104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0155 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0155  hypothetical protein  100 
 
 		 95 aa  199  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.465237  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0265  protein of unknown function DUF497  52.27 
 
 		 90 aa  94.4  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0788  hypothetical protein  47.73 
 
 		 88 aa  92.4  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1009  hypothetical protein  52.17 
 
 		 91 aa  89.4  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3951  protein of unknown function DUF497  44.57 
 
 		 91 aa  84.7  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.258424  hitchhiker  0.00220511 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5048  protein of unknown function DUF497  45.65 
 
 		 91 aa  82  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.127602 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0832  hypothetical protein  47.83 
 
 		 98 aa  79.7  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000000167324  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1105  hypothetical protein  45.65 
 
 		 93 aa  78.2  0.00000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1486  hypothetical protein  44.71 
 
 		 94 aa  73.6  0.0000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1764  protein of unknown function DUF497  44.71 
 
 		 94 aa  73.6  0.0000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.324756  normal  0.194696 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1112  protein of unknown function DUF497  45.26 
 
 		 101 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.402358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1315  protein of unknown function DUF497  45.98 
 
 		 93 aa  72  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000162456 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5052  protein of unknown function DUF497  46.99 
 
 		 94 aa  71.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.174132 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2884  hypothetical protein  45.98 
 
 		 115 aa  69.7  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.443981  normal  0.0702268 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2952  hypothetical protein  42.22 
 
 		 98 aa  70.1  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000403961 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1715  protein of unknown function DUF497  39.33 
 
 		 93 aa  69.7  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.643907  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0131  hypothetical cytosolic protein  44.19 
 
 		 97 aa  69.3  0.00000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2045  protein of unknown function DUF497  44.83 
 
 		 93 aa  68.2  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.242597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2414  hypothetical protein  44.83 
 
 		 93 aa  68.2  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.653132  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2195  hypothetical protein  43.02 
 
 		 97 aa  67.4  0.00000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0665  hypothetical protein  44.44 
 
 		 95 aa  65.1  0.0000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.45959  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0714  hypothetical protein  38.2 
 
 		 125 aa  64.3  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0074508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5046  hypothetical protein  44.32 
 
 		 92 aa  63.2  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.896322  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3087  protein of unknown function DUF497  35.56 
 
 		 92 aa  61.6  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3033  protein of unknown function DUF497  35.56 
 
 		 92 aa  61.6  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.692737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1132  hypothetical protein  36.67 
 
 		 90 aa  61.6  0.000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0175216  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3563  protein of unknown function DUF497  38.46 
 
 		 101 aa  61.6  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0533639 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3672  protein of unknown function DUF497  36.36 
 
 		 88 aa  61.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0658  hypothetical protein  44.83 
 
 		 97 aa  60.8  0.000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.724327  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2478  hypothetical protein  46.48 
 
 		 88 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.513735  normal  0.240444 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2051  hypothetical protein  40.48 
 
 		 102 aa  58.9  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1507  hypothetical protein  38.64 
 
 		 93 aa  59.3  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.32717  normal  0.158421 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2272  protein of unknown function DUF497  37.36 
 
 		 94 aa  59.3  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.754948  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1353  hypothetical protein  37.23 
 
 		 97 aa  58.5  0.00000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00336561  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2438  protein of unknown function DUF497  35.23 
 
 		 88 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1354  hypothetical protein  38.37 
 
 		 90 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00877367  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0092  hypothetical protein  39.77 
 
 		 93 aa  56.6  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.978778 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4934  hypothetical protein  40 
 
 		 95 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4941  hypothetical protein  40 
 
 		 95 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.75621  normal  0.892041 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31950  hypothetical protein  40 
 
 		 89 aa  56.6  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2523  protein of unknown function DUF497  40 
 
 		 87 aa  56.2  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2272  hypothetical protein  41.76 
 
 		 99 aa  55.5  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3823  hypothetical protein  40.91 
 
 		 92 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0126375  normal  0.293452 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4512  protein of unknown function DUF497  36.78 
 
 		 97 aa  55.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4530  hypothetical protein  36.05 
 
 		 92 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5033  hypothetical protein  38.54 
 
 		 105 aa  55.5  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.659592  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1380  hypothetical protein  36.05 
 
 		 92 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.26403  normal  0.829125 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4942  hypothetical protein  37.78 
 
 		 93 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1040  hypothetical protein  39.56 
 
 		 89 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.138821  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0435  putative toxin-antitoxin system, toxin component  34.44 
 
