43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_2295 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A2070  hypothetical protein  100 
 
 		 90 aa  170  6.999999999999999e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00017339  hitchhiker  0.0000419311 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2295  hypothetical protein  100 
 
 		 83 aa  169  9e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0555295  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3100  hypothetical protein  56.63 
 
 		 92 aa  103  6e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2869  hypothetical protein  54.22 
 
 		 117 aa  97.4  6e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0108538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1055  hypothetical protein  50.6 
 
 		 88 aa  82.8  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0177574  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1040  hypothetical protein  45.78 
 
 		 89 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.138821  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2631  hypothetical protein  40.96 
 
 		 92 aa  76.6  0.0000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.268896  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1331  hypothetical protein  49.4 
 
 		 86 aa  75.5  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.600585  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1184  protein of unknown function DUF497  48.15 
 
 		 90 aa  73.6  0.0000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.030767  normal  0.28927 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1006  hypothetical protein  40.96 
 
 		 90 aa  70.5  0.000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.779657  normal  0.61 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3339  hypothetical protein  42.53 
 
 		 92 aa  66.2  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.261034  normal  0.0313812 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1354  hypothetical protein  38.27 
 
 		 90 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00877367  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3262  protein of unknown function DUF497  42.68 
 
 		 90 aa  61.6  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000202958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1701  protein of unknown function DUF497  39.02 
 
 		 92 aa  59.7  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.133917 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4929  protein of unknown function DUF497  40.74 
 
 		 92 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1213  hypothetical protein  39.76 
 
 		 83 aa  55.5  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.319817 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3634  hypothetical protein  34.57 
 
 		 96 aa  56.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.20528  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3226  protein of unknown function DUF497  33.33 
 
 		 95 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.720273  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2437  hypothetical protein  35.37 
 
 		 95 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0403567 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0542  hypothetical protein  34.67 
 
 		 85 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.926039  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1757  hypothetical protein  37.35 
 
 		 94 aa  50.4  0.000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2093  protein of unknown function DUF497  37.35 
 
 		 94 aa  50.4  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.177613  normal  0.105621 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4438  protein of unknown function DUF497  33.33 
 
 		 92 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1887  hypothetical protein  32.14 
 
 		 111 aa  49.3  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.584015  normal  0.325304 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1152  hypothetical protein  37.18 
 
 		 98 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.231422 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1486  hypothetical protein  36.25 
 
 		 94 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_7392  hypothetical protein  35.37 
 
 		 90 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0339543  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1764  protein of unknown function DUF497  36.25 
 
 		 94 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.324756  normal  0.194696 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3823  hypothetical protein  33.33 
 
 		 92 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0126375  normal  0.293452 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2263  hypothetical protein  34.12 
 
 		 93 aa  47.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.486123 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0435  putative toxin-antitoxin system, toxin component  29.63 
 
 		 91 aa  46.2  0.0002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000190302 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3787  hypothetical protein  34.15 
 
 		 90 aa  45.4  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.327341  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1537  protein of unknown function DUF497  32.53 
 
 		 94 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0179855 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4530  hypothetical protein  33.33 
 
 		 92 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2884  hypothetical protein  32.94 
 
 		 115 aa  43.9  0.0008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.443981  normal  0.0702268 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1380  hypothetical protein  33.33 
 
 		 92 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.26403  normal  0.829125 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0155  hypothetical protein  36.47 
 
 		 95 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.465237  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0226  protein of unknown function DUF497  34.52 
 
 		 86 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.115808  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0927  protein of unknown function DUF497  30.86 
 
 		 89 aa  41.6  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.317041 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2438  protein of unknown function DUF497  25.93 
 
 		 88 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2521  hypothetical protein  36.51 
 
 		 64 aa  40.8  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.789328  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2249  hypothetical protein  41.51 
 
 		 67 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.367779 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3765  hypothetical protein  31.51 
 
 		 93 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>