36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1184 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_1184  protein of unknown function DUF497  100 
 
 		 90 aa  184  2e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.030767  normal  0.28927 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3100  hypothetical protein  48.15 
 
 		 92 aa  79  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1055  hypothetical protein  48.15 
 
 		 88 aa  78.2  0.00000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0177574  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2295  hypothetical protein  48.15 
 
 		 83 aa  73.6  0.0000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0555295  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2070  hypothetical protein  48.15 
 
 		 90 aa  73.6  0.0000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00017339  hitchhiker  0.0000419311 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1331  hypothetical protein  46.91 
 
 		 86 aa  72  0.000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.600585  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2869  hypothetical protein  44.44 
 
 		 117 aa  72.8  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0108538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3339  hypothetical protein  42.53 
 
 		 92 aa  60.1  0.000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.261034  normal  0.0313812 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1040  hypothetical protein  37.04 
 
 		 89 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.138821  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1152  hypothetical protein  37.04 
 
 		 98 aa  52  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.231422 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2437  hypothetical protein  34.09 
 
 		 95 aa  50.4  0.000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0403567 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1701  protein of unknown function DUF497  34.57 
 
 		 92 aa  50.4  0.000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.133917 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4438  protein of unknown function DUF497  34.48 
 
 		 92 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2438  protein of unknown function DUF497  33.33 
 
 		 88 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3971  protein of unknown function DUF497  38.24 
 
 		 78 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101642 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0788  hypothetical protein  40.91 
 
 		 88 aa  48.1  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1887  hypothetical protein  29.63 
 
 		 111 aa  48.1  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.584015  normal  0.325304 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1354  hypothetical protein  29.55 
 
 		 90 aa  48.1  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00877367  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0265  protein of unknown function DUF497  34.48 
 
 		 90 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3634  hypothetical protein  36.14 
 
 		 96 aa  47  0.00008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.20528  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3672  protein of unknown function DUF497  32.56 
 
 		 88 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1757  hypothetical protein  32.94 
 
 		 94 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3262  protein of unknown function DUF497  33.33 
 
 		 90 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000202958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2093  protein of unknown function DUF497  32.94 
 
 		 94 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.177613  normal  0.105621 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5046  hypothetical protein  32.14 
 
 		 92 aa  44.7  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.896322  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4929  protein of unknown function DUF497  37.35 
 
 		 92 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1491  hypothetical protein  30.95 
 
 		 97 aa  44.3  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1213  hypothetical protein  35.8 
 
 		 83 aa  43.9  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.319817 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0083  hypothetical protein  35.9 
 
 		 87 aa  43.5  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0338  hypothetical protein  34.07 
 
 		 91 aa  42.4  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1723  protein of unknown function DUF497  32.94 
 
 		 90 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.14899  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3787  hypothetical protein  29.07 
 
 		 90 aa  42  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.327341  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3748  protein of unknown function DUF497  35.37 
 
 		 92 aa  41.2  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00610  hypothetical protein  32.1 
 
 		 87 aa  40.8  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2135  hypothetical protein  34.52 
 
 		 99 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.000237812  normal  0.0140128 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2272  hypothetical protein  35.42 
 
 		 99 aa  40.4  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>