50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3100 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_3100  hypothetical protein  100 
 
 		 92 aa  191  2e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2869  hypothetical protein  69.66 
 
 		 117 aa  133  8e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0108538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2070  hypothetical protein  57.47 
 
 		 90 aa  110  6e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00017339  hitchhiker  0.0000419311 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2295  hypothetical protein  56.63 
 
 		 83 aa  103  6e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0555295  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1055  hypothetical protein  47.73 
 
 		 88 aa  86.7  1e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0177574  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1331  hypothetical protein  46.59 
 
 		 86 aa  80.5  0.000000000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.600585  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1184  protein of unknown function DUF497  48.15 
 
 		 90 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.030767  normal  0.28927 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1040  hypothetical protein  40 
 
 		 89 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.138821  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3262  protein of unknown function DUF497  40.91 
 
 		 90 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000202958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1354  hypothetical protein  37.65 
 
 		 90 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00877367  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2631  hypothetical protein  37.65 
 
 		 92 aa  64.7  0.0000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.268896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3339  hypothetical protein  36.96 
 
 		 92 aa  64.7  0.0000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.261034  normal  0.0313812 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3634  hypothetical protein  35.29 
 
 		 96 aa  63.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.20528  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1701  protein of unknown function DUF497  36.96 
 
 		 92 aa  62.4  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.133917 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1887  hypothetical protein  32.94 
 
 		 111 aa  61.6  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.584015  normal  0.325304 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3823  hypothetical protein  37.08 
 
 		 92 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0126375  normal  0.293452 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1006  hypothetical protein  38.82 
 
 		 90 aa  60.1  0.000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.779657  normal  0.61 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1152  hypothetical protein  36.14 
 
 		 98 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.231422 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2884  hypothetical protein  36.67 
 
 		 115 aa  53.9  0.0000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.443981  normal  0.0702268 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1213  hypothetical protein  34.12 
 
 		 83 aa  53.5  0.0000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.319817 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1380  hypothetical protein  36.36 
 
 		 92 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.26403  normal  0.829125 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4530  hypothetical protein  36.36 
 
 		 92 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2093  protein of unknown function DUF497  33.33 
 
 		 94 aa  52  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.177613  normal  0.105621 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1757  hypothetical protein  33.33 
 
 		 94 aa  52  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4438  protein of unknown function DUF497  30.59 
 
 		 92 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0542  hypothetical protein  38.89 
 
 		 85 aa  47.8  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.926039  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4929  protein of unknown function DUF497  40.24 
 
 		 92 aa  47  0.00009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1486  hypothetical protein  34.94 
 
 		 94 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0188  hypothetical protein  32.95 
 
 		 101 aa  46.6  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1764  protein of unknown function DUF497  34.94 
 
 		 94 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.324756  normal  0.194696 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3748  protein of unknown function DUF497  29.55 
 
 		 92 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5046  hypothetical protein  33.33 
 
 		 92 aa  45.8  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.896322  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0665  hypothetical protein  32.61 
 
 		 95 aa  45.8  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.45959  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2437  hypothetical protein  36.59 
 
 		 95 aa  44.3  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0403567 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0832  hypothetical protein  35.96 
 
 		 98 aa  44.3  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000000167324  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1969  protein of unknown function DUF497  31.82 
 
 		 92 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1537  protein of unknown function DUF497  29.67 
 
 		 94 aa  43.5  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0179855 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2952  hypothetical protein  33.71 
 
 		 98 aa  42.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000403961 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4512  protein of unknown function DUF497  31.03 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1360  hypothetical protein  30.12 
 
 		 89 aa  41.6  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.51188  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1132  hypothetical protein  28.09 
 
 		 90 aa  41.2  0.004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0175216  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3951  protein of unknown function DUF497  35.56 
 
 		 91 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.258424  hitchhiker  0.00220511 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1996  protein of unknown function DUF497  30.68 
 
 		 92 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.80933  normal  0.0698328 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0226  protein of unknown function DUF497  26.74 
 
 		 86 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.115808  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0788  hypothetical protein  35.23 
 
 		 88 aa  41.2  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5052  protein of unknown function DUF497  37.21 
 
 		 94 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.174132 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3974  hypothetical protein  30.49 
 
 		 115 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.789792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2249  hypothetical protein  42.11 
 
 		 67 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.367779 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0155  hypothetical protein  31.82 
 
 		 95 aa  40.4  0.008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.465237  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00610  hypothetical protein  28.92 
 
 		 87 aa  40  0.01  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>