50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_B2638 on replicon NC_007595
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007595  Synpcc7942_B2638  hypothetical protein  100 
 
 		 97 aa  202  1e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.619924 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3033  protein of unknown function DUF497  40.91 
 
 		 92 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.692737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3087  protein of unknown function DUF497  40.91 
 
 		 92 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2283  hypothetical protein  44.29 
 
 		 67 aa  56.6  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.511105  hitchhiker  0.000116055 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31950  hypothetical protein  43.37 
 
 		 89 aa  55.1  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2272  hypothetical protein  38.37 
 
 		 99 aa  54.3  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1360  hypothetical protein  36.9 
 
 		 89 aa  52.4  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.51188  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3563  protein of unknown function DUF497  42.05 
 
 		 101 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0533639 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4512  protein of unknown function DUF497  36.67 
 
 		 97 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0665  hypothetical protein  39.36 
 
 		 95 aa  49.3  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.45959  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3672  protein of unknown function DUF497  41.38 
 
 		 88 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1353  hypothetical protein  32.61 
 
 		 97 aa  48.5  0.00003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00336561  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2884  hypothetical protein  38.64 
 
 		 115 aa  48.1  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.443981  normal  0.0702268 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0092  hypothetical protein  37.08 
 
 		 93 aa  47.8  0.00005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.978778 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1635  hypothetical protein  38.64 
 
 		 95 aa  47.4  0.00007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2438  protein of unknown function DUF497  41.38 
 
 		 88 aa  47  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4941  hypothetical protein  37.08 
 
 		 95 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.75621  normal  0.892041 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4934  hypothetical protein  37.08 
 
 		 95 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4942  hypothetical protein  34.74 
 
 		 93 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4530  hypothetical protein  28.72 
 
 		 92 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2523  protein of unknown function DUF497  31.4 
 
 		 87 aa  45.8  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0658  hypothetical protein  34.09 
 
 		 97 aa  46.2  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.724327  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1380  hypothetical protein  28.72 
 
 		 92 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.26403  normal  0.829125 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2106  hypothetical protein  37.5 
 
 		 95 aa  45.1  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000345649  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3823  hypothetical protein  32.22 
 
 		 92 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0126375  normal  0.293452 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1009  hypothetical protein  33.7 
 
 		 91 aa  44.7  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3974  hypothetical protein  38.82 
 
 		 115 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.789792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1491  hypothetical protein  33.71 
 
 		 97 aa  44.7  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0083  hypothetical protein  31.4 
 
 		 87 aa  44.7  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3748  protein of unknown function DUF497  33.75 
 
 		 92 aa  44.3  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1641  hypothetical protein, putative phage gene  33.72 
 
 		 87 aa  44.7  0.0005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.248324  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1715  protein of unknown function DUF497  33.72 
 
 		 93 aa  43.5  0.0009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.643907  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1969  protein of unknown function DUF497  32.53 
 
 		 92 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5046  hypothetical protein  37.21 
 
 		 92 aa  42.7  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.896322  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1807  hypothetical protein  28.72 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.729301  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0265  protein of unknown function DUF497  34.12 
 
 		 90 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0188  hypothetical protein  38.27 
 
 		 101 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1490  hypothetical protein  37.5 
 
 		 89 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.755193  normal  0.548062 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0714  hypothetical protein  36.05 
 
 		 125 aa  42.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0074508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2952  hypothetical protein  33.33 
 
 		 98 aa  42.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000403961 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0131  hypothetical cytosolic protein  30.95 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_7363  hypothetical protein  35.14 
 
 		 96 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0640425  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3499  hypothetical protein  36.14 
 
 		 83 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.41867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2763  hypothetical protein  38.2 
 
 		 82 aa  41.6  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0975  hypothetical protein  31.71 
 
 		 106 aa  42  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.024485  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3610  hypothetical protein  31.25 
 
 		 82 aa  40.8  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.754019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2195  hypothetical protein  29.76 
 
 		 97 aa  40.4  0.007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1996  protein of unknown function DUF497  31.33 
 
 		 92 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.80933  normal  0.0698328 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0832  hypothetical protein  30.53 
 
 		 98 aa  40.8  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000000167324  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00610  hypothetical protein  30.23 
 
 		 87 aa  40  0.01  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>