75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2106 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE2106  hypothetical protein  100 
 
 
95 aa  191  4e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000345649  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1635  hypothetical protein  96.84 
 
 
95 aa  185  2e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0665  hypothetical protein  46.67 
 
 
95 aa  69.3  0.00000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.45959  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2884  hypothetical protein  46.07 
 
 
115 aa  68.9  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.443981  normal  0.0702268 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5046  hypothetical protein  49.44 
 
 
92 aa  68.2  0.00000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.896322  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3748  protein of unknown function DUF497  44.79 
 
 
92 aa  67  0.00000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0658  hypothetical protein  45.74 
 
 
97 aa  63.5  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.724327  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1807  hypothetical protein  49.44 
 
 
110 aa  63.2  0.000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.729301  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1105  hypothetical protein  44.68 
 
 
93 aa  61.6  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1380  hypothetical protein  42.7 
 
 
92 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.26403  normal  0.829125 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4530  hypothetical protein  42.7 
 
 
92 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1353  hypothetical protein  47.19 
 
 
97 aa  60.8  0.000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00336561  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3823  hypothetical protein  40.45 
 
 
92 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0126375  normal  0.293452 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2051  hypothetical protein  46.15 
 
 
102 aa  60.1  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0131  hypothetical cytosolic protein  43.82 
 
 
97 aa  60.1  0.00000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7347  protein of unknown function DUF497  44 
 
 
93 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.155028  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0265  protein of unknown function DUF497  42.22 
 
 
90 aa  58.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1969  protein of unknown function DUF497  45.88 
 
 
92 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2195  hypothetical protein  42.7 
 
 
97 aa  58.2  0.00000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0832  hypothetical protein  43.18 
 
 
98 aa  56.6  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000000167324  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4934  hypothetical protein  37.5 
 
 
95 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4941  hypothetical protein  37.5 
 
 
95 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.75621  normal  0.892041 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1996  protein of unknown function DUF497  44.71 
 
 
92 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.80933  normal  0.0698328 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2221  protein of unknown function DUF497  44.57 
 
 
97 aa  56.2  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000287405  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0188  hypothetical protein  45.74 
 
 
101 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4942  hypothetical protein  41.05 
 
 
93 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1103  hypothetical protein  47.37 
 
 
96 aa  53.5  0.0000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0124894  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3087  protein of unknown function DUF497  41.11 
 
 
92 aa  53.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3033  protein of unknown function DUF497  41.11 
 
 
92 aa  53.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.692737  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3672  protein of unknown function DUF497  41.11 
 
 
88 aa  53.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3908  hypothetical protein  38.78 
 
 
102 aa  53.5  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1507  hypothetical protein  42.53 
 
 
93 aa  53.1  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.32717  normal  0.158421 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1715  protein of unknown function DUF497  43.01 
 
 
93 aa  52.4  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.643907  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2952  hypothetical protein  42.7 
 
 
98 aa  52.8  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000403961 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2438  protein of unknown function DUF497  41.11 
 
 
88 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3974  hypothetical protein  41.38 
 
 
115 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.789792  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1315  protein of unknown function DUF497  38.95 
 
 
93 aa  51.6  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000162456 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2272  hypothetical protein  38.71 
 
 
99 aa  50.4  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2045  protein of unknown function DUF497  37.89 
 
 
93 aa  50.8  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.242597  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2414  hypothetical protein  37.89 
 
 
93 aa  50.8  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.653132  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1764  protein of unknown function DUF497  38.89 
 
 
94 aa  50.4  0.000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.324756  normal  0.194696 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1486  hypothetical protein  38.89 
 
 
94 aa  50.4  0.000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1034  normal 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4512  protein of unknown function DUF497  45.05 
 
 
97 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1040  hypothetical protein  35.23 
 
 
89 aa  49.7  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.138821  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2272  protein of unknown function DUF497  39.13 
 
 
94 aa  48.5  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.754948  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5048  protein of unknown function DUF497  45.35 
 
 
91 aa  48.9  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.127602 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1052  protein of unknown function DUF497  40.91 
 
 
106 aa  48.5  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238312 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1112  protein of unknown function DUF497  37.89 
 
 
101 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.402358  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3951  protein of unknown function DUF497  41.18 
 
 
91 aa  47.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.258424  hitchhiker  0.00220511 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1009  hypothetical protein  38.54 
 
 
91 aa  47  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3765  hypothetical protein  38.2 
 
 
93 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5052  protein of unknown function DUF497  42.86 
 
 
94 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.174132 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1490  hypothetical protein  40.24 
 
 
89 aa  47  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.755193  normal  0.548062 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2135  hypothetical protein  38.2 
 
 
99 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.000237812  normal  0.0140128 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2483  hypothetical protein  38.82 
 
 
99 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2638  hypothetical protein  37.5 
 
 
97 aa  45.1  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.619924 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0092  hypothetical protein  38.14 
 
 
93 aa  45.1  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.978778 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3971  protein of unknown function DUF497  44.29 
 
 
78 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00101642 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0085  hypothetical protein  42.31 
 
 
102 aa  44.7  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5033  hypothetical protein  36.08 
 
 
105 aa  44.7  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.659592  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2523  protein of unknown function DUF497  31.82 
 
 
87 aa  44.3  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2518  protein of unknown function DUF497  40 
 
 
81 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0155  hypothetical protein  33.7 
 
 
95 aa  43.5  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.465237  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3563  protein of unknown function DUF497  40.23 
 
 
101 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0533639 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_7363  hypothetical protein  37.66 
 
 
96 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0640425  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2070  hypothetical protein  32.98 
 
 
90 aa  42.4  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00017339  hitchhiker  0.0000419311 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2639  hypothetical protein  39.47 
 
 
97 aa  42  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0754679  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1360  hypothetical protein  31.18 
 
 
89 aa  41.6  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.51188  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1213  hypothetical protein  31.82 
 
 
83 aa  41.2  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.319817 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1098  hypothetical protein  38.64 
 
 
97 aa  41.2  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.826789  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1132  hypothetical protein  27.96 
 
 
90 aa  40.8  0.006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0175216  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2939  hypothetical protein  47.17 
 
 
85 aa  40.8  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0788  hypothetical protein  38.71 
 
 
88 aa  40.8  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1479  hypothetical protein  34.52 
 
 
105 aa  40.4  0.009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0124462  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1491  hypothetical protein  35.23 
 
 
97 aa  40  0.01  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>