87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2135 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2135  hypothetical protein  100 
 
 		 99 aa  207  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.000237812  normal  0.0140128 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2483  hypothetical protein  68.69 
 
 		 99 aa  147  3e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1396  hypothetical protein  65.31 
 
 		 99 aa  136  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3295  protein of unknown function DUF497  65.96 
 
 		 103 aa  135  2e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.840265  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4127  protein of unknown function DUF497  59.6 
 
 		 99 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.186992  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0914  protein of unknown function DUF497  55.1 
 
 		 106 aa  110  6e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1052  protein of unknown function DUF497  55.56 
 
 		 106 aa  110  6e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238312 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1479  hypothetical protein  46.39 
 
 		 105 aa  90.5  6e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0124462  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2409  protein of unknown function DUF497  50.53 
 
 		 97 aa  84.3  5e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.65469  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0729  protein of unknown function DUF497  42.55 
 
 		 94 aa  76.6  0.00000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.132197  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0265  protein of unknown function DUF497  47.73 
 
 		 90 aa  75.9  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5629  protein of unknown function DUF497  46.74 
 
 		 96 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.384902 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5052  protein of unknown function DUF497  45.65 
 
 		 94 aa  70.9  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.174132 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2952  hypothetical protein  40.45 
 
 		 98 aa  66.2  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000403961 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0131  hypothetical cytosolic protein  33.33 
 
 		 97 aa  65.1  0.0000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2272  protein of unknown function DUF497  37.93 
 
 		 94 aa  64.3  0.0000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.754948  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2518  protein of unknown function DUF497  40.79 
 
 		 81 aa  63.9  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2195  hypothetical protein  32.22 
 
 		 97 aa  63.5  0.000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5048  protein of unknown function DUF497  41.76 
 
 		 91 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.127602 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0658  hypothetical protein  39.08 
 
 		 97 aa  61.6  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.724327  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2639  hypothetical protein  33.68 
 
 		 97 aa  60.8  0.000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0754679  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0832  hypothetical protein  38.89 
 
 		 98 aa  60.1  0.000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000000167324  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1105  hypothetical protein  41.11 
 
 		 93 aa  60.1  0.000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0714  hypothetical protein  39.36 
 
 		 125 aa  60.1  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0074508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3563  protein of unknown function DUF497  37.62 
 
 		 101 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0533639 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1103  hypothetical protein  35.96 
 
 		 96 aa  59.3  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0124894  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0085  hypothetical protein  36.26 
 
 		 102 aa  58.9  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0788  hypothetical protein  39.53 
 
 		 88 aa  58.2  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3951  protein of unknown function DUF497  35.96 
 
 		 91 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.258424  hitchhiker  0.00220511 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3765  hypothetical protein  34.78 
 
 		 93 aa  57  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1715  protein of unknown function DUF497  36.26 
 
 		 93 aa  57  0.00000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.643907  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2884  hypothetical protein  34.44 
 
 		 115 aa  56.2  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.443981  normal  0.0702268 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3087  protein of unknown function DUF497  36.78 
 
 		 92 aa  53.9  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3033  protein of unknown function DUF497  36.78 
 
 		 92 aa  53.9  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.692737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2221  protein of unknown function DUF497  32.61 
 
 		 97 aa  53.5  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000287405  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3974  hypothetical protein  37.5 
 
 		 115 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.789792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1009  hypothetical protein  34.44 
 
 		 91 aa  52  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2051  hypothetical protein  37.93 
 
 		 102 aa  52  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4438  protein of unknown function DUF497  37.93 
 
 		 92 aa  50.8  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1353  hypothetical protein  33.71 
 
 		 97 aa  50.8  0.000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00336561  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0083  hypothetical protein  36.26 
 
 		 87 aa  50.4  0.000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1055  hypothetical protein  38.64 
 
 		 88 aa  50.8  0.000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0177574  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1635  hypothetical protein  39.33 
 
