87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C4934 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011205  SeD_A4941  hypothetical protein  100 
 
 
95 aa  196  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.75621  normal  0.892041 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4934  hypothetical protein  100 
 
 
95 aa  196  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4942  hypothetical protein  84.95 
 
 
93 aa  167  4e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2272  hypothetical protein  61.29 
 
 
99 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3908  hypothetical protein  52.58 
 
 
102 aa  100  7e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2221  protein of unknown function DUF497  56.04 
 
 
97 aa  98.2  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000287405  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5033  hypothetical protein  54 
 
 
105 aa  98.2  4e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.659592  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1112  protein of unknown function DUF497  54.64 
 
 
101 aa  94.7  4e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.402358  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1009  hypothetical protein  46.24 
 
 
91 aa  83.6  9e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2884  hypothetical protein  49.45 
 
 
115 aa  79.3  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.443981  normal  0.0702268 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1353  hypothetical protein  43.96 
 
 
97 aa  77.4  0.00000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00336561  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5046  hypothetical protein  52.75 
 
 
92 aa  76.6  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.896322  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0665  hypothetical protein  47.87 
 
 
95 aa  74.3  0.0000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.45959  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4512  protein of unknown function DUF497  44.44 
 
 
97 aa  74.3  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0788  hypothetical protein  45.05 
 
 
88 aa  71.6  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3951  protein of unknown function DUF497  44.09 
 
 
91 aa  71.2  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.258424  hitchhiker  0.00220511 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5048  protein of unknown function DUF497  44.68 
 
 
91 aa  71.2  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.127602 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0832  hypothetical protein  41.67 
 
 
98 aa  70.9  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000000167324  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1380  hypothetical protein  42.39 
 
 
92 aa  70.1  0.000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.26403  normal  0.829125 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4530  hypothetical protein  42.39 
 
 
92 aa  70.1  0.000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3672  protein of unknown function DUF497  40 
 
 
88 aa  67.8  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0265  protein of unknown function DUF497  37.63 
 
 
90 aa  67.4  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3748  protein of unknown function DUF497  45.35 
 
 
92 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3823  hypothetical protein  39.78 
 
 
92 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0126375  normal  0.293452 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2438  protein of unknown function DUF497  38.89 
 
 
88 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0658  hypothetical protein  40.62 
 
 
97 aa  63.2  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.724327  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1105  hypothetical protein  40.86 
 
 
93 aa  63.2  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0188  hypothetical protein  42.39 
 
 
101 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1969  protein of unknown function DUF497  40.22 
 
 
92 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1507  hypothetical protein  42.11 
 
 
93 aa  62  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.32717  normal  0.158421 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5052  protein of unknown function DUF497  40.62 
 
 
94 aa  61.6  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.174132 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1715  protein of unknown function DUF497  38.04 
 
 
93 aa  61.2  0.000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.643907  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0092  hypothetical protein  41.94 
 
 
93 aa  60.8  0.000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.978778 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3563  protein of unknown function DUF497  41.67 
 
 
101 aa  60.5  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0533639 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1996  protein of unknown function DUF497  39.13 
 
 
92 aa  60.5  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.80933  normal  0.0698328 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1807  hypothetical protein  38.2 
 
 
110 aa  59.7  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.729301  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0131  hypothetical cytosolic protein  39.13 
 
 
97 aa  59.7  0.00000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2952  hypothetical protein  38.14 
 
 
98 aa  59.3  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000403961 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2272  protein of unknown function DUF497  44.09 
 
 
94 aa  59.3  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.754948  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1315  protein of unknown function DUF497  41.94 
 
 
93 aa  59.3  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000162456 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3974  hypothetical protein  42.86 
 
 
115 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.789792  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2414  hypothetical protein  40.86 
 
 
93 aa  58.5  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.653132  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2490  putative inner membrane protein  60.87 
 
