40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2939 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_2939  hypothetical protein  100 
 
 
85 aa  176  1e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2272  protein of unknown function DUF497  63.33 
 
 
94 aa  79.3  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.754948  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0658  hypothetical protein  62.07 
 
 
97 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.724327  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0131  hypothetical cytosolic protein  58.33 
 
 
97 aa  73.6  0.0000000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2518  protein of unknown function DUF497  62.07 
 
 
81 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2195  hypothetical protein  56.67 
 
 
97 aa  72  0.000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0832  hypothetical protein  56.67 
 
 
98 aa  70.1  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000000167324  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1353  hypothetical protein  53.7 
 
 
97 aa  62.4  0.000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00336561  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1715  protein of unknown function DUF497  47.54 
 
 
93 aa  60.8  0.000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.643907  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3951  protein of unknown function DUF497  45 
 
 
91 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.258424  hitchhiker  0.00220511 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2952  hypothetical protein  45 
 
 
98 aa  58.2  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000403961 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1105  hypothetical protein  49.18 
 
 
93 aa  57.4  0.00000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5052  protein of unknown function DUF497  48.28 
 
 
94 aa  57.4  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.174132 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5048  protein of unknown function DUF497  51.85 
 
 
91 aa  57  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.127602 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3563  protein of unknown function DUF497  44.44 
 
 
101 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0533639 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3974  hypothetical protein  46.55 
 
 
115 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.789792  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1764  protein of unknown function DUF497  37.18 
 
 
94 aa  52  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.324756  normal  0.194696 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1486  hypothetical protein  37.18 
 
 
94 aa  52  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1034  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0265  protein of unknown function DUF497  41.67 
 
 
90 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1112  protein of unknown function DUF497  39.66 
 
 
101 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.402358  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2051  hypothetical protein  45.28 
 
 
102 aa  47  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0665  hypothetical protein  40.38 
 
 
95 aa  46.6  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.45959  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1009  hypothetical protein  43.33 
 
 
91 aa  45.1  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0788  hypothetical protein  44.23 
 
 
88 aa  44.3  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2478  hypothetical protein  42 
 
 
88 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.513735  normal  0.240444 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2490  putative inner membrane protein  61.29 
 
 
47 aa  43.5  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.288099  normal  0.980067 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2884  hypothetical protein  38.33 
 
 
115 aa  43.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.443981  normal  0.0702268 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2483  hypothetical protein  37.93 
 
 
99 aa  43.1  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0714  hypothetical protein  37.7 
 
 
125 aa  43.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0074508  normal 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5046  hypothetical protein  38.89 
 
 
92 aa  42.4  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.896322  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3033  protein of unknown function DUF497  43.64 
 
 
92 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.692737  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2523  protein of unknown function DUF497  38.89 
 
 
87 aa  42  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3087  protein of unknown function DUF497  43.64 
 
 
92 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3295  protein of unknown function DUF497  32.76 
 
 
103 aa  41.6  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.840265  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4094  hypothetical protein  51.61 
 
 
70 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.987137  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3765  hypothetical protein  41.51 
 
 
93 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2106  hypothetical protein  47.17 
 
 
95 aa  40.8  0.006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000345649  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4941  hypothetical protein  45.45 
 
 
95 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.75621  normal  0.892041 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4934  hypothetical protein  45.45 
 
 
95 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2135  hypothetical protein  34.43 
 
 
99 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.000237812  normal  0.0140128 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>