59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4438 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_4438  protein of unknown function DUF497  100 
 
 
92 aa  188  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0927  protein of unknown function DUF497  50.57 
 
 
89 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.317041 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3262  protein of unknown function DUF497  48.28 
 
 
90 aa  75.5  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000202958  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2478  hypothetical protein  46.75 
 
 
88 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.513735  normal  0.240444 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2631  hypothetical protein  38.04 
 
 
92 aa  63.2  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.268896  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1006  hypothetical protein  35.96 
 
 
90 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.779657  normal  0.61 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4512  protein of unknown function DUF497  35.48 
 
 
97 aa  60.5  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2249  hypothetical protein  55.1 
 
 
67 aa  60.5  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.367779 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2438  protein of unknown function DUF497  31.76 
 
 
88 aa  57.4  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3672  protein of unknown function DUF497  31.76 
 
 
88 aa  56.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1354  hypothetical protein  40.24 
 
 
90 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00877367  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2884  hypothetical protein  40.91 
 
 
115 aa  55.1  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.443981  normal  0.0702268 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6777  protein of unknown function DUF497  41.57 
 
 
97 aa  54.7  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0610097  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0092  hypothetical protein  38.2 
 
 
93 aa  54.3  0.0000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.978778 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1537  protein of unknown function DUF497  41.18 
 
 
94 aa  52.8  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0179855 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1040  hypothetical protein  34.88 
 
 
89 aa  53.5  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.138821  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4941  hypothetical protein  39.08 
 
 
95 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.75621  normal  0.892041 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3748  protein of unknown function DUF497  41.67 
 
 
92 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4934  hypothetical protein  39.08 
 
 
95 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2272  hypothetical protein  40 
 
 
99 aa  52  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2135  hypothetical protein  37.93 
 
 
99 aa  50.8  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.000237812  normal  0.0140128 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2093  protein of unknown function DUF497  40 
 
 
94 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.177613  normal  0.105621 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2295  hypothetical protein  33.33 
 
 
83 aa  49.7  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0555295  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1757  hypothetical protein  40 
 
 
94 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2070  hypothetical protein  33.33 
 
 
90 aa  50.1  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00017339  hitchhiker  0.0000419311 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1184  protein of unknown function DUF497  34.48 
 
 
90 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.030767  normal  0.28927 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4942  hypothetical protein  33.33 
 
 
93 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3908  hypothetical protein  37.36 
 
 
102 aa  49.3  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1380  hypothetical protein  32.61 
 
 
92 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.26403  normal  0.829125 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4530  hypothetical protein  32.61 
 
 
92 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3033  protein of unknown function DUF497  31.03 
 
 
92 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.692737  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3087  protein of unknown function DUF497  31.03 
 
 
92 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5046  hypothetical protein  40.91 
 
 
92 aa  48.5  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.896322  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1969  protein of unknown function DUF497  35.71 
 
 
92 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4929  protein of unknown function DUF497  36.59 
 
 
92 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3100  hypothetical protein  30.59 
 
 
92 aa  47.8  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1486  hypothetical protein  38.1 
 
 
94 aa  47  0.00009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1034  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1764  protein of unknown function DUF497  38.1 
 
 
94 aa  47  0.00009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.324756  normal  0.194696 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1112  protein of unknown function DUF497  33.7 
 
 
101 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.402358  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1996  protein of unknown function DUF497  34.52 
 
 
92 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.80933  normal  0.0698328 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0714  hypothetical protein  36.78 
 
 
125 aa  45.4  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0074508  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0188  hypothetical protein  40.66 
 
 
101 aa  44.7  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2051  hypothetical protein  34.52 
 
 
102 aa  44.7  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1701  protein of unknown function DUF497  34.57 
 
 
92 aa  43.5  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.133917 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0265  protein of unknown function DUF497  35.63 
 
 
90 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2221  protein of unknown function DUF497  34.88 
 
 
97 aa  43.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000287405  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0665  hypothetical protein  32.18 
 
 
95 aa  43.1  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.45959  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5048  protein of unknown function DUF497  31.46 
 
 
91 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.127602 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0155  hypothetical protein  34.09 
 
 
95 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.465237  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3971  protein of unknown function DUF497  38.6 
 
 
78 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00101642 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3823  hypothetical protein  31.52 
 
 
92 aa  42  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0126375  normal  0.293452 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3951  protein of unknown function DUF497  34.48 
 
 
91 aa  41.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.258424  hitchhiker  0.00220511 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2952  hypothetical protein  37.65 
 
 
98 aa  41.6  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000403961 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3339  hypothetical protein  35.29 
 
 
92 aa  41.6  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.261034  normal  0.0313812 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1507  hypothetical protein  34.15 
 
 
93 aa  41.2  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.32717  normal  0.158421 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7347  protein of unknown function DUF497  36 
 
 
93 aa  40.8  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.155028  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3563  protein of unknown function DUF497  31.46 
 
 
101 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0533639 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5033  hypothetical protein  31.52 
 
 
105 aa  40  0.01  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.659592  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1098  hypothetical protein  34.52 
 
 
97 aa  40  0.01  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.826789  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>