 
47 aa  58.5  0.00000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.288099  normal  0.980067 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2045  protein of unknown function DUF497  40.86 
 
 
93 aa  58.5  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.242597  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2195  hypothetical protein  38.04 
 
 
97 aa  58.2  0.00000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1486  hypothetical protein  42.7 
 
 
94 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1034  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1764  protein of unknown function DUF497  42.7 
 
 
94 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.324756  normal  0.194696 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1635  hypothetical protein  36.56 
 
 
95 aa  57.8  0.00000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3087  protein of unknown function DUF497  38.04 
 
 
92 aa  57  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3033  protein of unknown function DUF497  38.04 
 
 
92 aa  57  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.692737  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2106  hypothetical protein  37.5 
 
 
95 aa  56.6  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000345649  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0155  hypothetical protein  40 
 
 
95 aa  56.6  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.465237  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1098  hypothetical protein  40.59 
 
 
97 aa  55.1  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.826789  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2478  hypothetical protein  44.16 
 
 
88 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.513735  normal  0.240444 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4438  protein of unknown function DUF497  39.08 
 
 
92 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0714  hypothetical protein  39.36 
 
 
125 aa  51.6  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0074508  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3295  protein of unknown function DUF497  36.96 
 
 
103 aa  50.8  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.840265  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2135  hypothetical protein  33.33 
 
 
99 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.000237812  normal  0.0140128 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31950  hypothetical protein  39.53 
 
 
89 aa  48.1  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1052  protein of unknown function DUF497  33.33 
 
 
106 aa  47.4  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238312 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1490  hypothetical protein  35.9 
 
 
89 aa  47  0.00009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.755193  normal  0.548062 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2483  hypothetical protein  34.78 
 
 
99 aa  46.6  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7347  protein of unknown function DUF497  35.37 
 
 
93 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.155028  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2523  protein of unknown function DUF497  32.61 
 
 
87 aa  46.6  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2638  hypothetical protein  37.08 
 
 
97 aa  46.6  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.619924 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1354  hypothetical protein  33.7 
 
 
90 aa  46.2  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00877367  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0452  hypothetical protein  35.11 
 
 
87 aa  45.8  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0841161  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2518  protein of unknown function DUF497  38.46 
 
 
81 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2051  hypothetical protein  38.2 
 
 
102 aa  45.1  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013737  Slin_7052  protein of unknown function DUF497  31.25 
 
 
98 aa  44.3  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2002  protein of unknown function DUF497  33.7 
 
 
101 aa  44.3  0.0006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.145016  hitchhiker  0.000000154329 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2639  hypothetical protein  40 
 
 
97 aa  43.9  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0754679  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00610  hypothetical protein  34.44 
 
 
87 aa  43.1  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1132  hypothetical protein  31.91 
 
 
90 aa  43.5  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0175216  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0226  protein of unknown function DUF497  31.87 
 
 
86 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.115808  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0914  protein of unknown function DUF497  28.89 
 
 
106 aa  42.4  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1701  protein of unknown function DUF497  35.56 
 
 
92 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.133917 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0581  hypothetical protein  33.7 
 
 
86 aa  41.6  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0338  hypothetical protein  31.52 
 
 
91 aa  41.6  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0083  hypothetical protein  33.33 
 
 
87 aa  41.6  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1537  protein of unknown function DUF497  35.56 
 
 
94 aa  41.6  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0179855 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1103  hypothetical protein  34.57 
 
 
96 aa  41.6  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0124894  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1533  hypothetical protein  34.38 
 
 
86 aa  40.8  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0085  hypothetical protein  35.9 
 
 
102 aa  40.8  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1006  hypothetical protein  30 
 
 
90 aa  40.4  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.779657  normal  0.61 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2939  hypothetical protein  45.45 
 
 
85 aa  40.4  0.008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0927  protein of unknown function DUF497  34.48 
 
 
89 aa  40.4  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.317041 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>