96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_2093 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_1757  hypothetical protein  100 
 
 
94 aa  192  2e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2093  protein of unknown function DUF497  100 
 
 
94 aa  192  2e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.177613  normal  0.105621 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1537  protein of unknown function DUF497  91.49 
 
 
94 aa  177  4.999999999999999e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0179855 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3087  protein of unknown function DUF497  42.53 
 
 
92 aa  77.4  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3033  protein of unknown function DUF497  42.53 
 
 
92 aa  77.4  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.692737  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1486  hypothetical protein  50 
 
 
94 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1034  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1764  protein of unknown function DUF497  50 
 
 
94 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.324756  normal  0.194696 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4512  protein of unknown function DUF497  46.51 
 
 
97 aa  67.4  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1353  hypothetical protein  45.05 
 
 
97 aa  66.6  0.0000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00336561  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3974  hypothetical protein  40.22 
 
 
115 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.789792  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0927  protein of unknown function DUF497  43.82 
 
 
89 aa  63.9  0.0000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.317041 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1969  protein of unknown function DUF497  45.24 
 
 
92 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2438  protein of unknown function DUF497  44.19 
 
 
88 aa  61.6  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3748  protein of unknown function DUF497  46.51 
 
 
92 aa  62  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5046  hypothetical protein  44.83 
 
 
92 aa  61.2  0.000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.896322  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1715  protein of unknown function DUF497  38.2 
 
 
93 aa  61.2  0.000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.643907  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0265  protein of unknown function DUF497  39.33 
 
 
90 aa  60.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1996  protein of unknown function DUF497  44.05 
 
 
92 aa  60.1  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.80933  normal  0.0698328 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3672  protein of unknown function DUF497  43.02 
 
 
88 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1490  hypothetical protein  45.95 
 
 
89 aa  58.9  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.755193  normal  0.548062 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0665  hypothetical protein  43.96 
 
 
95 aa  59.3  0.00000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.45959  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3823  hypothetical protein  43.02 
 
 
92 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0126375  normal  0.293452 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2884  hypothetical protein  43.16 
 
 
115 aa  58.9  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.443981  normal  0.0702268 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0188  hypothetical protein  50 
 
 
101 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5048  protein of unknown function DUF497  41.38 
 
 
91 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.127602 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0092  hypothetical protein  44.19 
 
 
93 aa  57.4  0.00000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.978778 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6777  protein of unknown function DUF497  40.91 
 
 
97 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0610097  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1315  protein of unknown function DUF497  43.82 
 
 
93 aa  55.8  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000162456 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1009  hypothetical protein  40.91 
 
 
91 aa  55.5  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2414  hypothetical protein  43.82 
 
 
93 aa  54.3  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.653132  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2045  protein of unknown function DUF497  43.82 
 
 
93 aa  54.3  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.242597  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0914  protein of unknown function DUF497  37.21 
 
 
106 aa  54.3  0.0000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0155  hypothetical protein  41.86 
 
 
95 aa  53.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.465237  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2070  hypothetical protein  36.67 
 
 
90 aa  52.8  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00017339  hitchhiker  0.0000419311 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0832  hypothetical protein  39.78 
 
 
98 aa  53.5  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000000167324  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3951  protein of unknown function DUF497  37.93 
 
 
91 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.258424  hitchhiker  0.00220511 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1103  hypothetical protein  37.5 
 
 
96 aa  52.4  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0124894  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1354  hypothetical protein  36.05 
 
 
90 aa  52.4  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00877367  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2051  hypothetical protein  40.23 
 
 
102 aa  52.8  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4530  hypothetical protein  39.53 
 
 
92 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1052  protein of unknown function DUF497  36.26 
 
 
106 aa  52  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238312 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2952  hypothetical protein  40 
 
 
98 aa  52  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000403961 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1380  hypothetical protein  39.53 
 
 
92 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.26403  normal  0.829125 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1105  hypothetical protein  38.46 
 
 
93 aa  51.6  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3100  hypothetical protein  33.33 
 
 
92 aa  52  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3339  hypothetical protein  40 
 
 
92 aa  51.6  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.261034  normal  0.0313812 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1055  hypothetical protein  37.21 
 
