81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1701 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_1701  protein of unknown function DUF497  100 
 
 		 92 aa  187  4e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.133917 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1040  hypothetical protein  51.72 
 
 		 89 aa  97.4  5e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.138821  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3339  hypothetical protein  52.75 
 
 		 92 aa  95.9  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.261034  normal  0.0313812 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1055  hypothetical protein  45.98 
 
 		 88 aa  81.6  0.000000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0177574  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1331  hypothetical protein  45.98 
 
 		 86 aa  75.1  0.0000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.600585  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1213  hypothetical protein  48.28 
 
 		 83 aa  71.6  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.319817 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1152  hypothetical protein  43.37 
 
 		 98 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.231422 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3634  hypothetical protein  42.35 
 
 		 96 aa  68.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.20528  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3226  protein of unknown function DUF497  41.18 
 
 		 95 aa  67  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.720273  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2521  hypothetical protein  51.56 
 
 		 64 aa  64.7  0.0000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.789328  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1006  hypothetical protein  34.09 
 
 		 90 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.779657  normal  0.61 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2070  hypothetical protein  40 
 
 		 90 aa  64.3  0.0000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00017339  hitchhiker  0.0000419311 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0927  protein of unknown function DUF497  40.96 
 
 		 89 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.317041 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0542  hypothetical protein  51.79 
 
 		 85 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.926039  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3262  protein of unknown function DUF497  40.24 
 
 		 90 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000202958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1354  hypothetical protein  37.65 
 
 		 90 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00877367  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3100  hypothetical protein  36.96 
 
 		 92 aa  62.4  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2869  hypothetical protein  35.29 
 
 		 117 aa  61.2  0.000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0108538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2295  hypothetical protein  39.02 
 
 		 83 aa  59.7  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0555295  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2631  hypothetical protein  36.78 
 
 		 92 aa  56.6  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.268896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0083  hypothetical protein  39.29 
 
 		 87 aa  55.5  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2523  protein of unknown function DUF497  35.29 
 
 		 87 aa  54.3  0.0000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0155  hypothetical protein  40.23 
 
 		 95 aa  53.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.465237  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3672  protein of unknown function DUF497  37.5 
 
 		 88 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3748  protein of unknown function DUF497  37.21 
 
 		 92 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2438  protein of unknown function DUF497  37.08 
 
 		 88 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0665  hypothetical protein  41.57 
 
 		 95 aa  52  0.000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.45959  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00610  hypothetical protein  34.94 
 
 		 87 aa  52  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1969  protein of unknown function DUF497  36.47 
 
 		 92 aa  51.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1887  hypothetical protein  33.72 
 
 		 111 aa  52  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.584015  normal  0.325304 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4512  protein of unknown function DUF497  33.33 
 
 		 97 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1764  protein of unknown function DUF497  37.78 
 
 		 94 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.324756  normal  0.194696 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1486  hypothetical protein  37.78 
 
 		 94 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3087  protein of unknown function DUF497  35.29 
 
 		 92 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5046  hypothetical protein  42.7 
 
 		 92 aa  50.8  0.000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.896322  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3033  protein of unknown function DUF497  35.29 
 
 		 92 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.692737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0435  putative toxin-antitoxin system, toxin component  31.11 
 
 		 91 aa  50.4  0.000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000190302 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1009  hypothetical protein  35.96 
 
 		 91 aa  50.4  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1184  protein of unknown function DUF497  34.57 
 
 		 90 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.030767  normal  0.28927 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0832  hypothetical protein  37.23 
 
 		 98 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000000167324  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0788  hypothetical protein  34.15 
 
 		 88 aa  48.9  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1996  protein of unknown function DUF497  35.29 
 
 		 92 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.80933  normal  0.0698328 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2093  protein of unknown function DUF497  37.36 
 
 		 94 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.177613  normal  0.105621 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2884  hypothetical protein  41.38 
 
 		 115 aa  48.9  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.443981  normal  0.0702268 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1757  hypothetical protein  37.36 
 
 		 94 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3823  hypothetical protein  36.05 
 
 		 92 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0126375  normal  0.293452 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4929  protein of unknown function DUF497  37.93 
 
 		 92 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1723  protein of unknown function DUF497  39.08 
 
 		 90 aa  47.8  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.14899  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0265  protein of unknown function DUF497  36.78 
 
 		 90 aa  47.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1494  hypothetical protein  35.29 
 
 		 90 aa  47.4  0.00007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.334778 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_7392  hypothetical protein  38.55 
 
 		 90 aa  47.4  0.00008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0339543  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0092  hypothetical protein  39.02 
 
 		 93 aa  47.4  0.00008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.978778 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1715  protein of unknown function DUF497  34.44 
 
 		 93 aa  46.6  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.643907  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_7363  hypothetical protein  40.54 
 
 		 96 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0640425  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5048  protein of unknown function DUF497  38.2 
 
 		 91 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.127602 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2249  hypothetical protein  47.27 
 
 		 67 aa  45.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.367779 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0188  hypothetical protein  36.36 
 
 		 101 aa  46.2  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0452  hypothetical protein  33.73 
 
 		 87 aa  45.8  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0841161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3951  protein of unknown function DUF497  38.1 
 
 		 91 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.258424  hitchhiker  0.00220511 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3563  protein of unknown function DUF497  34.88 
 
 		 101 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0533639 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0581  hypothetical protein  35.29 
 
 		 86 aa  44.7  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0226  protein of unknown function DUF497  35.63 
 
 		 86 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.115808  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3787  hypothetical protein  34.94 
 
 		 90 aa  43.9  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.327341  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4438  protein of unknown function DUF497  34.57 
 
 		 92 aa  43.5  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5052  protein of unknown function DUF497  41.86 
 
 		 94 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.174132 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2002  protein of unknown function DUF497  34.12 
 
 		 101 aa  42.7  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.145016  hitchhiker  0.000000154329 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4941  hypothetical protein  35.56 
 
 		 95 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.75621  normal  0.892041 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1641  hypothetical protein, putative phage gene  31.76 
 
 		 87 aa  42.7  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.248324  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4934  hypothetical protein  35.56 
 
 		 95 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4530  hypothetical protein  36.05 
 
 		 92 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1380  hypothetical protein  36.05 
 
 		 92 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.26403  normal  0.829125 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4942  hypothetical protein  35.56 
 
 		 93 aa  42.4  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2952  hypothetical protein  37.5 
 
 		 98 aa  42.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000403961 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1360  hypothetical protein  31.65 
 
 		 89 aa  41.2  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.51188  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31950  hypothetical protein  37.93 
 
 		 89 aa  40.8  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1132  hypothetical protein  29.89 
 
 		 90 aa  40.8  0.006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0175216  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1105  hypothetical protein  37.78 
 
 		 93 aa  40.8  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1635  hypothetical protein  31.82 
 
 		 95 aa  40.8  0.007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1491  hypothetical protein  32.61 
 
 		 97 aa  40.4  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0131  hypothetical cytosolic protein  35.96 
 
 		 97 aa  40.8  0.007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1537  protein of unknown function DUF497  37.18 
 
 		 94 aa  40.4  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0179855 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>