60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0410 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_0410  hypothetical protein  100 
 
 
87 aa  179  8.000000000000001e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1723  protein of unknown function DUF497  72.41 
 
 
90 aa  132  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.14899  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00610  hypothetical protein  68.97 
 
 
87 aa  125  1.0000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0581  hypothetical protein  71.43 
 
 
86 aa  124  6e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0452  hypothetical protein  65.52 
 
 
87 aa  120  5e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0841161  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1641  hypothetical protein, putative phage gene  60.92 
 
 
87 aa  108  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.248324  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0083  hypothetical protein  61.63 
 
 
87 aa  107  5e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2523  protein of unknown function DUF497  57.47 
 
 
87 aa  103  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0226  protein of unknown function DUF497  60.24 
 
 
86 aa  103  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.115808  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1494  hypothetical protein  54.88 
 
 
90 aa  94  7e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.334778 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1717  hypothetical protein  55.95 
 
 
102 aa  90.1  8e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1132  hypothetical protein  49.41 
 
 
90 aa  82  0.000000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0175216  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0435  putative toxin-antitoxin system, toxin component  51.19 
 
 
91 aa  80.9  0.000000000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000190302 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2002  protein of unknown function DUF497  48.84 
 
 
101 aa  79.7  0.00000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.145016  hitchhiker  0.000000154329 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5052  protein of unknown function DUF497  36.36 
 
 
94 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.174132 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0265  protein of unknown function DUF497  36.05 
 
 
90 aa  57  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3033  protein of unknown function DUF497  39.76 
 
 
92 aa  57  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.692737  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3087  protein of unknown function DUF497  39.76 
 
 
92 aa  57  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2952  hypothetical protein  43.02 
 
 
98 aa  52.8  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000403961 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1715  protein of unknown function DUF497  34.44 
 
 
93 aa  52.8  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.643907  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0832  hypothetical protein  39.53 
 
 
98 aa  51.2  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000000167324  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_7392  hypothetical protein  39.19 
 
 
90 aa  50.1  0.000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0339543  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3765  hypothetical protein  37.5 
 
 
93 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1105  hypothetical protein  40.45 
 
 
93 aa  49.7  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1360  hypothetical protein  35.37 
 
 
89 aa  50.1  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.51188  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5048  protein of unknown function DUF497  34.88 
 
 
91 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.127602 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3974  hypothetical protein  36.47 
 
 
115 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.789792  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4530  hypothetical protein  36.47 
 
 
92 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1380  hypothetical protein  36.47 
 
 
92 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.26403  normal  0.829125 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0155  hypothetical protein  34.12 
 
 
95 aa  47  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.465237  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3787  hypothetical protein  35.37 
 
 
90 aa  46.2  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.327341  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0131  hypothetical cytosolic protein  31.46 
 
 
97 aa  46.2  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0092  hypothetical protein  36.78 
 
 
93 aa  45.8  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.978778 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0085  hypothetical protein  40 
 
 
102 aa  46.2  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3908  hypothetical protein  39.8 
 
 
102 aa  45.8  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1764  protein of unknown function DUF497  33.33 
 
 
94 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.324756  normal  0.194696 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1486  hypothetical protein  33.33 
 
 
94 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1034  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0658  hypothetical protein  34.18 
 
 
97 aa  45.1  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.724327  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4512  protein of unknown function DUF497  40 
 
 
97 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2195  hypothetical protein  30.34 
 
 
97 aa  44.7  0.0005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31950  hypothetical protein  32.05 
 
 
89 aa  43.9  0.0008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1213  hypothetical protein  32.1 
 
 
83 aa  43.5  0.0009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.319817 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0188  hypothetical protein  34.12 
 
 
101 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0788  hypothetical protein  35.23 
 
 
88 aa  43.5  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2272  protein of unknown function DUF497  30.34 
 
 
94 aa  42.7  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.754948  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4942  hypothetical protein  38.2 
 
 
93 aa  42.7  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2221  protein of unknown function DUF497  29.07 
 
 
97 aa  42.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000287405  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3823  hypothetical protein  35.29 
 
 
92 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0126375  normal  0.293452 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2070  hypothetical protein  39.39 
 
 
90 aa  42.4  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00017339  hitchhiker  0.0000419311 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1353  hypothetical protein  31.46 
 
 
97 aa  41.6  0.003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00336561  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0714  hypothetical protein  34.48 
 
 
125 aa  42  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0074508  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1009  hypothetical protein  33.72 
 
 
91 aa  42  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1969  protein of unknown function DUF497  35.16 
 
 
92 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1103  hypothetical protein  31.51 
 
 
96 aa  41.6  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0124894  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3563  protein of unknown function DUF497  27.27 
 
 
101 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0533639 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1055  hypothetical protein  30.95 
 
 
88 aa  40.8  0.006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0177574  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2639  hypothetical protein  31.51 
 
 
97 aa  40.4  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0754679  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1112  protein of unknown function DUF497  34.41 
 
 
101 aa  40.4  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.402358  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1152  hypothetical protein  29.76 
 
 
98 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.231422 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1098  hypothetical protein  33.33 
 
 
97 aa  40  0.01  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.826789  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>