 
88 aa  51.2  0.000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0177574  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5052  protein of unknown function DUF497  39.08 
 
 
94 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.174132 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2221  protein of unknown function DUF497  36.36 
 
 
97 aa  50.8  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000287405  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1491  hypothetical protein  37.93 
 
 
97 aa  50.4  0.000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2295  hypothetical protein  37.35 
 
 
83 aa  50.4  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0555295  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2272  hypothetical protein  42.53 
 
 
99 aa  50.4  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7347  protein of unknown function DUF497  40.23 
 
 
93 aa  50.4  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.155028  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3563  protein of unknown function DUF497  37.78 
 
 
101 aa  50.1  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0533639 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0788  hypothetical protein  38.2 
 
 
88 aa  49.7  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1507  hypothetical protein  38.82 
 
 
93 aa  49.7  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.32717  normal  0.158421 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4438  protein of unknown function DUF497  40 
 
 
92 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0714  hypothetical protein  39.77 
 
 
125 aa  49.7  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0074508  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1701  protein of unknown function DUF497  37.36 
 
 
92 aa  49.3  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.133917 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1040  hypothetical protein  34.88 
 
 
89 aa  48.5  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.138821  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2869  hypothetical protein  31.87 
 
 
117 aa  48.5  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0108538  normal 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_7363  hypothetical protein  36.36 
 
 
96 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0640425  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2631  hypothetical protein  33.72 
 
 
92 aa  48.1  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.268896  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1006  hypothetical protein  32.56 
 
 
90 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.779657  normal  0.61 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3971  protein of unknown function DUF497  51.85 
 
 
78 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00101642 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0226  protein of unknown function DUF497  32.18 
 
 
86 aa  47.4  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.115808  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1184  protein of unknown function DUF497  32.94 
 
 
90 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.030767  normal  0.28927 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0435  putative toxin-antitoxin system, toxin component  30.59 
 
 
91 aa  46.6  0.0001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000190302 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2272  protein of unknown function DUF497  37.93 
 
 
94 aa  47  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.754948  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2639  hypothetical protein  35.62 
 
 
97 aa  46.2  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0754679  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1331  hypothetical protein  37.21 
 
 
86 aa  45.4  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.600585  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2483  hypothetical protein  37.36 
 
 
99 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3765  hypothetical protein  34.25 
 
 
93 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3787  hypothetical protein  31.46 
 
 
90 aa  45.4  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.327341  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1360  hypothetical protein  34.12 
 
 
89 aa  45.1  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.51188  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1213  hypothetical protein  41.38 
 
 
83 aa  45.4  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.319817 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2478  hypothetical protein  40.85 
 
 
88 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.513735  normal  0.240444 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2135  hypothetical protein  35.16 
 
 
99 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.000237812  normal  0.0140128 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0085  hypothetical protein  36 
 
 
102 aa  44.7  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0658  hypothetical protein  38.2 
 
 
97 aa  44.7  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.724327  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4942  hypothetical protein  37.78 
 
 
93 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0131  hypothetical cytosolic protein  34.09 
 
 
97 aa  43.1  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1807  hypothetical protein  33.72 
 
 
110 aa  42.7  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.729301  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3634  hypothetical protein  32.14 
 
 
96 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.20528  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1635  hypothetical protein  38.54 
 
 
95 aa  42.4  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1112  protein of unknown function DUF497  36.56 
 
 
101 aa  42.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.402358  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3908  hypothetical protein  36.17 
 
 
102 aa  42.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3226  protein of unknown function DUF497  37.97 
 
 
95 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.720273  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31950  hypothetical protein  34.52 
 
 
89 aa  41.6  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1479  hypothetical protein  31.46 
 
 
105 aa  41.6  0.003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0124462  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2195  hypothetical protein  32.95 
 
 
97 aa  41.6  0.004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2521  hypothetical protein  42.62 
 
 
64 aa  41.2  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.789328  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1098  hypothetical protein  36.9 
 
 
97 aa  40.8  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.826789  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4127  protein of unknown function DUF497  34.78 
 
 
99 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.186992  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3295  protein of unknown function DUF497  35.79 
 
 
103 aa  40.8  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.840265  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5033  hypothetical protein  36.17 
 
 
105 aa  40.4  0.008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.659592  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>