
 
 		 121 aa  58.5  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  37.18 
 
 		 447 aa  49.7  0.00001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0001  chromosomal replication initiation protein  36.79 
 
 		 512 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00010  chromosomal replication initiation protein  36.79 
 
 		 514 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.373198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00002  Chromosomal replication initiator protein dnaA  41.89 
 
 		 533 aa  45.1  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000917685  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0001  chromosomal replication initiation protein  35.85 
 
 		 494 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0001  chromosomal replication initiation protein  35.78 
 
 		 524 aa  44.7  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0237228  normal  0.131634 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2507  chromosomal replication initiation protein  41.33 
 
 		 472 aa  44.3  0.0005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000251721  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  34.44 
 
 		 444 aa  44.3  0.0005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002009  chromosomal replication initiator protein dnaA  41.33 
 
 		 468 aa  44.3  0.0006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000552796  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0001  chromosomal replication initiation protein  41.33 
 
 		 465 aa  44.3  0.0006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00429077  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00442  chromosomal replication initiation protein  41.33 
 
 		 468 aa  44.3  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0001  chromosomal replication initiation protein  41.33 
 
 		 465 aa  44.3  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00156244  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  41.33 
 
 		 467 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000136922  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4153  chromosomal replication initiation protein  41.33 
 
 		 462 aa  43.9  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  7.6269e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3915  chromosomal replication initiation protein  41.33 
 
 		 467 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.000000126813  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4212  chromosomal replication initiation protein  41.33 
 
 		 467 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000201887  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0032  chromosomal replication initiation protein  41.33 
 
 		 463 aa  43.9  0.0007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000217775  normal  0.251102 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4177  chromosomal replication initiation protein  41.33 
 
 		 462 aa  43.9  0.0007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510804  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03529  hypothetical protein  41.33 
 
 		 467 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00951486  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  41.33 
 
 		 462 aa  43.9  0.0007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.138659  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0001  chromosomal replication initiation protein  41.33 
 
 		 450 aa  43.9  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000634969  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0001  chromosomal replication initiation protein  41.33 
 
 		 467 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000185056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4067  chromosomal replication initiation protein  41.33 
 
 		 467 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000102031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4223  chromosomal replication initiation protein  41.33 
 
 		 467 aa  43.9  0.0007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000066194  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5130  chromosomal replication initiation protein  41.33 
 
 		 467 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000558594  normal  0.0494414 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03585  chromosomal replication initiation protein  41.33 
 
 		 467 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0183504  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4123  chromosomal replication initiation protein  41.33 
 
 		 466 aa  43.9  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00889574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4172  chromosomal replication initiation protein  41.33 
 
 		 466 aa  43.9  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.049293  normal  0.324603 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4050  chromosomal replication initiation protein  41.33 
 
 		 466 aa  43.9  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0553543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  41.33 
 
 		 483 aa  43.9  0.0008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000328329  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  41.33 
 
 		 464 aa  43.9  0.0008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00240104  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4066  chromosomal replication initiation protein  41.33 
 
 		 466 aa  43.9  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000844177  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4230  chromosomal replication initiation protein  41.33 
 
 		 466 aa  43.9  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00725647  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00010  chromosomal replication initiation protein  35.85 
 
 		 478 aa  43.5  0.0009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.499294  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  36.46 
 
 		 470 aa  43.5  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000133107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0001  chromosomal replication initiation protein  37.5 
 
 		 450 aa  43.5  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000322878  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  35.56 
 
 		 454 aa  42.4  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000331762  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0001  chromosomal replication initiation protein  33.96 
 
 		 511 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.424003  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  33.96 
 
 		 511 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0002  chromosomal replication initiator protein DnaA  33.71 
 
 		 520 aa  42.7  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00000222997  hitchhiker  0.00000014852 
 
 
-
 
NC_002620  TC0547  chromosomal replication initiation protein  32.1 
 
 		 455 aa  42.7  0.002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0003  chromosomal replication initiation protein  33.96 
 
