73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3634 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3634  hypothetical protein  100 
 
 		 96 aa  195  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.20528  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1354  hypothetical protein  48.24 
 
 		 90 aa  83.6  9e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00877367  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1055  hypothetical protein  43.53 
 
 		 88 aa  76.6  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0177574  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1331  hypothetical protein  43.37 
 
 		 86 aa  73.2  0.000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.600585  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1006  hypothetical protein  40 
 
 		 90 aa  72  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.779657  normal  0.61 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1701  protein of unknown function DUF497  42.35 
 
 		 92 aa  68.9  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.133917 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3033  protein of unknown function DUF497  37.65 
 
 		 92 aa  68.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.692737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3087  protein of unknown function DUF497  37.65 
 
 		 92 aa  68.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2869  hypothetical protein  37.21 
 
 		 117 aa  67  0.00000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0108538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1040  hypothetical protein  36.47 
 
 		 89 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.138821  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3100  hypothetical protein  35.29 
 
 		 92 aa  63.5  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2631  hypothetical protein  37.65 
 
 		 92 aa  61.6  0.000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.268896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1360  hypothetical protein  38.55 
 
 		 89 aa  61.2  0.000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.51188  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3262  protein of unknown function DUF497  38.37 
 
 		 90 aa  60.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000202958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2070  hypothetical protein  34.12 
 
 		 90 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00017339  hitchhiker  0.0000419311 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1152  hypothetical protein  37.63 
 
 		 98 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.231422 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2295  hypothetical protein  34.57 
 
 		 83 aa  56.2  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0555295  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1887  hypothetical protein  35.29 
 
 		 111 aa  55.1  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.584015  normal  0.325304 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0665  hypothetical protein  36.78 
 
 		 95 aa  54.3  0.0000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.45959  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1764  protein of unknown function DUF497  34.09 
 
 		 94 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.324756  normal  0.194696 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1486  hypothetical protein  34.09 
 
 		 94 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4929  protein of unknown function DUF497  36.47 
 
 		 92 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2884  hypothetical protein  37.93 
 
 		 115 aa  52  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.443981  normal  0.0702268 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1715  protein of unknown function DUF497  31.03 
 
 		 93 aa  51.6  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.643907  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3823  hypothetical protein  35.71 
 
 		 92 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0126375  normal  0.293452 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2263  hypothetical protein  35.29 
 
 		 93 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.486123 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3672  protein of unknown function DUF497  31.76 
 
 		 88 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5048  protein of unknown function DUF497  34.48 
 
 		 91 aa  50.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.127602 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1380  hypothetical protein  35.71 
 
 		 92 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.26403  normal  0.829125 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4530  hypothetical protein  35.71 
 
 		 92 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2414  hypothetical protein  39.77 
 
 		 93 aa  49.7  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.653132  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2045  protein of unknown function DUF497  39.77 
 
 		 93 aa  49.7  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.242597  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31950  hypothetical protein  33.33 
 
 		 89 aa  49.7  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3339  hypothetical protein  34.44 
 
 		 92 aa  49.3  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.261034  normal  0.0313812 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3176  hypothetical protein  32.18 
 
 		 85 aa  48.1  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000790904  normal  0.0520266 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4512  protein of unknown function DUF497  31.4 
 
 		 97 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0542  hypothetical protein  44.44 
 
 		 85 aa  47.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.926039  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3951  protein of unknown function DUF497  33.33 
 
 		 91 aa  47.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.258424  hitchhiker  0.00220511 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2438  protein of unknown function DUF497  29.41 
 
 		 88 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1184  protein of unknown function DUF497  36.14 
 
 		 90 aa  47  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.030767  normal  0.28927 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_7363  hypothetical protein  38.67 
 
 		 96 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0640425  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2195  hypothetical protein  31.46 
 
 		 97 aa  46.2  0.0001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1969  protein of unknown function DUF497  33.72 
 
 		 92 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3748  protein of unknown function DUF497  34.52 
 
 		 92 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1315  protein of unknown function DUF497  37.5 
 
 		 93 aa  46.2  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000162456 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5046  hypothetical protein  33.33 
 
 		 92 aa  45.8  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.896322  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0286  hypothetical protein  47.62 
 
 		 58 aa  45.4  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1009  hypothetical protein  35.23 
 
 		 91 aa  45.4  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2249  hypothetical protein  45.1 
 
 		 67 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.367779 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0832  hypothetical protein  29.89 
 
 		 98 aa  45.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000000167324  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0131  hypothetical cytosolic protein  30.34 
 
 		 97 aa  44.7  0.0005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1996  protein of unknown function DUF497  32.56 
 
 		 92 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.80933  normal  0.0698328 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0658  hypothetical protein  32.18 
 
 		 97 aa  44.3  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.724327  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3974  hypothetical protein  35.71 
 
 		 115 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.789792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_7392  hypothetical protein  29.35 
 
 		 90 aa  43.9  0.0008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0339543  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0188  hypothetical protein  36.05 
 
 		 101 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2272  protein of unknown function DUF497  27.78 
 
 		 94 aa  42.7  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.754948  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6975  protein of unknown function DUF497  28.05 
 
 		 81 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2093  protein of unknown function DUF497  32.14 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.177613  normal  0.105621 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1757  hypothetical protein  32.14 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0265  protein of unknown function DUF497  26.74 
 
 		 90 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1641  hypothetical protein, putative phage gene  27.06 
 
 		 87 aa  42.4  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.248324  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0927  protein of unknown function DUF497  33.33 
 
 		 89 aa  42.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.317041 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2952  hypothetical protein  31.82 
 
 		 98 aa  42.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000403961 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1491  hypothetical protein  32.94 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0788  hypothetical protein  32.18 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3563  protein of unknown function DUF497  30 
 
 		 101 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0533639 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1490  hypothetical protein  37.65 
 
 		 89 aa  42  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.755193  normal  0.548062 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1213  hypothetical protein  35.29 
 
 		 83 aa  41.2  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.319817 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2051  hypothetical protein  30.59 
 
 		 102 aa  41.2  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2763  hypothetical protein  30.77 
 
 		 82 aa  40.8  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3499  hypothetical protein  35.37 
 
 		 83 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.41867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0435  putative toxin-antitoxin system, toxin component  24.71 
 
 		 91 aa  40  0.01  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000190302 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>