26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2409 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2409  protein of unknown function DUF497  100 
 
 		 97 aa  203  6e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.65469  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5629  protein of unknown function DUF497  60 
 
 		 96 aa  110  6e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.384902 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0729  protein of unknown function DUF497  54.17 
 
 		 94 aa  104  3e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.132197  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2483  hypothetical protein  53.26 
 
 		 99 aa  84.7  4e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2135  hypothetical protein  50.53 
 
 		 99 aa  84.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.000237812  normal  0.0140128 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1396  hypothetical protein  52.17 
 
 		 99 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3295  protein of unknown function DUF497  51.09 
 
 		 103 aa  77  0.00000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.840265  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4127  protein of unknown function DUF497  45.65 
 
 		 99 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.186992  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1052  protein of unknown function DUF497  46.74 
 
 		 106 aa  73.2  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238312 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0914  protein of unknown function DUF497  47.83 
 
 		 106 aa  73.2  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1715  protein of unknown function DUF497  41.25 
 
 		 93 aa  52  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.643907  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1479  hypothetical protein  41.38 
 
 		 105 aa  51.6  0.000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0124462  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5052  protein of unknown function DUF497  38.78 
 
 		 94 aa  50.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.174132 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1518  hypothetical protein  32.97 
 
 		 102 aa  48.9  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0265  protein of unknown function DUF497  41.49 
 
 		 90 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2518  protein of unknown function DUF497  41.03 
 
 		 81 aa  47.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013737  Slin_7052  protein of unknown function DUF497  31.82 
 
 		 98 aa  47.4  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2952  hypothetical protein  34.78 
 
 		 98 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000403961 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1353  hypothetical protein  30.85 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00336561  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0832  hypothetical protein  35.11 
 
 		 98 aa  45.4  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000000167324  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1103  hypothetical protein  36.47 
 
 		 96 aa  43.9  0.0008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0124894  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0658  hypothetical protein  35.8 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.724327  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1315  protein of unknown function DUF497  31.82 
 
 		 93 aa  41.2  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000162456 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0085  hypothetical protein  37.04 
 
 		 102 aa  41.2  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4530  hypothetical protein  31.52 
 
 		 92 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1380  hypothetical protein  31.52 
 
 		 92 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.26403  normal  0.829125 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>