 		 91 aa  54.3  0.0000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000190302 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3908  hypothetical protein  33.33 
 
 		 102 aa  53.1  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1757  hypothetical protein  41.86 
 
 		 94 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2221  protein of unknown function DUF497  35.87 
 
 		 97 aa  53.1  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000287405  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2093  protein of unknown function DUF497  41.86 
 
 		 94 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.177613  normal  0.105621 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1701  protein of unknown function DUF497  40.23 
 
 		 92 aa  53.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.133917 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1641  hypothetical protein, putative phage gene  37.5 
 
 		 87 aa  52.4  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.248324  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1969  protein of unknown function DUF497  34.83 
 
 		 92 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0226  protein of unknown function DUF497  34.09 
 
 		 86 aa  52.4  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.115808  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1006  hypothetical protein  34.88 
 
 		 90 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.779657  normal  0.61 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00610  hypothetical protein  34.48 
 
 		 87 aa  52  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2518  protein of unknown function DUF497  39.47 
 
 		 81 aa  50.1  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1996  protein of unknown function DUF497  33.71 
 
 		 92 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.80933  normal  0.0698328 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3748  protein of unknown function DUF497  34.83 
 
 		 92 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2135  hypothetical protein  36.78 
 
 		 99 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.000237812  normal  0.0140128 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7347  protein of unknown function DUF497  39.51 
 
 		 93 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.155028  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0083  hypothetical protein  32.18 
 
 		 87 aa  48.1  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3262  protein of unknown function DUF497  34.78 
 
 		 90 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000202958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2631  hypothetical protein  31.46 
 
 		 92 aa  47.4  0.00006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.268896  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1635  hypothetical protein  35.87 
 
 		 95 aa  47  0.00008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3339  hypothetical protein  40.22 
 
 		 92 aa  47  0.00009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.261034  normal  0.0313812 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0410  hypothetical protein  34.12 
 
 		 87 aa  47  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2070  hypothetical protein  35.16 
 
 		 90 aa  46.6  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00017339  hitchhiker  0.0000419311 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1055  hypothetical protein  35.63 
 
 		 88 aa  47  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0177574  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1537  protein of unknown function DUF497  39.53 
 
 		 94 aa  47  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0179855 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2002  protein of unknown function DUF497  35.96 
 
 		 101 aa  46.6  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.145016  hitchhiker  0.000000154329 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0085  hypothetical protein  36 
 
 		 102 aa  45.4  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0188  hypothetical protein  35.71 
 
 		 101 aa  45.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3974  hypothetical protein  33.33 
 
 		 115 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.789792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0581  hypothetical protein  33.68 
 
 		 86 aa  45.4  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0927  protein of unknown function DUF497  36.36 
 
 		 89 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.317041 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1807  hypothetical protein  29.55 
 
 		 110 aa  45.1  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.729301  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1098  hypothetical protein  36.14 
 
 		 97 aa  45.1  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.826789  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2639  hypothetical protein  35 
 
 		 97 aa  45.4  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0754679  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0914  protein of unknown function DUF497  30.68 
 
 		 106 aa  45.1  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1723  protein of unknown function DUF497  32.29 
 
 		 90 aa  44.3  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.14899  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0452  hypothetical protein  31.76 
 
 		 87 aa  44.3  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0841161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1494  hypothetical protein  35.63 
 
 		 90 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.334778 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2106  hypothetical protein  33.7 
 
 		 95 aa  43.5  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000345649  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2483  hypothetical protein  36.36 
 
 		 99 aa  43.5  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1887  hypothetical protein  31.25 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.584015  normal  0.325304 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1213  hypothetical protein  34.88 
 
 		 83 aa  43.5  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.319817 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2295  hypothetical protein  36.47 
 
 		 83 aa  43.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0555295  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1331  hypothetical protein  38.1 
 
 		 86 aa  43.1  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.600585  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1152  hypothetical protein  33.33 
 
 		 98 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.231422 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4438  protein of unknown function DUF497  34.09 
 
 		 92 aa  42.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3765  hypothetical protein  34.67 
 
 		 93 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0338  hypothetical protein  32.97 
 
 		 91 aa  42  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1052  protein of unknown function DUF497  31.4 
 
 		 106 aa  42  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238312 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3787  hypothetical protein  28.89 
 
 		 90 aa  42  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.327341  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1360  hypothetical protein  32.14 
 
 		 89 aa  41.6  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.51188  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>