42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1491 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_1491  hypothetical protein  100 
 
 
97 aa  196  7e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3787  hypothetical protein  38.55 
 
 
90 aa  59.7  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.327341  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1360  hypothetical protein  38.2 
 
 
89 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.51188  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_7392  hypothetical protein  34.88 
 
 
90 aa  53.9  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0339543  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2438  protein of unknown function DUF497  29.55 
 
 
88 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1757  hypothetical protein  37.93 
 
 
94 aa  50.4  0.000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2093  protein of unknown function DUF497  37.93 
 
 
94 aa  50.4  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.177613  normal  0.105621 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3672  protein of unknown function DUF497  28.41 
 
 
88 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0832  hypothetical protein  34.83 
 
 
98 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000000167324  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0714  hypothetical protein  31.46 
 
 
125 aa  47  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0074508  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1537  protein of unknown function DUF497  35.63 
 
 
94 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0179855 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2884  hypothetical protein  34.83 
 
 
115 aa  45.8  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.443981  normal  0.0702268 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31950  hypothetical protein  32.93 
 
 
89 aa  45.4  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1184  protein of unknown function DUF497  30.95 
 
 
90 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.030767  normal  0.28927 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0092  hypothetical protein  40.91 
 
 
93 aa  44.7  0.0005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.978778 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2638  hypothetical protein  33.71 
 
 
97 aa  44.7  0.0005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.619924 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0286  hypothetical protein  46.81 
 
 
58 aa  43.9  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3563  protein of unknown function DUF497  30.21 
 
 
101 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0533639 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4942  hypothetical protein  37.36 
 
 
93 aa  43.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0665  hypothetical protein  33.71 
 
 
95 aa  43.1  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.45959  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1040  hypothetical protein  29.89 
 
 
89 aa  42.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.138821  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3634  hypothetical protein  32.94 
 
 
96 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.20528  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4512  protein of unknown function DUF497  31.63 
 
 
97 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2051  hypothetical protein  31.11 
 
 
102 aa  42.4  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1009  hypothetical protein  34.41 
 
 
91 aa  42  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1103  hypothetical protein  29.69 
 
 
96 aa  41.6  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0124894  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1213  hypothetical protein  35.29 
 
 
83 aa  41.6  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.319817 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0226  protein of unknown function DUF497  30.59 
 
 
86 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.115808  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1635  hypothetical protein  34.09 
 
 
95 aa  41.2  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1055  hypothetical protein  32.18 
 
 
88 aa  41.2  0.005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0177574  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2135  hypothetical protein  28.12 
 
 
99 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.000237812  normal  0.0140128 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2221  protein of unknown function DUF497  26.88 
 
 
97 aa  40.8  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000287405  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3765  hypothetical protein  30 
 
 
93 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1479  hypothetical protein  32.18 
 
 
105 aa  40.8  0.006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0124462  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2272  hypothetical protein  30.34 
 
 
99 aa  40.4  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1701  protein of unknown function DUF497  32.61 
 
 
92 aa  40.4  0.007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.133917 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1380  hypothetical protein  31.46 
 
 
92 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.26403  normal  0.829125 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3087  protein of unknown function DUF497  28.24 
 
 
92 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3033  protein of unknown function DUF497  28.24 
 
 
92 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.692737  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4530  hypothetical protein  31.46 
 
 
92 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2483  hypothetical protein  32.22 
 
 
99 aa  40  0.009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2106  hypothetical protein  35.23 
 
 
95 aa  40  0.01  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000345649  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>