71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I1641 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011312  VSAL_I1641  hypothetical protein, putative phage gene  100 
 
 
87 aa  180  5.0000000000000004e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.248324  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00610  hypothetical protein  66.67 
 
 
87 aa  130  6.999999999999999e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0452  hypothetical protein  65.52 
 
 
87 aa  125  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0841161  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0581  hypothetical protein  65.12 
 
 
86 aa  122  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2523  protein of unknown function DUF497  57.47 
 
 
87 aa  117  3.9999999999999996e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1723  protein of unknown function DUF497  60.92 
 
 
90 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.14899  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0083  hypothetical protein  55.17 
 
 
87 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0410  hypothetical protein  60.92 
 
 
87 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0226  protein of unknown function DUF497  56.98 
 
 
86 aa  104  4e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.115808  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1132  hypothetical protein  48.86 
 
 
90 aa  96.3  1e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0175216  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1717  hypothetical protein  48.84 
 
 
102 aa  88.6  3e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1494  hypothetical protein  48.78 
 
 
90 aa  87.8  5e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.334778 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0435  putative toxin-antitoxin system, toxin component  47.67 
 
 
91 aa  84  7e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000190302 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2002  protein of unknown function DUF497  47.13 
 
 
101 aa  80.9  0.000000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.145016  hitchhiker  0.000000154329 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1360  hypothetical protein  40.24 
 
 
89 aa  64.7  0.0000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.51188  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3087  protein of unknown function DUF497  42.53 
 
 
92 aa  64.3  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3033  protein of unknown function DUF497  42.53 
 
 
92 aa  64.3  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.692737  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0265  protein of unknown function DUF497  38.64 
 
 
90 aa  62.8  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31950  hypothetical protein  39.29 
 
 
89 aa  60.8  0.000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3787  hypothetical protein  38.64 
 
 
90 aa  60.5  0.000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.327341  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2952  hypothetical protein  40.91 
 
 
98 aa  59.3  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000403961 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0832  hypothetical protein  38.64 
 
 
98 aa  58.2  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000000167324  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_7392  hypothetical protein  38.1 
 
 
90 aa  55.5  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0339543  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2639  hypothetical protein  39.53 
 
 
97 aa  54.3  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0754679  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1715  protein of unknown function DUF497  35.56 
 
 
93 aa  53.5  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.643907  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1380  hypothetical protein  39.77 
 
 
92 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.26403  normal  0.829125 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4530  hypothetical protein  39.77 
 
 
92 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1055  hypothetical protein  32.94 
 
 
88 aa  52.4  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0177574  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0155  hypothetical protein  37.5 
 
 
95 aa  52.4  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.465237  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0085  hypothetical protein  40 
 
 
102 aa  52.8  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1103  hypothetical protein  39.08 
 
 
96 aa  51.6  0.000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0124894  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3974  hypothetical protein  32.94 
 
 
115 aa  50.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.789792  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1486  hypothetical protein  32.94 
 
 
94 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1034  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1764  protein of unknown function DUF497  32.94 
 
 
94 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.324756  normal  0.194696 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1105  hypothetical protein  38.04 
 
 
93 aa  50.1  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0788  hypothetical protein  33.33 
 
 
88 aa  50.1  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2884  hypothetical protein  36.78 
 
 
115 aa  48.9  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.443981  normal  0.0702268 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3765  hypothetical protein  36.36 
 
 
93 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2221  protein of unknown function DUF497  37.08 
 
 
97 aa  48.5  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000287405  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7347  protein of unknown function DUF497  35.53 
 
 
93 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.155028  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3908  hypothetical protein  35.96 
 
 
102 aa  48.1  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3823  hypothetical protein  34.41 
 
 
92 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0126375  normal  0.293452 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5048  protein of unknown function DUF497  35.23 
 
 
91 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.127602 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1040  hypothetical protein  34.12 
 
 
89 aa  47.8  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.138821  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0131  hypothetical cytosolic protein  32.22 
 
 
97 aa  47.4  0.00008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3951  protein of unknown function DUF497  32.95 
 
 
91 aa  47  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.258424  hitchhiker  0.00220511 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1331  hypothetical protein  31.76 
 
 
86 aa  46.6  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.600585  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3563  protein of unknown function DUF497  34.07 
 
 
101 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0533639 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1112  protein of unknown function DUF497  32.63 
 
 
101 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.402358  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2051  hypothetical protein  35.71 
 
 
102 aa  45.8  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2195  hypothetical protein  31.11 
 
 
97 aa  45.1  0.0003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1152  hypothetical protein  25.58 
 
 
98 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.231422 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2638  hypothetical protein  33.72 
 
 
97 aa  44.7  0.0005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.619924 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0188  hypothetical protein  31.82 
 
 
101 aa  44.3  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5052  protein of unknown function DUF497  35.63 
 
 
94 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.174132 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1213  hypothetical protein  27.06 
 
 
83 aa  43.9  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.319817 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_7363  hypothetical protein  35.71 
 
 
96 aa  43.5  0.0009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0640425  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1701  protein of unknown function DUF497  31.76 
 
 
92 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.133917 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0665  hypothetical protein  33.33 
 
 
95 aa  42.7  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.45959  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1353  hypothetical protein  32.97 
 
 
97 aa  42.4  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00336561  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3634  hypothetical protein  27.06 
 
 
96 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.20528  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0714  hypothetical protein  32.58 
 
 
125 aa  41.6  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0074508  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1479  hypothetical protein  34.78 
 
 
105 aa  42  0.003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0124462  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1969  protein of unknown function DUF497  34.09 
 
 
92 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1807  hypothetical protein  36.71 
 
 
110 aa  41.6  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.729301  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1635  hypothetical protein  30.68 
 
 
95 aa  41.6  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3748  protein of unknown function DUF497  30.68 
 
 
92 aa  41.2  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3672  protein of unknown function DUF497  34.15 
 
 
88 aa  40.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1354  hypothetical protein  30.59 
 
 
90 aa  40.4  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00877367  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1490  hypothetical protein  36.49 
 
 
89 aa  40  0.009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.755193  normal  0.548062 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1009  hypothetical protein  35.56 
 
 
91 aa  40  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>