76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1723 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1723  protein of unknown function DUF497  100 
 
 
90 aa  181  3e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.14899  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0410  hypothetical protein  72.41 
 
 
87 aa  132  9.999999999999999e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0452  hypothetical protein  71.26 
 
 
87 aa  130  6.999999999999999e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0841161  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00610  hypothetical protein  67.82 
 
 
87 aa  129  1.0000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0581  hypothetical protein  66.28 
 
 
86 aa  123  7e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1641  hypothetical protein, putative phage gene  60.92 
 
 
87 aa  115  1.9999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.248324  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0083  hypothetical protein  62.07 
 
 
87 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2523  protein of unknown function DUF497  63.22 
 
 
87 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0226  protein of unknown function DUF497  54.65 
 
 
86 aa  100  7e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.115808  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1494  hypothetical protein  55.95 
 
 
90 aa  97.8  5e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.334778 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1717  hypothetical protein  52.33 
 
 
102 aa  91.3  4e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1132  hypothetical protein  50 
 
 
90 aa  90.9  6e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0175216  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0435  putative toxin-antitoxin system, toxin component  48.84 
 
 
91 aa  84.7  4e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000190302 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2002  protein of unknown function DUF497  50.57 
 
 
101 aa  83.6  8e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.145016  hitchhiker  0.000000154329 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3087  protein of unknown function DUF497  39.33 
 
 
92 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3033  protein of unknown function DUF497  39.33 
 
 
92 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.692737  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0265  protein of unknown function DUF497  37.5 
 
 
90 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1715  protein of unknown function DUF497  41.11 
 
 
93 aa  59.3  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.643907  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2952  hypothetical protein  45.05 
 
 
98 aa  58.5  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000403961 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0714  hypothetical protein  39.33 
 
 
125 aa  54.3  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0074508  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1360  hypothetical protein  40.74 
 
 
89 aa  53.5  0.0000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.51188  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0832  hypothetical protein  40.91 
 
 
98 aa  52.8  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000000167324  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1213  hypothetical protein  36.9 
 
 
83 aa  52.4  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.319817 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3765  hypothetical protein  35.16 
 
 
93 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2639  hypothetical protein  32.95 
 
 
97 aa  52.8  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0754679  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1055  hypothetical protein  35.29 
 
 
88 aa  52.4  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0177574  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5048  protein of unknown function DUF497  32.95 
 
 
91 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.127602 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3672  protein of unknown function DUF497  36.47 
 
 
88 aa  50.8  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5052  protein of unknown function DUF497  32.95 
 
 
94 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.174132 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0788  hypothetical protein  36.36 
 
 
88 aa  50.8  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1105  hypothetical protein  40.22 
 
 
93 aa  50.4  0.000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3974  hypothetical protein  36.47 
 
 
115 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.789792  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0131  hypothetical cytosolic protein  31.87 
 
 
97 aa  48.9  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1103  hypothetical protein  35.14 
 
 
96 aa  48.9  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0124894  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0085  hypothetical protein  36.36 
 
 
102 aa  49.3  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2438  protein of unknown function DUF497  36.47 
 
 
88 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1380  hypothetical protein  36.36 
 
 
92 aa  47.8  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.26403  normal  0.829125 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2221  protein of unknown function DUF497  35.56 
 
 
97 aa  48.1  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000287405  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0658  hypothetical protein  38.89 
 
 
97 aa  48.1  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.724327  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4530  hypothetical protein  36.36 
 
 
92 aa  47.8  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1701  protein of unknown function DUF497  39.08 
 
 
92 aa  47.8  0.00005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.133917 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2195  hypothetical protein  30.77 
 
 
97 aa  47.4  0.00006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1807  hypothetical protein  37.5 
 
 
110 aa  47  0.00008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.729301  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1331  hypothetical protein  35.29 
 
 
86 aa  46.6  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.600585  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1009  hypothetical protein  36.36 
 
 
91 aa  46.6  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7347  protein of unknown function DUF497  39.19 
 
 
93 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.155028  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1479  hypothetical protein  30.77 
 
 
105 aa  46.2  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0124462  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4512  protein of unknown function DUF497  37.21 
 
 
97 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2272  protein of unknown function DUF497  32.58 
 
 
94 aa  45.8  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.754948  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_7392  hypothetical protein  38.1 
 
 
90 aa  45.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0339543  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1969  protein of unknown function DUF497  38.04 
 
 
92 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1764  protein of unknown function DUF497  32.58 
 
 
94 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.324756  normal  0.194696 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1486  hypothetical protein  32.58 
 
 
94 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1034  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0188  hypothetical protein  35.23 
 
 
101 aa  44.7  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0155  hypothetical protein  32.29 
 
 
95 aa  44.3  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.465237  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3951  protein of unknown function DUF497  30 
 
 
91 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.258424  hitchhiker  0.00220511 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0665  hypothetical protein  35.63 
 
 
95 aa  44.3  0.0006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.45959  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4942  hypothetical protein  36.96 
 
 
93 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0092  hypothetical protein  38.2 
 
 
93 aa  43.9  0.0007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.978778 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2518  protein of unknown function DUF497  35.9 
 
 
81 aa  43.5  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2135  hypothetical protein  35.16 
 
 
99 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.000237812  normal  0.0140128 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3787  hypothetical protein  34.09 
 
 
90 aa  43.5  0.0008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.327341  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1040  hypothetical protein  34.12 
 
 
89 aa  43.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.138821  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1996  protein of unknown function DUF497  36.96 
 
 
92 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.80933  normal  0.0698328 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_7363  hypothetical protein  37.93 
 
 
96 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0640425  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31950  hypothetical protein  33.33 
 
 
89 aa  42.4  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1490  hypothetical protein  40.54 
 
 
89 aa  42  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.755193  normal  0.548062 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1635  hypothetical protein  34.44 
 
 
95 aa  42  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1184  protein of unknown function DUF497  32.94 
 
 
90 aa  42  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.030767  normal  0.28927 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3262  protein of unknown function DUF497  37.5 
 
 
90 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000202958  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2884  hypothetical protein  34.48 
 
 
115 aa  42  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.443981  normal  0.0702268 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3908  hypothetical protein  34.02 
 
 
102 aa  41.6  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3563  protein of unknown function DUF497  27.47 
 
 
101 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0533639 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3748  protein of unknown function DUF497  37.35 
 
 
92 aa  40.8  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1152  hypothetical protein  30.23 
 
 
98 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.231422 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3339  hypothetical protein  33.71 
 
 
92 aa  40  0.01  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.261034  normal  0.0313812 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>