47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1213 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1213  hypothetical protein  100 
 
 		 83 aa  167  5e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.319817 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3226  protein of unknown function DUF497  50.6 
 
 		 95 aa  80.9  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.720273  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1040  hypothetical protein  47.67 
 
 		 89 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.138821  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1701  protein of unknown function DUF497  48.28 
 
 		 92 aa  71.6  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.133917 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1055  hypothetical protein  42.35 
 
 		 88 aa  59.7  0.00000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0177574  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2070  hypothetical protein  41.18 
 
 		 90 aa  60.1  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00017339  hitchhiker  0.0000419311 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2295  hypothetical protein  39.76 
 
 		 83 aa  55.5  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0555295  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1331  hypothetical protein  42.35 
 
 		 86 aa  54.3  0.0000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.600585  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2869  hypothetical protein  36.78 
 
 		 117 aa  53.9  0.0000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0108538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3100  hypothetical protein  34.12 
 
 		 92 aa  53.5  0.0000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3339  hypothetical protein  40.45 
 
 		 92 aa  53.5  0.0000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.261034  normal  0.0313812 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00610  hypothetical protein  32.53 
 
 		 87 aa  53.5  0.0000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3974  hypothetical protein  41.98 
 
 		 115 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.789792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1723  protein of unknown function DUF497  36.9 
 
 		 90 aa  52.4  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.14899  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0083  hypothetical protein  36.14 
 
 		 87 aa  52.8  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0435  putative toxin-antitoxin system, toxin component  31.76 
 
 		 91 aa  50.1  0.00001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000190302 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2523  protein of unknown function DUF497  37.35 
 
 		 87 aa  49.3  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0226  protein of unknown function DUF497  34.52 
 
 		 86 aa  47.4  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.115808  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0452  hypothetical protein  32.95 
 
 		 87 aa  46.6  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0841161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5048  protein of unknown function DUF497  36.78 
 
 		 91 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.127602 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4512  protein of unknown function DUF497  34.83 
 
 		 97 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2521  hypothetical protein  45.31 
 
 		 64 aa  46.2  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.789328  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1132  hypothetical protein  31.71 
 
 		 90 aa  45.1  0.0003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0175216  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2093  protein of unknown function DUF497  41.38 
 
 		 94 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.177613  normal  0.105621 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2438  protein of unknown function DUF497  29.21 
 
 		 88 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1757  hypothetical protein  41.38 
 
 		 94 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0542  hypothetical protein  41.07 
 
 		 85 aa  44.3  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.926039  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1184  protein of unknown function DUF497  35.8 
 
 		 90 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.030767  normal  0.28927 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1641  hypothetical protein, putative phage gene  27.06 
 
 		 87 aa  43.9  0.0007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.248324  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0410  hypothetical protein  32.1 
 
 		 87 aa  43.5  0.0009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1635  hypothetical protein  31.82 
 
 		 95 aa  43.1  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0581  hypothetical protein  34.12 
 
 		 86 aa  43.5  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2002  protein of unknown function DUF497  31.33 
 
 		 101 aa  43.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.145016  hitchhiker  0.000000154329 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0155  hypothetical protein  34.88 
 
 		 95 aa  43.5  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.465237  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3672  protein of unknown function DUF497  29.41 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3262  protein of unknown function DUF497  36.05 
 
 		 90 aa  41.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000202958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3033  protein of unknown function DUF497  32.94 
 
 		 92 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.692737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3087  protein of unknown function DUF497  32.94 
 
 		 92 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1491  hypothetical protein  35.29 
 
 		 97 aa  41.6  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1152  hypothetical protein  38.27 
 
 		 98 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.231422 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1494  hypothetical protein  31.25 
 
 		 90 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.334778 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2631  hypothetical protein  29.89 
 
 		 92 aa  41.2  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.268896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3634  hypothetical protein  35.29 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.20528  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2221  protein of unknown function DUF497  33.33 
 
 		 97 aa  40.8  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000287405  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2106  hypothetical protein  31.82 
 
 		 95 aa  41.2  0.006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000345649  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3787  hypothetical protein  31.4 
 
 		 90 aa  40.8  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.327341  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0832  hypothetical protein  32.18 
 
 		 98 aa  40.4  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000000167324  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>