74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0435 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0435  putative toxin-antitoxin system, toxin component  100 
 
 		 91 aa  187  4e-47  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000190302 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1132  hypothetical protein  64.04 
 
 		 90 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0175216  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0226  protein of unknown function DUF497  51.16 
 
 		 86 aa  91.7  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.115808  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00610  hypothetical protein  52.94 
 
 		 87 aa  88.6  3e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0581  hypothetical protein  52.33 
 
 		 86 aa  87.8  5e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2523  protein of unknown function DUF497  48.81 
 
 		 87 aa  85.5  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1723  protein of unknown function DUF497  48.84 
 
 		 90 aa  84.7  4e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.14899  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2002  protein of unknown function DUF497  47.13 
 
 		 101 aa  84  6e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.145016  hitchhiker  0.000000154329 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0083  hypothetical protein  48.24 
 
 		 87 aa  84  7e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1641  hypothetical protein, putative phage gene  47.67 
 
 		 87 aa  84  7e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.248324  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0452  hypothetical protein  50 
 
 		 87 aa  81.6  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0841161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0410  hypothetical protein  51.19 
 
 		 87 aa  80.9  0.000000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1494  hypothetical protein  42.35 
 
 		 90 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.334778 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1717  hypothetical protein  50 
 
 		 102 aa  74.3  0.0000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3087  protein of unknown function DUF497  36.47 
 
 		 92 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3033  protein of unknown function DUF497  36.47 
 
 		 92 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.692737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5048  protein of unknown function DUF497  36.26 
 
 		 91 aa  57.4  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.127602 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1715  protein of unknown function DUF497  36.67 
 
 		 93 aa  56.2  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.643907  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1040  hypothetical protein  33.71 
 
 		 89 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.138821  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0155  hypothetical protein  34.44 
 
 		 95 aa  54.3  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.465237  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2952  hypothetical protein  35.16 
 
 		 98 aa  53.9  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000403961 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1360  hypothetical protein  37.5 
 
 		 89 aa  53.9  0.0000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.51188  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0265  protein of unknown function DUF497  31.03 
 
 		 90 aa  53.9  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1479  hypothetical protein  37.93 
 
 		 105 aa  53.5  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0124462  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3974  hypothetical protein  34.52 
 
 		 115 aa  51.6  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.789792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3951  protein of unknown function DUF497  29.21 
 
 		 91 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.258424  hitchhiker  0.00220511 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1701  protein of unknown function DUF497  31.11 
 
 		 92 aa  50.4  0.000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.133917 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1009  hypothetical protein  35.56 
 
 		 91 aa  50.4  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1213  hypothetical protein  31.76 
 
 		 83 aa  50.1  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.319817 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3765  hypothetical protein  36.05 
 
 		 93 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1354  hypothetical protein  30.59 
 
 		 90 aa  49.7  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00877367  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0832  hypothetical protein  31.46 
 
 		 98 aa  48.9  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000000167324  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0092  hypothetical protein  33.72 
 
 		 93 aa  49.3  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.978778 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2070  hypothetical protein  29.89 
 
 		 90 aa  49.3  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00017339  hitchhiker  0.0000419311 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_7392  hypothetical protein  31.4 
 
 		 90 aa  48.9  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0339543  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7347  protein of unknown function DUF497  31.08 
 
 		 93 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.155028  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0788  hypothetical protein  30.68 
 
 		 88 aa  48.5  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1152  hypothetical protein  30.68 
 
 		 98 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.231422 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2093  protein of unknown function DUF497  30.59 
 
 		 94 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.177613  normal  0.105621 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2639  hypothetical protein  34.48 
 
 		 97 aa  46.2  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0754679  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1055  hypothetical protein  29.89 
 
 		 88 aa  46.2  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0177574  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1757  hypothetical protein  30.59 
 
 		 94 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1764  protein of unknown function DUF497  30.59 
 
 		 94 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.324756  normal  0.194696 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2295  hypothetical protein  29.63 
 
 		 83 aa  46.2  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0555295  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1486  hypothetical protein  30.59 
 
 		 94 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3787  hypothetical protein  30.23 
 
 		 90 aa  45.1  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.327341  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0665  hypothetical protein  31.46 
 
 		 95 aa  44.3  0.0006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.45959  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1969  protein of unknown function DUF497  31.46 
 
 		 92 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0085  hypothetical protein  36.78 
 
 		 102 aa  43.9  0.0007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2438  protein of unknown function DUF497  35.23 
 
 		 88 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1331  hypothetical protein  29.89 
 
 		 86 aa  43.5  0.0009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.600585  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3672  protein of unknown function DUF497  34.09 
 
 		 88 aa  43.5  0.0009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1353  hypothetical protein  29.03 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00336561  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1105  hypothetical protein  30.11 
 
 		 93 aa  43.1  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2272  protein of unknown function DUF497  32.61 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.754948  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1380  hypothetical protein  29.55 
 
 		 92 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.26403  normal  0.829125 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4530  hypothetical protein  29.55 
 
 		 92 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_7363  hypothetical protein  29.21 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0640425  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1112  protein of unknown function DUF497  28.42 
 
 		 101 aa  42.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.402358  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2051  hypothetical protein  34.09 
 
 		 102 aa  42.7  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1996  protein of unknown function DUF497  30.34 
 
 		 92 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.80933  normal  0.0698328 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5052  protein of unknown function DUF497  28.74 
 
 		 94 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.174132 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4512  protein of unknown function DUF497  31.46 
 
 		 97 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3823  hypothetical protein  29.55 
 
 		 92 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0126375  normal  0.293452 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3262  protein of unknown function DUF497  29.55 
 
 		 90 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000202958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0131  hypothetical cytosolic protein  32.95 
 
 		 97 aa  41.6  0.004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1103  hypothetical protein  33.33 
 
 		 96 aa  41.2  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0124894  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3226  protein of unknown function DUF497  30.99 
 
 		 95 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.720273  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5046  hypothetical protein  32.22 
 
 		 92 aa  40.4  0.007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.896322  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0914  protein of unknown function DUF497  29.67 
 
 		 106 aa  40.4  0.008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2884  hypothetical protein  27.78 
 
 		 115 aa  40.4  0.009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.443981  normal  0.0702268 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1807  hypothetical protein  31.03 
 
 		 110 aa  40.4  0.009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.729301  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3748  protein of unknown function DUF497  28.41 
 
 		 92 aa  40  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3634  hypothetical protein  24.71 
 
 		 96 aa  40  0.01  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.20528  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>