78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_31950 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_31950  hypothetical protein  100 
 
 
89 aa  176  1e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0832  hypothetical protein  42.86 
 
 
98 aa  67.8  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000000167324  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0265  protein of unknown function DUF497  46.99 
 
 
90 aa  64.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2952  hypothetical protein  41.67 
 
 
98 aa  63.2  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000403961 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1641  hypothetical protein, putative phage gene  39.29 
 
 
87 aa  60.8  0.000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.248324  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1315  protein of unknown function DUF497  42.05 
 
 
93 aa  59.7  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000162456 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1006  hypothetical protein  35.63 
 
 
90 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.779657  normal  0.61 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3033  protein of unknown function DUF497  38.37 
 
 
92 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.692737  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3087  protein of unknown function DUF497  38.37 
 
 
92 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2438  protein of unknown function DUF497  37.5 
 
 
88 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1132  hypothetical protein  38.1 
 
 
90 aa  57  0.00000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0175216  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1105  hypothetical protein  37.93 
 
 
93 aa  56.6  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0155  hypothetical protein  40 
 
 
95 aa  56.6  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.465237  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3672  protein of unknown function DUF497  36.36 
 
 
88 aa  55.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2884  hypothetical protein  40 
 
 
115 aa  55.8  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.443981  normal  0.0702268 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2638  hypothetical protein  43.37 
 
 
97 aa  55.1  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.619924 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6975  protein of unknown function DUF497  41.98 
 
 
81 aa  55.1  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4512  protein of unknown function DUF497  36.47 
 
 
97 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2045  protein of unknown function DUF497  39.77 
 
 
93 aa  53.9  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.242597  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2414  hypothetical protein  39.77 
 
 
93 aa  53.9  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.653132  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2523  protein of unknown function DUF497  35.9 
 
 
87 aa  53.9  0.0000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1360  hypothetical protein  31.82 
 
 
89 aa  53.5  0.0000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.51188  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4530  hypothetical protein  39.33 
 
 
92 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1380  hypothetical protein  39.33 
 
 
92 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.26403  normal  0.829125 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2272  hypothetical protein  40.23 
 
 
99 aa  53.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1354  hypothetical protein  41.18 
 
 
90 aa  53.5  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00877367  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0788  hypothetical protein  36.78 
 
 
88 aa  52.8  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0452  hypothetical protein  32.14 
 
 
87 aa  52  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0841161  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3748  protein of unknown function DUF497  38.82 
 
 
92 aa  51.6  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0975  hypothetical protein  38.1 
 
 
106 aa  51.2  0.000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.024485  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00610  hypothetical protein  32.05 
 
 
87 aa  50.8  0.000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3339  hypothetical protein  37.08 
 
 
92 aa  50.4  0.000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.261034  normal  0.0313812 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0338  hypothetical protein  37.08 
 
 
91 aa  50.1  0.000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1486  hypothetical protein  40.48 
 
 
94 aa  50.4  0.000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1034  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1764  protein of unknown function DUF497  40.48 
 
 
94 aa  50.4  0.000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.324756  normal  0.194696 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3634  hypothetical protein  33.33 
 
 
96 aa  49.7  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.20528  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1969  protein of unknown function DUF497  38.55 
 
 
92 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1040  hypothetical protein  32.14 
 
 
89 aa  50.1  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.138821  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2002  protein of unknown function DUF497  37.35 
 
 
101 aa  49.7  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.145016  hitchhiker  0.000000154329 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3823  hypothetical protein  41.11 
 
 
92 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0126375  normal  0.293452 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4942  hypothetical protein  35.23 
 
 
93 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2051  hypothetical protein  34.09 
 
 
102 aa  48.5  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4934  hypothetical protein  39.53 
 
 
95 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4941  hypothetical protein  39.53 
 
 
95 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.75621  normal  0.892041 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_7363  hypothetical protein  39.19 
 
 
96 aa  47.8  0.00005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0640425  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1112  protein of unknown function DUF497  37.36 
 
 
101 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.402358  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1715  protein of unknown function DUF497  31.4 
 
 
93 aa  47.4  0.00006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.643907  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1494  hypothetical protein  33.73 
 
 
90 aa  47.8  0.00006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.334778 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1996  protein of unknown function DUF497  37.35 
 
 
92 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.80933  normal  0.0698328 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2763  hypothetical protein  38.55 
 
 
82 aa  47  0.00008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2221  protein of unknown function DUF497  37.5 
 
 
97 aa  47  0.00008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000287405  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3951  protein of unknown function DUF497  29.76 
 
 
91 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.258424  hitchhiker  0.00220511 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0226  protein of unknown function DUF497  33.33 
 
 
86 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.115808  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5046  hypothetical protein  35.71 
 
 
92 aa  46.6  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.896322  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1055  hypothetical protein  36.36 
 
 
88 aa  46.2  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0177574  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1009  hypothetical protein  36.9 
 
 
91 aa  45.4  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1491  hypothetical protein  32.93 
 
 
97 aa  45.4  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0131  hypothetical cytosolic protein  32.94 
 
 
97 aa  45.1  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3787  hypothetical protein  32.56 
 
 
90 aa  45.1  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.327341  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1533  hypothetical protein  37.93 
 
 
86 aa  44.3  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1537  protein of unknown function DUF497  35.71 
 
 
94 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0179855 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0581  hypothetical protein  30.77 
 
 
86 aa  43.9  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0410  hypothetical protein  32.05 
 
 
87 aa  43.9  0.0008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2195  hypothetical protein  31.76 
 
 
97 aa  43.1  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_7392  hypothetical protein  34.52 
 
 
90 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0339543  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1152  hypothetical protein  32.94 
 
 
98 aa  42.7  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.231422 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1723  protein of unknown function DUF497  33.33 
 
 
90 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.14899  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3974  hypothetical protein  33.33 
 
 
115 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.789792  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5052  protein of unknown function DUF497  34.52 
 
 
94 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.174132 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2093  protein of unknown function DUF497  34.52 
 
 
94 aa  41.6  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.177613  normal  0.105621 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0665  hypothetical protein  35.29 
 
 
95 aa  42  0.003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.45959  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1757  hypothetical protein  34.52 
 
 
94 aa  41.6  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3563  protein of unknown function DUF497  33.72 
 
 
101 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0533639 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1701  protein of unknown function DUF497  37.93 
 
 
92 aa  40.8  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.133917 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1807  hypothetical protein  30.12 
 
 
110 aa  40.8  0.006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.729301  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3610  hypothetical protein  32.93 
 
 
82 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.754019  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2478  hypothetical protein  34.62 
 
 
88 aa  40.4  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.513735  normal  0.240444 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0083  hypothetical protein  29.76 
 
 
87 aa  40.4  0.008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>