44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_1152 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_1152  hypothetical protein  100 
 
 
98 aa  201  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.231422 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3339  hypothetical protein  51.14 
 
 
92 aa  78.2  0.00000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.261034  normal  0.0313812 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1040  hypothetical protein  39.08 
 
 
89 aa  73.9  0.0000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.138821  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1701  protein of unknown function DUF497  43.37 
 
 
92 aa  71.6  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.133917 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1055  hypothetical protein  44.83 
 
 
88 aa  71.6  0.000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0177574  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1331  hypothetical protein  44.83 
 
 
86 aa  68.6  0.00000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.600585  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3634  hypothetical protein  37.63 
 
 
96 aa  57.8  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.20528  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2521  hypothetical protein  49.15 
 
 
64 aa  57  0.00000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.789328  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3100  hypothetical protein  36.14 
 
 
92 aa  55.5  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2070  hypothetical protein  37.65 
 
 
90 aa  55.1  0.0000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00017339  hitchhiker  0.0000419311 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1184  protein of unknown function DUF497  37.04 
 
 
90 aa  52  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.030767  normal  0.28927 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0542  hypothetical protein  37.88 
 
 
85 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.926039  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1354  hypothetical protein  46.15 
 
 
90 aa  51.6  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00877367  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2249  hypothetical protein  46.15 
 
 
67 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.367779 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0226  protein of unknown function DUF497  29.07 
 
 
86 aa  49.7  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.115808  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2631  hypothetical protein  38.1 
 
 
92 aa  50.1  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.268896  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2295  hypothetical protein  37.18 
 
 
83 aa  48.9  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0555295  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4929  protein of unknown function DUF497  38.2 
 
 
92 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2869  hypothetical protein  33.73 
 
 
117 aa  48.5  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0108538  normal 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4512  protein of unknown function DUF497  35.23 
 
 
97 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0435  putative toxin-antitoxin system, toxin component  30.68 
 
 
91 aa  48.1  0.00004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000190302 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2884  hypothetical protein  36.47 
 
 
115 aa  47.8  0.00005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.443981  normal  0.0702268 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3262  protein of unknown function DUF497  32.53 
 
 
90 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000202958  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1132  hypothetical protein  31.82 
 
 
90 aa  47  0.00008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0175216  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00610  hypothetical protein  31.11 
 
 
87 aa  46.6  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2523  protein of unknown function DUF497  33.33 
 
 
87 aa  45.8  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1764  protein of unknown function DUF497  34.48 
 
 
94 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.324756  normal  0.194696 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3087  protein of unknown function DUF497  32.56 
 
 
92 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0188  hypothetical protein  36.36 
 
 
101 aa  46.2  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3226  protein of unknown function DUF497  35.8 
 
 
95 aa  45.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.720273  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3033  protein of unknown function DUF497  32.56 
 
 
92 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.692737  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1006  hypothetical protein  34.15 
 
 
90 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.779657  normal  0.61 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1486  hypothetical protein  34.48 
 
 
94 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1034  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0452  hypothetical protein  32.14 
 
 
87 aa  45.1  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0841161  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1641  hypothetical protein, putative phage gene  25.58 
 
 
87 aa  44.7  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.248324  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0083  hypothetical protein  30.95 
 
 
87 aa  44.3  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31950  hypothetical protein  32.94 
 
 
89 aa  42.7  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_7363  hypothetical protein  34.94 
 
 
96 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0640425  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0155  hypothetical protein  33.33 
 
 
95 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.465237  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2002  protein of unknown function DUF497  32.18 
 
 
101 aa  42.7  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.145016  hitchhiker  0.000000154329 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5046  hypothetical protein  32.18 
 
 
92 aa  42.4  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.896322  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1213  hypothetical protein  38.27 
 
 
83 aa  41.6  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.319817 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0410  hypothetical protein  29.76 
 
 
87 aa  40.4  0.008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1723  protein of unknown function DUF497  30.23 
 
 
90 aa  40.4  0.009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.14899  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>