26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A0542 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009078  BURPS1106A_A0542  hypothetical protein  100 
 
 		 85 aa  176  7e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.926039  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1040  hypothetical protein  100 
 
 		 89 aa  122  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.138821  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1701  protein of unknown function DUF497  51.79 
 
 		 92 aa  63.5  0.0000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.133917 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1055  hypothetical protein  50.98 
 
 		 88 aa  55.5  0.0000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0177574  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2070  hypothetical protein  35.06 
 
 		 90 aa  53.9  0.0000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00017339  hitchhiker  0.0000419311 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1331  hypothetical protein  49.02 
 
 		 86 aa  53.1  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.600585  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1152  hypothetical protein  37.88 
 
 		 98 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.231422 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2295  hypothetical protein  34.67 
 
 		 83 aa  52  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0555295  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4929  protein of unknown function DUF497  50 
 
 		 92 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1006  hypothetical protein  35.9 
 
 		 90 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.779657  normal  0.61 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2869  hypothetical protein  42.86 
 
 		 117 aa  48.5  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0108538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3339  hypothetical protein  43.55 
 
 		 92 aa  48.1  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.261034  normal  0.0313812 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3634  hypothetical protein  44.44 
 
 		 96 aa  47.8  0.00005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.20528  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2631  hypothetical protein  45 
 
 		 92 aa  47.4  0.00006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.268896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3100  hypothetical protein  38.89 
 
 		 92 aa  47.8  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2249  hypothetical protein  48.98 
 
 		 67 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.367779 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3262  protein of unknown function DUF497  47.06 
 
 		 90 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000202958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4512  protein of unknown function DUF497  43.86 
 
 		 97 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1354  hypothetical protein  46 
 
 		 90 aa  45.4  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00877367  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1213  hypothetical protein  41.07 
 
 		 83 aa  44.3  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.319817 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2437  hypothetical protein  38 
 
 		 95 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0403567 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1486  hypothetical protein  40.74 
 
 		 94 aa  41.6  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1764  protein of unknown function DUF497  40.74 
 
 		 94 aa  41.6  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.324756  normal  0.194696 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1887  hypothetical protein  35.48 
 
 		 111 aa  40.8  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.584015  normal  0.325304 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3226  protein of unknown function DUF497  40 
 
 		 95 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.720273  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1969  protein of unknown function DUF497  43.14 
 
 		 92 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>