30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2437 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2437  hypothetical protein  100 
 
 		 95 aa  196  7.999999999999999e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0403567 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2263  hypothetical protein  51.61 
 
 		 93 aa  98.2  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.486123 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1006  hypothetical protein  50.55 
 
 		 90 aa  93.6  9e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.779657  normal  0.61 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2631  hypothetical protein  45.16 
 
 		 92 aa  83.6  8e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.268896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1354  hypothetical protein  49.43 
 
 		 90 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00877367  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4929  protein of unknown function DUF497  49.46 
 
 		 92 aa  71.2  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1887  hypothetical protein  41.46 
 
 		 111 aa  60.8  0.000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.584015  normal  0.325304 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2070  hypothetical protein  34.88 
 
 		 90 aa  58.2  0.00000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00017339  hitchhiker  0.0000419311 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2295  hypothetical protein  35.37 
 
 		 83 aa  57  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0555295  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1184  protein of unknown function DUF497  34.09 
 
 		 90 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.030767  normal  0.28927 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1040  hypothetical protein  34.15 
 
 		 89 aa  53.1  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.138821  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1969  protein of unknown function DUF497  36.05 
 
 		 92 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0927  protein of unknown function DUF497  36.36 
 
 		 89 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.317041 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1996  protein of unknown function DUF497  37.68 
 
 		 92 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.80933  normal  0.0698328 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3100  hypothetical protein  36.59 
 
 		 92 aa  50.8  0.000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4512  protein of unknown function DUF497  34.48 
 
 		 97 aa  47.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3634  hypothetical protein  37.35 
 
 		 96 aa  47.4  0.00006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.20528  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2869  hypothetical protein  32.93 
 
 		 117 aa  44.3  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0108538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3339  hypothetical protein  30.77 
 
 		 92 aa  44.3  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.261034  normal  0.0313812 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0788  hypothetical protein  33.73 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3823  hypothetical protein  29.55 
 
 		 92 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0126375  normal  0.293452 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0542  hypothetical protein  38 
 
 		 85 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.926039  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4438  protein of unknown function DUF497  31.18 
 
 		 92 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3748  protein of unknown function DUF497  33.33 
 
 		 92 aa  42  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_7363  hypothetical protein  33.78 
 
 		 96 aa  41.6  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0640425  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1757  hypothetical protein  41.18 
 
 		 94 aa  41.2  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2093  protein of unknown function DUF497  41.18 
 
 		 94 aa  41.2  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.177613  normal  0.105621 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3176  hypothetical protein  27.47 
 
 		 85 aa  40.8  0.007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000790904  normal  0.0520266 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1213  hypothetical protein  33.72 
 
 		 83 aa  40.4  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.319817 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1055  hypothetical protein  34.15 
 
 		 88 aa  40.4  0.008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0177574  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>