76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0083 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_0083  hypothetical protein  100 
 
 
87 aa  179  9.000000000000001e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2523  protein of unknown function DUF497  70.11 
 
 
87 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0452  hypothetical protein  67.82 
 
 
87 aa  123  8.000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0841161  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00610  hypothetical protein  62.07 
 
 
87 aa  122  2e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1723  protein of unknown function DUF497  62.07 
 
 
90 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.14899  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0581  hypothetical protein  63.53 
 
 
86 aa  111  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1641  hypothetical protein, putative phage gene  55.17 
 
 
87 aa  109  1.0000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.248324  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0410  hypothetical protein  61.63 
 
 
87 aa  107  5e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0226  protein of unknown function DUF497  54.76 
 
 
86 aa  97.4  5e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.115808  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1717  hypothetical protein  54.12 
 
 
102 aa  87  8e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1132  hypothetical protein  48.28 
 
 
90 aa  84.3  4e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0175216  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1494  hypothetical protein  50 
 
 
90 aa  84.3  5e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.334778 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0435  putative toxin-antitoxin system, toxin component  48.24 
 
 
91 aa  84  7e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000190302 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2002  protein of unknown function DUF497  44.58 
 
 
101 aa  66.6  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.145016  hitchhiker  0.000000154329 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1055  hypothetical protein  38.55 
 
 
88 aa  62.4  0.000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0177574  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2952  hypothetical protein  47.13 
 
 
98 aa  61.2  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000403961 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3087  protein of unknown function DUF497  41.86 
 
 
92 aa  60.5  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3033  protein of unknown function DUF497  41.86 
 
 
92 aa  60.5  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.692737  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1331  hypothetical protein  38.55 
 
 
86 aa  57  0.00000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.600585  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0265  protein of unknown function DUF497  37.93 
 
 
90 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1701  protein of unknown function DUF497  39.29 
 
 
92 aa  55.5  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.133917 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1360  hypothetical protein  35.37 
 
 
89 aa  53.9  0.0000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.51188  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0832  hypothetical protein  41.11 
 
 
98 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000000167324  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1213  hypothetical protein  36.14 
 
 
83 aa  52.8  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.319817 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0788  hypothetical protein  40.48 
 
 
88 aa  52  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1105  hypothetical protein  40.45 
 
 
93 aa  51.2  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_7392  hypothetical protein  38.64 
 
 
90 aa  50.8  0.000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0339543  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2135  hypothetical protein  36.26 
 
 
99 aa  50.4  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.000237812  normal  0.0140128 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0188  hypothetical protein  34.48 
 
 
101 aa  50.1  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7347  protein of unknown function DUF497  38.36 
 
 
93 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.155028  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1969  protein of unknown function DUF497  38.27 
 
 
92 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3974  hypothetical protein  38.46 
 
 
115 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.789792  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1764  protein of unknown function DUF497  33.71 
 
 
94 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.324756  normal  0.194696 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1486  hypothetical protein  33.71 
 
 
94 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1034  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4530  hypothetical protein  35.23 
 
 
92 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1009  hypothetical protein  36.78 
 
 
91 aa  48.5  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1380  hypothetical protein  35.23 
 
 
92 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.26403  normal  0.829125 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0092  hypothetical protein  41.18 
 
 
93 aa  48.5  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.978778 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0155  hypothetical protein  32.18 
 
 
95 aa  48.1  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.465237  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1040  hypothetical protein  30.95 
 
 
89 aa  48.1  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.138821  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1715  protein of unknown function DUF497  36.67 
 
 
93 aa  48.1  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.643907  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3748  protein of unknown function DUF497  32.95 
 
 
92 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1112  protein of unknown function DUF497  37.63 
 
 
101 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.402358  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5052  protein of unknown function DUF497  32.56 
 
 
94 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.174132 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1996  protein of unknown function DUF497  37.04 
 
 
92 aa  47.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.80933  normal  0.0698328 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1103  hypothetical protein  35.8 
 
 
96 aa  47.4  0.00007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0124894  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2272  protein of unknown function DUF497  34.09 
 
 
94 aa  46.2  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.754948  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0085  hypothetical protein  36.59 
 
 
102 aa  45.4  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3672  protein of unknown function DUF497  34.52 
 
 
88 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3339  hypothetical protein  32.94 
 
 
92 aa  45.1  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.261034  normal  0.0313812 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3787  hypothetical protein  35.29 
 
 
90 aa  44.7  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.327341  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1152  hypothetical protein  30.95 
 
 
98 aa  44.3  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.231422 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3908  hypothetical protein  37.23 
 
 
102 aa  44.7  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2638  hypothetical protein  31.4 
 
 
97 aa  44.7  0.0005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.619924 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1353  hypothetical protein  33.71 
 
 
97 aa  44.3  0.0006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00336561  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2221  protein of unknown function DUF497  32.58 
 
 
97 aa  43.9  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000287405  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5048  protein of unknown function DUF497  33.33 
 
 
91 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.127602 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_7363  hypothetical protein  32.94 
 
 
96 aa  43.9  0.0008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0640425  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1184  protein of unknown function DUF497  35.9 
 
 
90 aa  43.5  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.030767  normal  0.28927 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2438  protein of unknown function DUF497  33.33 
 
 
88 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1315  protein of unknown function DUF497  34.88 
 
 
93 aa  42.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000162456 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4942  hypothetical protein  38.3 
 
 
93 aa  42.4  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0131  hypothetical cytosolic protein  32.95 
 
 
97 aa  42.4  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0665  hypothetical protein  36.05 
 
 
95 aa  42  0.003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.45959  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1490  hypothetical protein  43.06 
 
 
89 aa  42  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.755193  normal  0.548062 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3765  hypothetical protein  33.33 
 
 
93 aa  41.6  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2639  hypothetical protein  31.4 
 
 
97 aa  41.6  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0754679  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3823  hypothetical protein  30.59 
 
 
92 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0126375  normal  0.293452 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2478  hypothetical protein  38.67 
 
 
88 aa  41.2  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.513735  normal  0.240444 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0714  hypothetical protein  31.82 
 
 
125 aa  41.6  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0074508  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4941  hypothetical protein  33.33 
 
 
95 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.75621  normal  0.892041 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4934  hypothetical protein  33.33 
 
 
95 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2884  hypothetical protein  34.88 
 
 
115 aa  40.8  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.443981  normal  0.0702268 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1098  hypothetical protein  32.94 
 
 
97 aa  40.4  0.007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.826789  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31950  hypothetical protein  29.76 
 
 
89 aa  40.4  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2195  hypothetical protein  31.82 
 
 
97 aa  40.4  0.008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>