22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3226 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_3226  protein of unknown function DUF497  100 
 
 		 95 aa  196  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.720273  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1213  hypothetical protein  50.6 
 
 		 83 aa  80.9  0.000000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.319817 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1701  protein of unknown function DUF497  41.18 
 
 		 92 aa  67  0.00000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.133917 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3339  hypothetical protein  42.05 
 
 		 92 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.261034  normal  0.0313812 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1040  hypothetical protein  36.47 
 
 		 89 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.138821  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2070  hypothetical protein  34.52 
 
 		 90 aa  57.4  0.00000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00017339  hitchhiker  0.0000419311 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2295  hypothetical protein  33.33 
 
 		 83 aa  53.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0555295  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2521  hypothetical protein  43.55 
 
 		 64 aa  51.6  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.789328  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1055  hypothetical protein  34.12 
 
 		 88 aa  48.9  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0177574  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1152  hypothetical protein  35.8 
 
 		 98 aa  45.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.231422 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3787  hypothetical protein  34.62 
 
 		 90 aa  45.8  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.327341  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1331  hypothetical protein  35.14 
 
 		 86 aa  44.3  0.0005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.600585  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1757  hypothetical protein  37.97 
 
 		 94 aa  42.7  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2869  hypothetical protein  35.48 
 
 		 117 aa  42.4  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0108538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2093  protein of unknown function DUF497  37.97 
 
 		 94 aa  42.7  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.177613  normal  0.105621 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3262  protein of unknown function DUF497  39.24 
 
 		 90 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000202958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3748  protein of unknown function DUF497  38.57 
 
 		 92 aa  41.2  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0435  putative toxin-antitoxin system, toxin component  30.99 
 
 		 91 aa  41.2  0.005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000190302 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0542  hypothetical protein  40 
 
 		 85 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.926039  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1354  hypothetical protein  29.76 
 
 		 90 aa  40.8  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00877367  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0226  protein of unknown function DUF497  32.14 
 
 		 86 aa  40.4  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.115808  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2002  protein of unknown function DUF497  32.47 
 
 		 101 aa  40.4  0.008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.145016  hitchhiker  0.000000154329 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>