88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1315 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_1315  protein of unknown function DUF497  100 
 
 		 93 aa  192  1e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000162456 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2045  protein of unknown function DUF497  93.55 
 
 		 93 aa  179  8.000000000000001e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.242597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2414  hypothetical protein  93.55 
 
 		 93 aa  179  8.000000000000001e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.653132  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1009  hypothetical protein  54.44 
 
 		 91 aa  97.4  6e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0788  hypothetical protein  51.72 
 
 		 88 aa  86.3  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0265  protein of unknown function DUF497  46.67 
 
 		 90 aa  76.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1105  hypothetical protein  47.19 
 
 		 93 aa  76.3  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0832  hypothetical protein  44.09 
 
 		 98 aa  73.2  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000000167324  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1715  protein of unknown function DUF497  42.39 
 
 		 93 aa  72  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.643907  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0155  hypothetical protein  45.98 
 
 		 95 aa  72  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.465237  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2051  hypothetical protein  42.7 
 
 		 102 aa  69.3  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0714  hypothetical protein  44.68 
 
 		 125 aa  67.4  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0074508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0665  hypothetical protein  44.68 
 
 		 95 aa  65.9  0.0000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.45959  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1353  hypothetical protein  41.76 
 
 		 97 aa  65.1  0.0000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00336561  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5046  hypothetical protein  44.32 
 
 		 92 aa  63.9  0.0000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.896322  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2952  hypothetical protein  40.91 
 
 		 98 aa  63.5  0.0000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000403961 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5048  protein of unknown function DUF497  37.36 
 
 		 91 aa  63.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.127602 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2272  protein of unknown function DUF497  40.22 
 
 		 94 aa  63.2  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.754948  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3951  protein of unknown function DUF497  40.91 
 
 		 91 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.258424  hitchhiker  0.00220511 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5052  protein of unknown function DUF497  40.66 
 
 		 94 aa  62  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.174132 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3563  protein of unknown function DUF497  42.22 
 
 		 101 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0533639 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4942  hypothetical protein  39.78 
 
 		 93 aa  62  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1764  protein of unknown function DUF497  45.98 
 
 		 94 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.324756  normal  0.194696 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1486  hypothetical protein  45.98 
 
 		 94 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3823  hypothetical protein  46.07 
 
 		 92 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0126375  normal  0.293452 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1112  protein of unknown function DUF497  40.86 
 
 		 101 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.402358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3672  protein of unknown function DUF497  34.48 
 
 		 88 aa  60.8  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3748  protein of unknown function DUF497  40.23 
 
 		 92 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4530  hypothetical protein  43.82 
 
 		 92 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1380  hypothetical protein  43.82 
 
 		 92 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.26403  normal  0.829125 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0131  hypothetical cytosolic protein  37.08 
 
 		 97 aa  59.7  0.00000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31950  hypothetical protein  42.05 
 
 		 89 aa  59.7  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4934  hypothetical protein  41.94 
 
 		 95 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4941  hypothetical protein  41.94 
 
 		 95 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.75621  normal  0.892041 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2272  hypothetical protein  41.94 
 
 		 99 aa  58.5  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1969  protein of unknown function DUF497  40.7 
 
 		 92 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2438  protein of unknown function DUF497  33.33 
 
 		 88 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0658  hypothetical protein  38.2 
 
 		 97 aa  58.2  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.724327  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2195  hypothetical protein  35.96 
 
 		 97 aa  58.2  0.00000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3087  protein of unknown function DUF497  38.71 
 
 		 92 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2884  hypothetical protein  45.45 
 
 		 115 aa  57.8  0.00000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.443981  normal  0.0702268 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1098  hypothetical protein  41.18 
 
 		 97 aa  57.8  0.00000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.826789  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3033  protein of unknown function DUF497  38.71 
 
 		 92 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.692737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5033  hypothetical protein  38.54 
 
 		 105 aa  57.4  0.00000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.659592  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6975  protein of unknown function DUF497  44.05 
 
