67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2639 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_2639  hypothetical protein  100 
 
 
97 aa  201  3e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0754679  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3765  hypothetical protein  69.66 
 
 
93 aa  134  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1103  hypothetical protein  65.56 
 
 
96 aa  131  3e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0124894  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0085  hypothetical protein  63.44 
 
 
102 aa  124  5e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2135  hypothetical protein  33.68 
 
 
99 aa  60.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.000237812  normal  0.0140128 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7347  protein of unknown function DUF497  37.97 
 
 
93 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.155028  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5048  protein of unknown function DUF497  37.5 
 
 
91 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.127602 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1807  hypothetical protein  38.75 
 
 
110 aa  57.4  0.00000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.729301  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2952  hypothetical protein  40.45 
 
 
98 aa  57  0.00000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000403961 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0832  hypothetical protein  40.28 
 
 
98 aa  56.2  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000000167324  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1641  hypothetical protein, putative phage gene  39.53 
 
 
87 aa  54.3  0.0000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.248324  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5052  protein of unknown function DUF497  38.67 
 
 
94 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.174132 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1105  hypothetical protein  38.16 
 
 
93 aa  53.9  0.0000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2518  protein of unknown function DUF497  40.79 
 
 
81 aa  53.9  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0265  protein of unknown function DUF497  36.78 
 
 
90 aa  53.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1723  protein of unknown function DUF497  32.95 
 
 
90 aa  52.8  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.14899  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0914  protein of unknown function DUF497  36.46 
 
 
106 aa  51.6  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2051  hypothetical protein  38.36 
 
 
102 aa  52  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3087  protein of unknown function DUF497  36.9 
 
 
92 aa  51.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3033  protein of unknown function DUF497  36.9 
 
 
92 aa  51.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.692737  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3974  hypothetical protein  36.78 
 
 
115 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.789792  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0131  hypothetical cytosolic protein  38.16 
 
 
97 aa  50.4  0.000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1396  hypothetical protein  37.78 
 
 
99 aa  50.1  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3951  protein of unknown function DUF497  33.71 
 
 
91 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.258424  hitchhiker  0.00220511 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3295  protein of unknown function DUF497  32.61 
 
 
103 aa  49.7  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.840265  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2195  hypothetical protein  36.84 
 
 
97 aa  48.9  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0665  hypothetical protein  33.33 
 
 
95 aa  48.5  0.00003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.45959  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2483  hypothetical protein  34.83 
 
 
99 aa  48.1  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0714  hypothetical protein  34.48 
 
 
125 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0074508  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1486  hypothetical protein  35.62 
 
 
94 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1034  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1353  hypothetical protein  38.2 
 
 
97 aa  48.1  0.00004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00336561  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1764  protein of unknown function DUF497  35.62 
 
 
94 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.324756  normal  0.194696 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0581  hypothetical protein  37.21 
 
 
86 aa  48.1  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2272  protein of unknown function DUF497  35.16 
 
 
94 aa  48.1  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.754948  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1052  protein of unknown function DUF497  33.33 
 
 
106 aa  47.4  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238312 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0435  putative toxin-antitoxin system, toxin component  34.48 
 
 
91 aa  46.2  0.0001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000190302 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1757  hypothetical protein  35.62 
 
 
94 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2093  protein of unknown function DUF497  35.62 
 
 
94 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.177613  normal  0.105621 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3563  protein of unknown function DUF497  33.33 
 
 
101 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0533639 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2884  hypothetical protein  33.33 
 
 
115 aa  45.8  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.443981  normal  0.0702268 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5046  hypothetical protein  35.14 
 
 
92 aa  45.8  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.896322  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1715  protein of unknown function DUF497  32.53 
 
 
93 aa  46.2  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.643907  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4127  protein of unknown function DUF497  32.58 
 
 
99 aa  45.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.186992  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1635  hypothetical protein  40.79 
 
 
95 aa  46.2  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00610  hypothetical protein  34.88 
 
 
87 aa  45.1  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2523  protein of unknown function DUF497  32.93 
 
 
87 aa  45.4  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4942  hypothetical protein  37.5 
 
 
93 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1537  protein of unknown function DUF497  34.88 
 
 
94 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0179855 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3787  hypothetical protein  30.38 
 
 
90 aa  45.1  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.327341  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0155  hypothetical protein  35 
 
 
95 aa  45.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.465237  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0658  hypothetical protein  34.83 
 
 
97 aa  44.3  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.724327  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1717  hypothetical protein  34.62 
 
 
102 aa  44.3  0.0006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4934  hypothetical protein  40 
 
 
95 aa  43.9  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4941  hypothetical protein  40 
 
 
95 aa  43.9  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.75621  normal  0.892041 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1132  hypothetical protein  32.14 
 
 
90 aa  43.9  0.0007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0175216  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1479  hypothetical protein  35.87 
 
 
105 aa  43.9  0.0007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0124462  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0788  hypothetical protein  33.33 
 
 
88 aa  43.5  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0226  protein of unknown function DUF497  33.33 
 
 
86 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.115808  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5629  protein of unknown function DUF497  32.89 
 
 
96 aa  43.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.384902 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2221  protein of unknown function DUF497  38.98 
 
 
97 aa  43.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000287405  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3908  hypothetical protein  35.71 
 
 
102 aa  43.1  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2106  hypothetical protein  39.47 
 
 
95 aa  42  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000345649  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0083  hypothetical protein  31.4 
 
 
87 aa  41.6  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1112  protein of unknown function DUF497  42.62 
 
 
101 aa  41.2  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.402358  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0410  hypothetical protein  31.51 
 
 
87 aa  40.4  0.007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4512  protein of unknown function DUF497  34.83 
 
 
97 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0452  hypothetical protein  32 
 
 
87 aa  40  0.01  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0841161  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>