100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3748 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3748  protein of unknown function DUF497  100 
 
 		 92 aa  186  5.999999999999999e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0188  hypothetical protein  81.11 
 
 		 101 aa  142  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3823  hypothetical protein  56.67 
 
 		 92 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0126375  normal  0.293452 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1380  hypothetical protein  56.82 
 
 		 92 aa  110  5e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.26403  normal  0.829125 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4530  hypothetical protein  56.82 
 
 		 92 aa  110  5e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1969  protein of unknown function DUF497  55.68 
 
 		 92 aa  103  6e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1996  protein of unknown function DUF497  54.55 
 
 		 92 aa  101  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.80933  normal  0.0698328 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5046  hypothetical protein  47.19 
 
 		 92 aa  78.6  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.896322  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2884  hypothetical protein  44.94 
 
 		 115 aa  76.6  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.443981  normal  0.0702268 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2221  protein of unknown function DUF497  45.16 
 
 		 97 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000287405  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2272  hypothetical protein  49.44 
 
 		 99 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4512  protein of unknown function DUF497  45.98 
 
 		 97 aa  72  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1009  hypothetical protein  39.56 
 
 		 91 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0665  hypothetical protein  39.08 
 
 		 95 aa  68.6  0.00000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.45959  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0832  hypothetical protein  43.48 
 
 		 98 aa  67.4  0.00000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000000167324  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1635  hypothetical protein  43.82 
 
 		 95 aa  67  0.00000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2106  hypothetical protein  44.79 
 
 		 95 aa  67  0.00000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000345649  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4934  hypothetical protein  45.35 
 
 		 95 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4941  hypothetical protein  45.35 
 
 		 95 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.75621  normal  0.892041 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3033  protein of unknown function DUF497  45 
 
 		 92 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.692737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3087  protein of unknown function DUF497  45 
 
 		 92 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1105  hypothetical protein  42.55 
 
 		 93 aa  66.2  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1490  hypothetical protein  45.95 
 
 		 89 aa  65.5  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.755193  normal  0.548062 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1807  hypothetical protein  40 
 
 		 110 aa  65.5  0.0000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.729301  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4942  hypothetical protein  44.19 
 
 		 93 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1112  protein of unknown function DUF497  43.62 
 
 		 101 aa  62  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.402358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1353  hypothetical protein  41.05 
 
 		 97 aa  62  0.000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00336561  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_7363  hypothetical protein  44 
 
 		 96 aa  62  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0640425  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2093  protein of unknown function DUF497  46.51 
 
 		 94 aa  62  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.177613  normal  0.105621 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1757  hypothetical protein  46.51 
 
 		 94 aa  62  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2952  hypothetical protein  41.76 
 
 		 98 aa  61.2  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000403961 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0714  hypothetical protein  42.05 
 
 		 125 aa  60.5  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0074508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1315  protein of unknown function DUF497  40.23 
 
 		 93 aa  60.5  0.000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000162456 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1507  hypothetical protein  39.53 
 
 		 93 aa  58.9  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.32717  normal  0.158421 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1486  hypothetical protein  43.53 
 
 		 94 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2045  protein of unknown function DUF497  40.23 
 
 		 93 aa  59.3  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.242597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1764  protein of unknown function DUF497  43.53 
 
 		 94 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.324756  normal  0.194696 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2414  hypothetical protein  40.23 
 
 		 93 aa  59.3  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.653132  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2272  protein of unknown function DUF497  40.91 
 
 		 94 aa  57.8  0.00000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.754948  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1537  protein of unknown function DUF497  46.34 
 
 		 94 aa  57.8  0.00000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0179855 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2438  protein of unknown function DUF497  37.5 
 
 		 88 aa  57.4  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3563  protein of unknown function DUF497  41.11 
 
 		 101 aa  57.4  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0533639 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1055  hypothetical protein  39.08 
 
 		 88 aa  56.6  0.0000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0177574  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2478  hypothetical protein  39.74 
 
 		 88 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.513735  normal  0.240444 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3672  protein of unknown function DUF497  36.36 
 
 		 88 aa  55.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3974  hypothetical protein  38.82 
 
 		 115 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.789792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0092  hypothetical protein  43.37 
 
 		 93 aa  55.1  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.978778 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0131  hypothetical cytosolic protein  38.46 
 
 		 97 aa  55.1  0.0000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5048  protein of unknown function DUF497  38.04 
 
 		 91 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.127602 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3908  hypothetical protein  40.48 
 
 		 102 aa  54.7  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1715  protein of unknown function DUF497  44.05 
 