 		 95 aa  50.4  0.000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1764  protein of unknown function DUF497  37.5 
 
 		 94 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.324756  normal  0.194696 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1486  hypothetical protein  37.5 
 
 		 94 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1034  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4530  hypothetical protein  31.46 
 
 		 92 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1380  hypothetical protein  31.46 
 
 		 92 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.26403  normal  0.829125 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0665  hypothetical protein  31.11 
 
 		 95 aa  50.1  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.45959  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4941  hypothetical protein  33.33 
 
 		 95 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.75621  normal  0.892041 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4934  hypothetical protein  33.33 
 
 		 95 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1518  hypothetical protein  31.25 
 
 		 102 aa  50.1  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4942  hypothetical protein  33.33 
 
 		 93 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5046  hypothetical protein  32.22 
 
 		 92 aa  49.3  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.896322  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0155  hypothetical protein  36.78 
 
 		 95 aa  48.5  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.465237  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0173  hypothetical protein  36.49 
 
 		 79 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.600645  normal  0.57162 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3262  protein of unknown function DUF497  34.48 
 
 		 90 aa  47.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000202958  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1807  hypothetical protein  31.03 
 
 		 110 aa  48.1  0.00004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.729301  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1490  hypothetical protein  36 
 
 		 89 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.755193  normal  0.548062 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2106  hypothetical protein  38.2 
 
 		 95 aa  46.6  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000345649  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0092  hypothetical protein  32.18 
 
 		 93 aa  45.1  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.978778 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2093  protein of unknown function DUF497  35.16 
 
 		 94 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.177613  normal  0.105621 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1757  hypothetical protein  35.16 
 
 		 94 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1969  protein of unknown function DUF497  32.58 
 
 		 92 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1507  hypothetical protein  35.96 
 
 		 93 aa  44.7  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.32717  normal  0.158421 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0188  hypothetical protein  33.71 
 
 		 101 aa  45.1  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3748  protein of unknown function DUF497  31.33 
 
 		 92 aa  44.7  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2523  protein of unknown function DUF497  31.87 
 
 		 87 aa  44.3  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2272  hypothetical protein  32.22 
 
 		 99 aa  44.3  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1315  protein of unknown function DUF497  33.33 
 
 		 93 aa  43.9  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000162456 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1723  protein of unknown function DUF497  35.16 
 
 		 90 aa  43.9  0.0008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.14899  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1331  hypothetical protein  35.23 
 
 		 86 aa  43.1  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.600585  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00610  hypothetical protein  31.87 
 
 		 87 aa  42.7  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1996  protein of unknown function DUF497  31.46 
 
 		 92 aa  42.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.80933  normal  0.0698328 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1720  hypothetical protein  29.35 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000140414  unclonable  0.000000009426 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1537  protein of unknown function DUF497  34.07 
 
 		 94 aa  43.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0179855 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3908  hypothetical protein  32.98 
 
 		 102 aa  42.7  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1112  protein of unknown function DUF497  30.21 
 
 		 101 aa  43.5  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.402358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4512  protein of unknown function DUF497  33.33 
 
 		 97 aa  41.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3823  hypothetical protein  31.11 
 
 		 92 aa  42  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0126375  normal  0.293452 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2414  hypothetical protein  32.18 
 
 		 93 aa  41.6  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.653132  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5033  hypothetical protein  31.25 
 
 		 105 aa  41.6  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.659592  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2045  protein of unknown function DUF497  32.18 
 
 		 93 aa  41.6  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.242597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1491  hypothetical protein  28.12 
 
 		 97 aa  41.2  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1184  protein of unknown function DUF497  34.52 
 
 		 90 aa  40.8  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.030767  normal  0.28927 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1098  hypothetical protein  32.97 
 
 		 97 aa  40.8  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.826789  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2939  hypothetical protein  34.43 
 
 		 85 aa  40.4  0.008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2249  hypothetical protein  41.38 
 
 		 67 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.367779 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>