54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A2070 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A2070  hypothetical protein  100 
 
 
90 aa  184  3e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00017339  hitchhiker  0.0000419311 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2295  hypothetical protein  100 
 
 
83 aa  170  6.999999999999999e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0555295  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3100  hypothetical protein  57.47 
 
 
92 aa  110  6e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2869  hypothetical protein  52.33 
 
 
117 aa  99  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0108538  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1055  hypothetical protein  50.59 
 
 
88 aa  85.1  3e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0177574  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1040  hypothetical protein  45.88 
 
 
89 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.138821  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2631  hypothetical protein  42.35 
 
 
92 aa  81.3  0.000000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.268896  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1331  hypothetical protein  49.41 
 
 
86 aa  77.8  0.00000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.600585  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1006  hypothetical protein  42.35 
 
 
90 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.779657  normal  0.61 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1184  protein of unknown function DUF497  48.15 
 
 
90 aa  73.6  0.0000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.030767  normal  0.28927 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3339  hypothetical protein  42.86 
 
 
92 aa  71.2  0.000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.261034  normal  0.0313812 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1354  hypothetical protein  38.82 
 
 
90 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00877367  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3262  protein of unknown function DUF497  41.11 
 
 
90 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000202958  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1701  protein of unknown function DUF497  40 
 
 
92 aa  64.3  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.133917 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4929  protein of unknown function DUF497  39.77 
 
 
92 aa  60.1  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1213  hypothetical protein  41.18 
 
 
83 aa  60.1  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.319817 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3634  hypothetical protein  34.12 
 
 
96 aa  58.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.20528  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3226  protein of unknown function DUF497  34.52 
 
 
95 aa  57.4  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.720273  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1152  hypothetical protein  37.65 
 
 
98 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.231422 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1764  protein of unknown function DUF497  37.21 
 
 
94 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.324756  normal  0.194696 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1486  hypothetical protein  37.21 
 
 
94 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1034  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0542  hypothetical protein  35.06 
 
 
85 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.926039  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2093  protein of unknown function DUF497  36.67 
 
 
94 aa  52.8  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.177613  normal  0.105621 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3823  hypothetical protein  33.71 
 
 
92 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0126375  normal  0.293452 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2437  hypothetical protein  34.88 
 
 
95 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0403567 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1757  hypothetical protein  36.67 
 
 
94 aa  52.8  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1887  hypothetical protein  31.11 
 
 
111 aa  53.1  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.584015  normal  0.325304 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2884  hypothetical protein  33.7 
 
 
115 aa  50.8  0.000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.443981  normal  0.0702268 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_7392  hypothetical protein  34.88 
 
 
90 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0339543  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4438  protein of unknown function DUF497  33.33 
 
 
92 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3748  protein of unknown function DUF497  33.71 
 
 
92 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0435  putative toxin-antitoxin system, toxin component  29.89 
 
 
91 aa  49.3  0.00002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000190302 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4530  hypothetical protein  34.09 
 
 
92 aa  48.1  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1380  hypothetical protein  34.09 
 
 
92 aa  48.1  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.26403  normal  0.829125 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2263  hypothetical protein  33.72 
 
 
93 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.486123 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2249  hypothetical protein  42.37 
 
 
67 aa  47.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.367779 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3787  hypothetical protein  33.72 
 
 
90 aa  47  0.00008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.327341  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0155  hypothetical protein  35.16 
 
 
95 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.465237  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0226  protein of unknown function DUF497  35.23 
 
 
86 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.115808  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1537  protein of unknown function DUF497  32.94 
 
 
94 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0179855 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6777  protein of unknown function DUF497  35.63 
 
 
97 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0610097  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1969  protein of unknown function DUF497  32.95 
 
 
92 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2438  protein of unknown function DUF497  26.44 
 
 
88 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5033  hypothetical protein  32.65 
 
 
105 aa  43.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.659592  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0188  hypothetical protein  32.94 
 
 
101 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2106  hypothetical protein  32.98 
 
 
95 aa  42.4  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000345649  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0410  hypothetical protein  39.39 
 
 
87 aa  42.4  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0832  hypothetical protein  31.91 
 
 
98 aa  42.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000000167324  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0927  protein of unknown function DUF497  30.86 
 
 
89 aa  41.6  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.317041 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1635  hypothetical protein  34.83 
 
 
95 aa  42  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1132  hypothetical protein  25.56 
 
 
90 aa  41.2  0.004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0175216  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2521  hypothetical protein  36.51 
 
 
64 aa  40.8  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.789328  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1996  protein of unknown function DUF497  31.82 
 
 
92 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.80933  normal  0.0698328 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3765  hypothetical protein  31.51 
 
 
93 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>