 		 93 aa  54.7  0.0000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.643907  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0265  protein of unknown function DUF497  35.87 
 
 		 90 aa  54.3  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5052  protein of unknown function DUF497  40.24 
 
 		 94 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.174132 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3951  protein of unknown function DUF497  38.46 
 
 		 91 aa  53.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.258424  hitchhiker  0.00220511 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3339  hypothetical protein  35.16 
 
 		 92 aa  53.1  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.261034  normal  0.0313812 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5033  hypothetical protein  34.02 
 
 		 105 aa  53.1  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.659592  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1006  hypothetical protein  33.72 
 
 		 90 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.779657  normal  0.61 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2195  hypothetical protein  37.36 
 
 		 97 aa  53.1  0.000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4438  protein of unknown function DUF497  41.67 
 
 		 92 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1701  protein of unknown function DUF497  37.21 
 
 		 92 aa  52.8  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.133917 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31950  hypothetical protein  38.82 
 
 		 89 aa  51.6  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1040  hypothetical protein  36.05 
 
 		 89 aa  51.6  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.138821  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2051  hypothetical protein  41.86 
 
 		 102 aa  50.1  0.000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1331  hypothetical protein  39.08 
 
 		 86 aa  50.1  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.600585  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2631  hypothetical protein  32.56 
 
 		 92 aa  49.7  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.268896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0788  hypothetical protein  34.09 
 
 		 88 aa  49.7  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2070  hypothetical protein  33.71 
 
 		 90 aa  48.9  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00017339  hitchhiker  0.0000419311 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0155  hypothetical protein  34.83 
 
 		 95 aa  48.9  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.465237  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1052  protein of unknown function DUF497  34.48 
 
 		 106 aa  49.3  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238312 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0658  hypothetical protein  39.51 
 
 		 97 aa  48.5  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.724327  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1354  hypothetical protein  34.44 
 
 		 90 aa  48.5  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00877367  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0927  protein of unknown function DUF497  35.87 
 
 		 89 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.317041 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0914  protein of unknown function DUF497  29.55 
 
 		 106 aa  48.5  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0083  hypothetical protein  32.95 
 
 		 87 aa  47.8  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00610  hypothetical protein  35.8 
 
 		 87 aa  46.6  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2002  protein of unknown function DUF497  33.71 
 
 		 101 aa  46.2  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.145016  hitchhiker  0.000000154329 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2523  protein of unknown function DUF497  36.9 
 
 		 87 aa  46.6  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3100  hypothetical protein  29.55 
 
 		 92 aa  46.6  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3634  hypothetical protein  34.52 
 
 		 96 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.20528  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2518  protein of unknown function DUF497  38.46 
 
 		 81 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2490  putative inner membrane protein  50 
 
 		 47 aa  45.1  0.0004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.288099  normal  0.980067 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2135  hypothetical protein  31.33 
 
 		 99 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.000237812  normal  0.0140128 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1494  hypothetical protein  34.15 
 
 		 90 aa  44.7  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.334778 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2638  hypothetical protein  33.75 
 
 		 97 aa  44.3  0.0005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.619924 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2869  hypothetical protein  29.76 
 
 		 117 aa  43.9  0.0008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0108538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2483  hypothetical protein  29.21 
 
 		 99 aa  43.5  0.0009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0085  hypothetical protein  37.33 
 
 		 102 aa  43.1  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3262  protein of unknown function DUF497  35.16 
 
 		 90 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000202958  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6975  protein of unknown function DUF497  34.15 
 
 		 81 aa  42.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4929  protein of unknown function DUF497  36.67 
 
 		 92 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0226  protein of unknown function DUF497  29.17 
 
 		 86 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.115808  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0338  hypothetical protein  31.18 
 
 		 91 aa  41.6  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1184  protein of unknown function DUF497  35.37 
 
 		 90 aa  41.2  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.030767  normal  0.28927 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7347  protein of unknown function DUF497  40.54 
 
 		 93 aa  41.2  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.155028  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1641  hypothetical protein, putative phage gene  30.68 
 
 		 87 aa  41.2  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.248324  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3226  protein of unknown function DUF497  38.57 
 
 		 95 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.720273  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1723  protein of unknown function DUF497  37.35 
 
 		 90 aa  40.8  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.14899  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1887  hypothetical protein  30 
 
 		 111 aa  40.8  0.007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.584015  normal  0.325304 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1098  hypothetical protein  35.63 
 
 		 97 aa  40.8  0.007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.826789  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0435  putative toxin-antitoxin system, toxin component  28.41 
 
 		 91 aa  40  0.01  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000190302 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>