60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3787 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3787  hypothetical protein  100 
 
 		 90 aa  188  2e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.327341  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_7392  hypothetical protein  70 
 
 		 90 aa  133  6.0000000000000005e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0339543  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0226  protein of unknown function DUF497  45.45 
 
 		 86 aa  76.6  0.00000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.115808  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1641  hypothetical protein, putative phage gene  38.64 
 
 		 87 aa  60.5  0.000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.248324  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1491  hypothetical protein  38.55 
 
 		 97 aa  59.7  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0581  hypothetical protein  37.5 
 
 		 86 aa  57  0.00000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1132  hypothetical protein  34.09 
 
 		 90 aa  56.6  0.0000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0175216  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0665  hypothetical protein  34.09 
 
 		 95 aa  53.9  0.0000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.45959  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0265  protein of unknown function DUF497  34.44 
 
 		 90 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2523  protein of unknown function DUF497  40.48 
 
 		 87 aa  53.1  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7347  protein of unknown function DUF497  39.74 
 
 		 93 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.155028  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0788  hypothetical protein  35.96 
 
 		 88 aa  52.8  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1055  hypothetical protein  36.05 
 
 		 88 aa  51.2  0.000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0177574  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5046  hypothetical protein  31.03 
 
 		 92 aa  50.8  0.000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.896322  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1360  hypothetical protein  34.15 
 
 		 89 aa  50.4  0.000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.51188  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1486  hypothetical protein  32.53 
 
 		 94 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1764  protein of unknown function DUF497  32.53 
 
 		 94 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.324756  normal  0.194696 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3087  protein of unknown function DUF497  35.29 
 
 		 92 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0832  hypothetical protein  33.73 
 
 		 98 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000000167324  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3033  protein of unknown function DUF497  35.29 
 
 		 92 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.692737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1717  hypothetical protein  34.88 
 
 		 102 aa  49.3  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2952  hypothetical protein  36.14 
 
 		 98 aa  48.1  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000403961 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1494  hypothetical protein  34.15 
 
 		 90 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.334778 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2051  hypothetical protein  33.73 
 
 		 102 aa  48.1  0.00004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00610  hypothetical protein  35.63 
 
 		 87 aa  48.1  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2070  hypothetical protein  33.72 
 
 		 90 aa  47  0.00008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00017339  hitchhiker  0.0000419311 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3951  protein of unknown function DUF497  29.89 
 
 		 91 aa  47  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.258424  hitchhiker  0.00220511 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0410  hypothetical protein  35.37 
 
 		 87 aa  46.2  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3672  protein of unknown function DUF497  32.95 
 
 		 88 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3339  hypothetical protein  33.33 
 
 		 92 aa  46.6  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.261034  normal  0.0313812 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1009  hypothetical protein  34.09 
 
 		 91 aa  46.2  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1331  hypothetical protein  34.88 
 
 		 86 aa  45.8  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.600585  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1040  hypothetical protein  31.82 
 
 		 89 aa  45.8  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.138821  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3226  protein of unknown function DUF497  34.62 
 
 		 95 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.720273  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2295  hypothetical protein  34.15 
 
 		 83 aa  45.4  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0555295  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1757  hypothetical protein  31.46 
 
 		 94 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2639  hypothetical protein  30.38 
 
 		 97 aa  45.1  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0754679  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1537  protein of unknown function DUF497  30.34 
 
 		 94 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0179855 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0435  putative toxin-antitoxin system, toxin component  30.23 
 
 		 91 aa  45.1  0.0003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000190302 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2093  protein of unknown function DUF497  31.46 
 
 		 94 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.177613  normal  0.105621 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31950  hypothetical protein  32.56 
 
 		 89 aa  45.1  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3974  hypothetical protein  33.33 
 
 		 115 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.789792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2272  hypothetical protein  30.77 
 
 		 99 aa  44.7  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0083  hypothetical protein  35.29 
 
 		 87 aa  44.7  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1715  protein of unknown function DUF497  33.33 
 
 		 93 aa  44.7  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.643907  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0452  hypothetical protein  34.83 
 
 		 87 aa  44.3  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0841161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1701  protein of unknown function DUF497  34.94 
 
 		 92 aa  43.9  0.0007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.133917 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1723  protein of unknown function DUF497  34.09 
 
 		 90 aa  43.5  0.0008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.14899  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2002  protein of unknown function DUF497  29.63 
 
 		 101 aa  42.7  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.145016  hitchhiker  0.000000154329 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2884  hypothetical protein  29.89 
 
 		 115 aa  42.7  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.443981  normal  0.0702268 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3262  protein of unknown function DUF497  33.71 
 
 		 90 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000202958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3971  protein of unknown function DUF497  40 
 
 		 78 aa  42  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101642 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1184  protein of unknown function DUF497  29.07 
 
 		 90 aa  42  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.030767  normal  0.28927 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0155  hypothetical protein  28.89 
 
 		 95 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.465237  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1354  hypothetical protein  27.91 
 
 		 90 aa  41.2  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00877367  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2438  protein of unknown function DUF497  30.68 
 
 		 88 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1103  hypothetical protein  27.27 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0124894  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0131  hypothetical cytosolic protein  28.24 
 
 		 97 aa  40.4  0.007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1213  hypothetical protein  31.4 
 
 		 83 aa  40.8  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.319817 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1353  hypothetical protein  27.37 
 
 		 97 aa  40.4  0.009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00336561  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>