 		 510 aa  42  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0001  chromosomal replication initiation protein  32 
 
 		 495 aa  42  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  36.46 
 
 		 461 aa  41.6  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.926832  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0001  chromosomal replication initiation protein  31.53 
 
 		 510 aa  41.6  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000451615 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0001  chromosomal replication initiation protein  33.33 
 
 		 507 aa  41.6  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00366311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3714  chromosomal replication initiator protein DnaA  38.81 
 
 		 458 aa  41.6  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0883513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0001  chromosomal replication initiation protein  33.33 
 
 		 511 aa  41.2  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0001  chromosomal replication initiation protein  33.33 
 
 		 505 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.390724  normal  0.0464489 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1100  chromosomal replication initiation protein  27.27 
 
 		 482 aa  40.8  0.006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.018395 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0009  chromosomal replication initiation protein  38.67 
 
 		 468 aa  40.8  0.006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00184157  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0010  chromosomal replication initiation protein  33.33 
 
 		 506 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.645293  hitchhiker  0.0000364152 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  33.33 
 
 		 490 aa  40.8  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.428353  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0001  chromosomal replication initiation protein  38.67 
 
 		 462 aa  40.8  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000281438  unclonable  0.0000000118337 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  32.32 
 
 		 450 aa  40.8  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000842824  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  40 
 
 		 474 aa  40.8  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00208216  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0013  chromosomal replication initiation protein  41.07 
 
 		 457 aa  40.8  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000224276  hitchhiker  0.000759559 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0003  chromosomal replication initiation protein  36.14 
 
 		 510 aa  40.8  0.007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  unclonable  0.0000000244231  normal  0.247706 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0008  chromosomal replication initiation protein  37.84 
 
 		 460 aa  40.4  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0009  chromosomal replication initiation protein  37.84 
 
 		 460 aa  40.4  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000281375  unclonable  0.0000000000600935 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0006  chromosomal replication initiation protein  38.67 
 
 		 462 aa  40.8  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000403403  unclonable  0.000000000136332 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0001  chromosomal replication initiation protein  37.84 
 
 		 462 aa  40.4  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000157699  unclonable  0.0000121376 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0001  chromosomal replication initiation protein  37.84 
 
 		 461 aa  40.4  0.008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000263579  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0001  chromosomal replication initiation protein  37.84 
 
 		 462 aa  40.4  0.008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000998931  unclonable  0.00000000000343779 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0001  chromosomal replication initiation protein  37.84 
 
 		 460 aa  40.4  0.008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000724276  unclonable  0.0000176 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0001  chromosomal replication initiation protein  37.84 
 
 		 460 aa  40.4  0.008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000179736  unclonable  0.0000000000313535 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0001  chromosomal replication initiation protein  31.53 
 
 		 467 aa  40.4  0.008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.720821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0001  chromosomal replication initiation protein  37.84 
 
 		 462 aa  40.4  0.008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000211976  n/a   
 
 
 
NC_009052  Sbal_0001  chromosomal replication initiation protein  37.84 
 
 		 462 aa  40.4  0.008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000257358  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0001  chromosomal replication initiation protein  37.84 
 
 		 462 aa  40.4  0.008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000562887  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0001  chromosomal replication initiation protein  37.84 
 
 		 461 aa  40.4  0.008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000051  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0002  chromosomal replication initiator protein DnaA  35.05 
 
 		 470 aa  40.4  0.008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000188551  unclonable  0.000000000472438 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0001  chromosomal replication initiation protein  31.3 
 
 		 453 aa  40.4  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.101414  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0001  chromosomal replication initiation protein  31.3 
 
 		 453 aa  40.4  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000795473  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  36.11 
 
 		 469 aa  40  0.01  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000259143  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  36.26 
 
 		 566 aa  40  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.0000150843  normal  0.201816 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>