 		 81 aa  57  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3974  hypothetical protein  38.82 
 
 		 115 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.789792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2093  protein of unknown function DUF497  43.82 
 
 		 94 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.177613  normal  0.105621 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1757  hypothetical protein  43.82 
 
 		 94 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1996  protein of unknown function DUF497  39.53 
 
 		 92 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.80933  normal  0.0698328 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2221  protein of unknown function DUF497  35.16 
 
 		 97 aa  54.7  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000287405  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1635  hypothetical protein  38.71 
 
 		 95 aa  53.9  0.0000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3908  hypothetical protein  38.95 
 
 		 102 aa  53.9  0.0000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2518  protein of unknown function DUF497  40.79 
 
 		 81 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1533  hypothetical protein  35.23 
 
 		 86 aa  53.1  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1537  protein of unknown function DUF497  42.7 
 
 		 94 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0179855 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0338  hypothetical protein  35.23 
 
 		 91 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1360  hypothetical protein  38.37 
 
 		 89 aa  51.6  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.51188  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0975  hypothetical protein  35.29 
 
 		 106 aa  52  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.024485  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2106  hypothetical protein  38.95 
 
 		 95 aa  51.6  0.000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000345649  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0092  hypothetical protein  38.2 
 
 		 93 aa  50.4  0.000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.978778 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4512  protein of unknown function DUF497  39.33 
 
 		 97 aa  50.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0188  hypothetical protein  39.08 
 
 		 101 aa  50.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1006  hypothetical protein  40 
 
 		 90 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.779657  normal  0.61 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1052  protein of unknown function DUF497  31.4 
 
 		 106 aa  48.5  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238312 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2483  hypothetical protein  36.78 
 
 		 99 aa  47.8  0.00005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4127  protein of unknown function DUF497  36.78 
 
 		 99 aa  47.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.186992  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0914  protein of unknown function DUF497  30.77 
 
 		 106 aa  47  0.00008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3339  hypothetical protein  36.26 
 
 		 92 aa  47  0.00008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.261034  normal  0.0313812 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3499  hypothetical protein  34.83 
 
 		 83 aa  47  0.00008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.41867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3634  hypothetical protein  37.5 
 
 		 96 aa  46.2  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.20528  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3176  hypothetical protein  35.23 
 
 		 85 aa  45.4  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000790904  normal  0.0520266 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2263  hypothetical protein  39.08 
 
 		 93 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.486123 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1807  hypothetical protein  34.48 
 
 		 110 aa  45.8  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.729301  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1040  hypothetical protein  36.26 
 
 		 89 aa  45.1  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.138821  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1507  hypothetical protein  36.26 
 
 		 93 aa  44.7  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.32717  normal  0.158421 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7347  protein of unknown function DUF497  40 
 
 		 93 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.155028  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1490  hypothetical protein  34.67 
 
 		 89 aa  44.3  0.0007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.755193  normal  0.548062 
 
 
-
 
NC_013737  Slin_7052  protein of unknown function DUF497  34.78 
 
 		 98 aa  43.9  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1354  hypothetical protein  40 
 
 		 90 aa  43.9  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00877367  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2135  hypothetical protein  33.33 
 
 		 99 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.000237812  normal  0.0140128 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2763  hypothetical protein  31.76 
 
 		 82 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0083  hypothetical protein  34.88 
 
 		 87 aa  42.7  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1396  hypothetical protein  37.36 
 
 		 99 aa  42.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1103  hypothetical protein  32.95 
 
 		 96 aa  42  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0124894  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3610  hypothetical protein  33.33 
 
 		 82 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.754019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2478  hypothetical protein  45.95 
 
 		 88 aa  41.6  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.513735  normal  0.240444 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2409  protein of unknown function DUF497  31.82 
 
 		 97 aa  41.2  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.65469  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2631  hypothetical protein  35.87 
 
 		 92 aa  40.4  0.008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.268896  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>