61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1006 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1006  hypothetical protein  100 
 
 
90 aa  186  1e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.779657  normal  0.61 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2631  hypothetical protein  63.22 
 
 
92 aa  114  3e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.268896  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1354  hypothetical protein  61.63 
 
 
90 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00877367  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4929  protein of unknown function DUF497  53.49 
 
 
92 aa  92.8  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2263  hypothetical protein  52.94 
 
 
93 aa  87.4  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.486123 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1887  hypothetical protein  48.24 
 
 
111 aa  80.5  0.000000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.584015  normal  0.325304 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2437  hypothetical protein  46.15 
 
 
95 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0403567 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2070  hypothetical protein  42.35 
 
 
90 aa  75.1  0.0000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00017339  hitchhiker  0.0000419311 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3634  hypothetical protein  40 
 
 
96 aa  72  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.20528  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2295  hypothetical protein  40.96 
 
 
83 aa  70.5  0.000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0555295  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1040  hypothetical protein  40 
 
 
89 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.138821  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0927  protein of unknown function DUF497  37.65 
 
 
89 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.317041 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1701  protein of unknown function DUF497  34.09 
 
 
92 aa  64.3  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.133917 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2884  hypothetical protein  42.53 
 
 
115 aa  63.2  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.443981  normal  0.0702268 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3339  hypothetical protein  37.78 
 
 
92 aa  62.4  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.261034  normal  0.0313812 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4438  protein of unknown function DUF497  35.96 
 
 
92 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3100  hypothetical protein  38.82 
 
 
92 aa  60.1  0.000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31950  hypothetical protein  35.63 
 
 
89 aa  59.3  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5046  hypothetical protein  35.23 
 
 
92 aa  54.3  0.0000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.896322  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3748  protein of unknown function DUF497  33.72 
 
 
92 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3033  protein of unknown function DUF497  32.94 
 
 
92 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.692737  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1764  protein of unknown function DUF497  34.12 
 
 
94 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.324756  normal  0.194696 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3087  protein of unknown function DUF497  32.94 
 
 
92 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1969  protein of unknown function DUF497  31.76 
 
 
92 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1486  hypothetical protein  34.12 
 
 
94 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1034  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0788  hypothetical protein  32.56 
 
 
88 aa  52.4  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2869  hypothetical protein  35.63 
 
 
117 aa  52.4  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0108538  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0155  hypothetical protein  34.88 
 
 
95 aa  51.6  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.465237  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0542  hypothetical protein  35.9 
 
 
85 aa  51.2  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.926039  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1360  hypothetical protein  34.52 
 
 
89 aa  51.6  0.000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.51188  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0188  hypothetical protein  34.88 
 
 
101 aa  51.2  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1996  protein of unknown function DUF497  30.59 
 
 
92 aa  50.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.80933  normal  0.0698328 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1055  hypothetical protein  32.56 
 
 
88 aa  50.4  0.000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0177574  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4512  protein of unknown function DUF497  32.56 
 
 
97 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3262  protein of unknown function DUF497  34.88 
 
 
90 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000202958  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1315  protein of unknown function DUF497  40 
 
 
93 aa  48.9  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000162456 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0665  hypothetical protein  34.09 
 
 
95 aa  48.5  0.00003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.45959  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2093  protein of unknown function DUF497  32.56 
 
 
94 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.177613  normal  0.105621 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1757  hypothetical protein  32.56 
 
 
94 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_7363  hypothetical protein  31.34 
 
 
96 aa  47.8  0.00006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0640425  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2438  protein of unknown function DUF497  24.71 
 
 
88 aa  47.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3672  protein of unknown function DUF497  24.71 
 
 
88 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1490  hypothetical protein  33.82 
 
 
89 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.755193  normal  0.548062 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2045  protein of unknown function DUF497  40 
 
 
93 aa  45.4  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.242597  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2414  hypothetical protein  40 
 
 
93 aa  45.4  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.653132  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1331  hypothetical protein  32.56 
 
 
86 aa  45.4  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.600585  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1152  hypothetical protein  34.15 
 
 
98 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.231422 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3823  hypothetical protein  30 
 
 
92 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0126375  normal  0.293452 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2249  hypothetical protein  44.9 
 
 
67 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.367779 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0832  hypothetical protein  28.74 
 
 
98 aa  44.7  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000000167324  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4530  hypothetical protein  28.89 
 
 
92 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1380  hypothetical protein  28.89 
 
 
92 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.26403  normal  0.829125 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1537  protein of unknown function DUF497  31.4 
 
 
94 aa  42.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0179855 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1009  hypothetical protein  34.83 
 
 
91 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0265  protein of unknown function DUF497  29.07 
 
 
90 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1132  hypothetical protein  27.91 
 
 
90 aa  41.6  0.004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0175216  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1494  hypothetical protein  27.91 
 
 
90 aa  40.8  0.006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.334778 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4942  hypothetical protein  27.78 
 
 
93 aa  40.4  0.008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4941  hypothetical protein  30 
 
 
95 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.75621  normal  0.892041 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4934  hypothetical protein  30 
 
 
95 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3951  protein of unknown function DUF497  29.89 
 
 
91 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.258424  hitchhiker  0.00220511 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>