64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_1331 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_1331  hypothetical protein  100 
 
 		 86 aa  179  1e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.600585  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1055  hypothetical protein  96.59 
 
 		 88 aa  173  8e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0177574  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3339  hypothetical protein  58.7 
 
 		 92 aa  96.7  9e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.261034  normal  0.0313812 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3100  hypothetical protein  46.59 
 
 		 92 aa  80.5  0.000000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2070  hypothetical protein  49.41 
 
 		 90 aa  77.8  0.00000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00017339  hitchhiker  0.0000419311 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2295  hypothetical protein  49.4 
 
 		 83 aa  75.5  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0555295  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1701  protein of unknown function DUF497  45.98 
 
 		 92 aa  75.1  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.133917 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1040  hypothetical protein  43.68 
 
 		 89 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.138821  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3634  hypothetical protein  43.37 
 
 		 96 aa  73.2  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.20528  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2869  hypothetical protein  43.18 
 
 		 117 aa  73.2  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0108538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1184  protein of unknown function DUF497  46.91 
 
 		 90 aa  72  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.030767  normal  0.28927 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1152  hypothetical protein  44.83 
 
 		 98 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.231422 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0083  hypothetical protein  38.55 
 
 		 87 aa  57  0.00000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0265  protein of unknown function DUF497  37.93 
 
 		 90 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1213  hypothetical protein  42.35 
 
 		 83 aa  54.3  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.319817 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2523  protein of unknown function DUF497  38.55 
 
 		 87 aa  53.9  0.0000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1354  hypothetical protein  40.7 
 
 		 90 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00877367  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3823  hypothetical protein  36.05 
 
 		 92 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0126375  normal  0.293452 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1486  hypothetical protein  37.21 
 
 		 94 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00610  hypothetical protein  35.71 
 
 		 87 aa  53.1  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1764  protein of unknown function DUF497  37.21 
 
 		 94 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.324756  normal  0.194696 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0542  hypothetical protein  49.02 
 
 		 85 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.926039  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3262  protein of unknown function DUF497  35.29 
 
 		 90 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000202958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0226  protein of unknown function DUF497  36.47 
 
 		 86 aa  51.2  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.115808  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4530  hypothetical protein  36.05 
 
 		 92 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1380  hypothetical protein  36.05 
 
 		 92 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.26403  normal  0.829125 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_7392  hypothetical protein  37.21 
 
 		 90 aa  49.7  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0339543  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3748  protein of unknown function DUF497  39.08 
 
 		 92 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1887  hypothetical protein  33.73 
 
 		 111 aa  48.9  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.584015  normal  0.325304 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3033  protein of unknown function DUF497  36.47 
 
 		 92 aa  48.9  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.692737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3087  protein of unknown function DUF497  36.47 
 
 		 92 aa  48.9  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1969  protein of unknown function DUF497  35.37 
 
 		 92 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1723  protein of unknown function DUF497  35.29 
 
 		 90 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.14899  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1641  hypothetical protein, putative phage gene  31.76 
 
 		 87 aa  46.6  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.248324  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1006  hypothetical protein  32.56 
 
 		 90 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.779657  normal  0.61 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2884  hypothetical protein  34.48 
 
 		 115 aa  45.4  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.443981  normal  0.0702268 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1996  protein of unknown function DUF497  34.15 
 
 		 92 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.80933  normal  0.0698328 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2093  protein of unknown function DUF497  37.21 
 
 		 94 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.177613  normal  0.105621 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1757  hypothetical protein  37.21 
 
 		 94 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0452  hypothetical protein  34.52 
 
 		 87 aa  45.4  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0841161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3787  hypothetical protein  34.88 
 
 		 90 aa  45.8  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.327341  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3226  protein of unknown function DUF497  35.14 
 
 		 95 aa  44.3  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.720273  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1494  hypothetical protein  33.72 
 
 		 90 aa  43.9  0.0007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.334778 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_7363  hypothetical protein  37.66 
 
 		 96 aa  43.9  0.0007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0640425  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0435  putative toxin-antitoxin system, toxin component  29.89 
 
 		 91 aa  43.5  0.0009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000190302 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0581  hypothetical protein  31.76 
 
 		 86 aa  43.5  0.0009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2135  hypothetical protein  35.23 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.000237812  normal  0.0140128 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0832  hypothetical protein  36.78 
 
 		 98 aa  43.5  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000000167324  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0788  hypothetical protein  28.57 
 
 		 88 aa  43.5  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0155  hypothetical protein  38.1 
 
 		 95 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.465237  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3974  hypothetical protein  34.94 
 
 		 115 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.789792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0188  hypothetical protein  36.78 
 
 		 101 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1009  hypothetical protein  37.5 
 
 		 91 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5046  hypothetical protein  31.76 
 
 		 92 aa  41.6  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.896322  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3295  protein of unknown function DUF497  36.36 
 
 		 103 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.840265  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3499  hypothetical protein  41.43 
 
 		 83 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.41867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0927  protein of unknown function DUF497  33.33 
 
 		 89 aa  42  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.317041 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7347  protein of unknown function DUF497  36.25 
 
 		 93 aa  41.6  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.155028  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0665  hypothetical protein  32.94 
 
 		 95 aa  41.6  0.004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.45959  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2631  hypothetical protein  33.33 
 
 		 92 aa  41.6  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.268896  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2002  protein of unknown function DUF497  32.1 
 
 		 101 aa  41.6  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.145016  hitchhiker  0.000000154329 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2521  hypothetical protein  48.98 
 
 		 64 aa  41.2  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.789328  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3672  protein of unknown function DUF497  28.21 
 
 		 88 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2438  protein of unknown function DUF497  34.18 
 
 		 88 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>