68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2478 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_2478  hypothetical protein  100 
 
 		 88 aa  179  1e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.513735  normal  0.240444 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1764  protein of unknown function DUF497  51.9 
 
 		 94 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.324756  normal  0.194696 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1486  hypothetical protein  51.9 
 
 		 94 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4438  protein of unknown function DUF497  46.75 
 
 		 92 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5046  hypothetical protein  43.53 
 
 		 92 aa  64.3  0.0000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.896322  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3087  protein of unknown function DUF497  41.03 
 
 		 92 aa  63.9  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3033  protein of unknown function DUF497  41.03 
 
 		 92 aa  63.9  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.692737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1507  hypothetical protein  44.74 
 
 		 93 aa  62.8  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.32717  normal  0.158421 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0155  hypothetical protein  46.48 
 
 		 95 aa  60.1  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.465237  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2884  hypothetical protein  41.77 
 
 		 115 aa  60.1  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.443981  normal  0.0702268 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0832  hypothetical protein  41.56 
 
 		 98 aa  57.4  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000000167324  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3748  protein of unknown function DUF497  39.74 
 
 		 92 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3672  protein of unknown function DUF497  33.73 
 
 		 88 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0265  protein of unknown function DUF497  42.25 
 
 		 90 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4530  hypothetical protein  43.66 
 
 		 92 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1380  hypothetical protein  43.66 
 
 		 92 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.26403  normal  0.829125 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2438  protein of unknown function DUF497  32.53 
 
 		 88 aa  53.5  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1112  protein of unknown function DUF497  40.74 
 
 		 101 aa  53.9  0.0000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.402358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5033  hypothetical protein  42.68 
 
 		 105 aa  53.1  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.659592  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0188  hypothetical protein  43.04 
 
 		 101 aa  53.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2952  hypothetical protein  38.96 
 
 		 98 aa  53.5  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000403961 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4941  hypothetical protein  44.16 
 
 		 95 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.75621  normal  0.892041 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4934  hypothetical protein  44.16 
 
 		 95 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0665  hypothetical protein  36.14 
 
 		 95 aa  52.8  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.45959  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3823  hypothetical protein  40 
 
 		 92 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0126375  normal  0.293452 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2051  hypothetical protein  42.25 
 
 		 102 aa  52.8  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3951  protein of unknown function DUF497  36.11 
 
 		 91 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.258424  hitchhiker  0.00220511 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1807  hypothetical protein  40.58 
 
 		 110 aa  51.6  0.000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.729301  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1969  protein of unknown function DUF497  41.67 
 
 		 92 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0788  hypothetical protein  38.46 
 
 		 88 aa  49.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2272  hypothetical protein  39.47 
 
 		 99 aa  49.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0658  hypothetical protein  32.93 
 
 		 97 aa  48.9  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.724327  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3971  protein of unknown function DUF497  41.38 
 
 		 78 aa  48.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101642 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1996  protein of unknown function DUF497  40.28 
 
 		 92 aa  48.9  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.80933  normal  0.0698328 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2272  protein of unknown function DUF497  39.19 
 
 		 94 aa  48.1  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.754948  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5052  protein of unknown function DUF497  35.44 
 
 		 94 aa  47.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.174132 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1105  hypothetical protein  41.33 
 
 		 93 aa  48.1  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1715  protein of unknown function DUF497  31.65 
 
 		 93 aa  47.8  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.643907  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2249  hypothetical protein  50 
 
 		 67 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.367779 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5048  protein of unknown function DUF497  31.58 
 
 		 91 aa  47  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.127602 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4942  hypothetical protein  44.16 
 
 		 93 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1132  hypothetical protein  33.77 
 
 		 90 aa  45.4  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0175216  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4512  protein of unknown function DUF497  40.79 
 
 		 97 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2093  protein of unknown function DUF497  40.85 
 
 		 94 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.177613  normal  0.105621 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1757  hypothetical protein  40.85 
 
 		 94 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_7363  hypothetical protein  39.68 
 
 		 96 aa  45.1  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0640425  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1537  protein of unknown function DUF497  40.85 
 
 		 94 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0179855 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2221  protein of unknown function DUF497  35.53 
 
 		 97 aa  44.3  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000287405  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0714  hypothetical protein  39.73 
 
 		 125 aa  44.3  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0074508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1098  hypothetical protein  37.8 
 
 		 97 aa  44.3  0.0006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.826789  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1353  hypothetical protein  34.21 
 
 		 97 aa  44.3  0.0006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00336561  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2045  protein of unknown function DUF497  47.3 
 
 		 93 aa  43.9  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.242597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2414  hypothetical protein  47.3 
 
 		 93 aa  43.9  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.653132  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2518  protein of unknown function DUF497  34.72 
 
 		 81 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2939  hypothetical protein  42 
 
 		 85 aa  43.9  0.0008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3974  hypothetical protein  34.21 
 
 		 115 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.789792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2523  protein of unknown function DUF497  36 
 
 		 87 aa  41.6  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1315  protein of unknown function DUF497  45.95 
 
 		 93 aa  41.6  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000162456 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3908  hypothetical protein  37.5 
 
 		 102 aa  42  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0226  protein of unknown function DUF497  32.91 
 
 		 86 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.115808  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7347  protein of unknown function DUF497  38.1 
 
 		 93 aa  41.2  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.155028  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0083  hypothetical protein  38.67 
 
 		 87 aa  41.2  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3563  protein of unknown function DUF497  36.49 
 
 		 101 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0533639 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1009  hypothetical protein  36.71 
 
 		 91 aa  40.8  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1354  hypothetical protein  38.89 
 
 		 90 aa  40.8  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00877367  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31950  hypothetical protein  34.62 
 
 		 89 aa  40.4  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1635  hypothetical protein  31.71 
 
 		 95 aa  40.4  0.008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00610  hypothetical protein  35.71 
 
 		 87 aa  40  0.01  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>