62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_3339 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_3339  hypothetical protein  100 
 
 		 92 aa  190  6e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.261034  normal  0.0313812 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1055  hypothetical protein  58.7 
 
 		 88 aa  103  1e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0177574  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1331  hypothetical protein  58.7 
 
 		 86 aa  96.7  9e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.600585  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1701  protein of unknown function DUF497  52.75 
 
 		 92 aa  95.9  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.133917 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1040  hypothetical protein  46.15 
 
 		 89 aa  84  7e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.138821  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1152  hypothetical protein  51.14 
 
 		 98 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.231422 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2070  hypothetical protein  42.86 
 
 		 90 aa  71.2  0.000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00017339  hitchhiker  0.0000419311 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2521  hypothetical protein  54.69 
 
 		 64 aa  67.4  0.00000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.789328  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2295  hypothetical protein  42.53 
 
 		 83 aa  66.2  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0555295  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3100  hypothetical protein  36.96 
 
 		 92 aa  64.7  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1006  hypothetical protein  37.78 
 
 		 90 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.779657  normal  0.61 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2869  hypothetical protein  36.96 
 
 		 117 aa  61.6  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0108538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1184  protein of unknown function DUF497  42.53 
 
 		 90 aa  60.1  0.000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.030767  normal  0.28927 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3226  protein of unknown function DUF497  42.05 
 
 		 95 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.720273  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2631  hypothetical protein  34.44 
 
 		 92 aa  58.9  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.268896  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4929  protein of unknown function DUF497  37.36 
 
 		 92 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5046  hypothetical protein  37.63 
 
 		 92 aa  55.5  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.896322  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_7363  hypothetical protein  45.59 
 
 		 96 aa  53.5  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0640425  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1213  hypothetical protein  40.45 
 
 		 83 aa  53.5  0.0000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.319817 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3748  protein of unknown function DUF497  35.16 
 
 		 92 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2884  hypothetical protein  37.78 
 
 		 115 aa  53.5  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.443981  normal  0.0702268 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1757  hypothetical protein  40 
 
 		 94 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2093  protein of unknown function DUF497  40 
 
 		 94 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.177613  normal  0.105621 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0927  protein of unknown function DUF497  40 
 
 		 89 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.317041 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1354  hypothetical protein  35.56 
 
 		 90 aa  51.2  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00877367  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1009  hypothetical protein  37.63 
 
 		 91 aa  50.4  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31950  hypothetical protein  37.08 
 
 		 89 aa  50.4  0.000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1486  hypothetical protein  39.33 
 
 		 94 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0188  hypothetical protein  37.93 
 
 		 101 aa  49.7  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1764  protein of unknown function DUF497  39.33 
 
 		 94 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.324756  normal  0.194696 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3634  hypothetical protein  34.44 
 
 		 96 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.20528  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3672  protein of unknown function DUF497  27.17 
 
 		 88 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0542  hypothetical protein  43.55 
 
 		 85 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.926039  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0665  hypothetical protein  37.23 
 
 		 95 aa  48.1  0.00005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.45959  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2438  protein of unknown function DUF497  27.17 
 
 		 88 aa  47.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3262  protein of unknown function DUF497  40 
 
 		 90 aa  47.4  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000202958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1315  protein of unknown function DUF497  36.26 
 
 		 93 aa  47  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000162456 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0155  hypothetical protein  40.22 
 
 		 95 aa  47  0.00009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.465237  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0832  hypothetical protein  34.74 
 
 		 98 aa  46.2  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000000167324  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3787  hypothetical protein  33.33 
 
 		 90 aa  46.6  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.327341  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1887  hypothetical protein  30.34 
 
 		 111 aa  46.6  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.584015  normal  0.325304 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3823  hypothetical protein  31.52 
 
 		 92 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0126375  normal  0.293452 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0083  hypothetical protein  32.94 
 
 		 87 aa  45.1  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_7392  hypothetical protein  34.04 
 
 		 90 aa  45.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0339543  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1537  protein of unknown function DUF497  37.78 
 
 		 94 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0179855 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1969  protein of unknown function DUF497  31.82 
 
 		 92 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0092  hypothetical protein  37.21 
 
 		 93 aa  44.3  0.0006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.978778 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4512  protein of unknown function DUF497  34.78 
 
 		 97 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1380  hypothetical protein  31.87 
 
 		 92 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.26403  normal  0.829125 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4530  hypothetical protein  31.87 
 
 		 92 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1112  protein of unknown function DUF497  37.36 
 
 		 101 aa  43.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.402358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0788  hypothetical protein  32.22 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2414  hypothetical protein  35.16 
 
 		 93 aa  43.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.653132  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2045  protein of unknown function DUF497  35.16 
 
 		 93 aa  43.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.242597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2437  hypothetical protein  30.77 
 
 		 95 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0403567 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1996  protein of unknown function DUF497  30.68 
 
 		 92 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.80933  normal  0.0698328 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4438  protein of unknown function DUF497  35.29 
 
 		 92 aa  41.6  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3033  protein of unknown function DUF497  33.33 
 
 		 92 aa  41.2  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.692737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3087  protein of unknown function DUF497  33.33 
 
 		 92 aa  41.2  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2523  protein of unknown function DUF497  34.07 
 
 		 87 aa  41.6  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2263  hypothetical protein  33.33 
 
 		 93 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.486123 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1723  protein of unknown function DUF497  33.71 
 
 		 90 aa  40  0.01  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.14899  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>