46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_7392 on replicon NC_007490
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007490  RSP_7392  hypothetical protein  100 
 
 		 90 aa  187  5e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0339543  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3787  hypothetical protein  70 
 
 		 90 aa  133  6.0000000000000005e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.327341  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0226  protein of unknown function DUF497  43.18 
 
 		 86 aa  69.3  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.115808  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1132  hypothetical protein  37.5 
 
 		 90 aa  61.2  0.000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0175216  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1360  hypothetical protein  37.8 
 
 		 89 aa  61.2  0.000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.51188  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3033  protein of unknown function DUF497  36.36 
 
 		 92 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.692737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3087  protein of unknown function DUF497  36.36 
 
 		 92 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2523  protein of unknown function DUF497  41.67 
 
 		 87 aa  56.6  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1055  hypothetical protein  38.37 
 
 		 88 aa  56.2  0.0000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0177574  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0581  hypothetical protein  38.64 
 
 		 86 aa  55.5  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1641  hypothetical protein, putative phage gene  38.1 
 
 		 87 aa  55.5  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.248324  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1491  hypothetical protein  34.88 
 
 		 97 aa  53.9  0.0000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0452  hypothetical protein  39.29 
 
 		 87 aa  52.8  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0841161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7347  protein of unknown function DUF497  42.86 
 
 		 93 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.155028  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0083  hypothetical protein  38.64 
 
 		 87 aa  50.8  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00610  hypothetical protein  36.9 
 
 		 87 aa  50.8  0.000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0410  hypothetical protein  39.19 
 
 		 87 aa  50.1  0.000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1331  hypothetical protein  37.21 
 
 		 86 aa  49.7  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.600585  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2070  hypothetical protein  34.88 
 
 		 90 aa  50.1  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00017339  hitchhiker  0.0000419311 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0435  putative toxin-antitoxin system, toxin component  31.4 
 
 		 91 aa  48.9  0.00002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000190302 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0265  protein of unknown function DUF497  34.78 
 
 		 90 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2295  hypothetical protein  35.37 
 
 		 83 aa  48.5  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0555295  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0832  hypothetical protein  32.18 
 
 		 98 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000000167324  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2002  protein of unknown function DUF497  38.27 
 
 		 101 aa  47.8  0.00005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.145016  hitchhiker  0.000000154329 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1103  hypothetical protein  32.84 
 
 		 96 aa  47.8  0.00006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0124894  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1701  protein of unknown function DUF497  38.55 
 
 		 92 aa  47.4  0.00008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.133917 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1040  hypothetical protein  32.95 
 
 		 89 aa  47  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.138821  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1723  protein of unknown function DUF497  38.1 
 
 		 90 aa  45.4  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.14899  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3339  hypothetical protein  34.04 
 
 		 92 aa  45.1  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.261034  normal  0.0313812 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3974  hypothetical protein  37.65 
 
 		 115 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.789792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0665  hypothetical protein  32.22 
 
 		 95 aa  44.7  0.0005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.45959  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2051  hypothetical protein  30.59 
 
 		 102 aa  43.9  0.0007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3634  hypothetical protein  29.35 
 
 		 96 aa  43.9  0.0008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.20528  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1494  hypothetical protein  34.15 
 
 		 90 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.334778 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0286  hypothetical protein  35.19 
 
 		 58 aa  43.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_7363  hypothetical protein  33.78 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0640425  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31950  hypothetical protein  34.52 
 
 		 89 aa  43.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3262  protein of unknown function DUF497  35.96 
 
 		 90 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000202958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1764  protein of unknown function DUF497  32.53 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.324756  normal  0.194696 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1715  protein of unknown function DUF497  29.89 
 
 		 93 aa  42.7  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.643907  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2952  hypothetical protein  32.53 
 
 		 98 aa  42.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000403961 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1486  hypothetical protein  32.53 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0788  hypothetical protein  32.58 
 
 		 88 aa  42  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1717  hypothetical protein  32.58 
 
 		 102 aa  41.2  0.005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2884  hypothetical protein  28.89 
 
 		 115 aa  40.4  0.007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.443981  normal  0.0702268 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3672  protein of unknown function DUF497  33.71 
 
 		 88 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>