26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2249 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2249  hypothetical protein  100 
 
 		 67 aa  140  4e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.367779 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4438  protein of unknown function DUF497  55.1 
 
 		 92 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3262  protein of unknown function DUF497  51.92 
 
 		 90 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000202958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6777  protein of unknown function DUF497  46.15 
 
 		 97 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0610097  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1486  hypothetical protein  53.06 
 
 		 94 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1764  protein of unknown function DUF497  53.06 
 
 		 94 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.324756  normal  0.194696 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1152  hypothetical protein  46.15 
 
 		 98 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.231422 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1354  hypothetical protein  48.08 
 
 		 90 aa  48.9  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00877367  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2631  hypothetical protein  49.02 
 
 		 92 aa  48.1  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.268896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1040  hypothetical protein  48.98 
 
 		 89 aa  47.8  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.138821  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2478  hypothetical protein  50 
 
 		 88 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.513735  normal  0.240444 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2070  hypothetical protein  42.37 
 
 		 90 aa  47.4  0.00006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00017339  hitchhiker  0.0000419311 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0542  hypothetical protein  48.98 
 
 		 85 aa  47.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.926039  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1701  protein of unknown function DUF497  47.27 
 
 		 92 aa  45.4  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.133917 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3634  hypothetical protein  45.1 
 
 		 96 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.20528  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1006  hypothetical protein  44.9 
 
 		 90 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.779657  normal  0.61 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3087  protein of unknown function DUF497  42.86 
 
 		 92 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3823  hypothetical protein  48.15 
 
 		 92 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0126375  normal  0.293452 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3033  protein of unknown function DUF497  42.86 
 
 		 92 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.692737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4929  protein of unknown function DUF497  51.02 
 
 		 92 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0927  protein of unknown function DUF497  42.55 
 
 		 89 aa  41.2  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.317041 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2295  hypothetical protein  41.51 
 
 		 83 aa  40.8  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0555295  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3100  hypothetical protein  42.11 
 
 		 92 aa  40.8  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1055  hypothetical protein  37.7 
 
 		 88 aa  40.8  0.007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0177574  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2884  hypothetical protein  42.31 
 
 		 115 aa  40.4  0.009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.443981  normal  0.0702268 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2135  hypothetical protein  41.38 
 
 		 99 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.000237812  normal  0.0140128 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>