59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4127 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4127  protein of unknown function DUF497  100 
 
 		 99 aa  201  4e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.186992  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2135  hypothetical protein  59.6 
 
 		 99 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.000237812  normal  0.0140128 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2483  hypothetical protein  60.61 
 
 		 99 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1396  hypothetical protein  60.2 
 
 		 99 aa  125  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3295  protein of unknown function DUF497  57.14 
 
 		 103 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.840265  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1052  protein of unknown function DUF497  54.17 
 
 		 106 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238312 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0914  protein of unknown function DUF497  47.83 
 
 		 106 aa  94.7  4e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1479  hypothetical protein  42.86 
 
 		 105 aa  79.3  0.00000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0124462  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2409  protein of unknown function DUF497  45.65 
 
 		 97 aa  75.1  0.0000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.65469  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5629  protein of unknown function DUF497  41.11 
 
 		 96 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.384902 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0729  protein of unknown function DUF497  36.17 
 
 		 94 aa  63.2  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.132197  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0265  protein of unknown function DUF497  37.5 
 
 		 90 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2272  protein of unknown function DUF497  37.08 
 
 		 94 aa  58.2  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.754948  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0131  hypothetical cytosolic protein  32.26 
 
 		 97 aa  58.2  0.00000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2195  hypothetical protein  30.85 
 
 		 97 aa  56.6  0.0000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0832  hypothetical protein  36.67 
 
 		 98 aa  55.5  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000000167324  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1105  hypothetical protein  39.33 
 
 		 93 aa  54.7  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5052  protein of unknown function DUF497  37.36 
 
 		 94 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.174132 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2952  hypothetical protein  33.71 
 
 		 98 aa  53.5  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000403961 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0714  hypothetical protein  39.78 
 
 		 125 aa  52.4  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0074508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2518  protein of unknown function DUF497  39.47 
 
 		 81 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1715  protein of unknown function DUF497  34.07 
 
 		 93 aa  52  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.643907  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0658  hypothetical protein  37.66 
 
 		 97 aa  51.2  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.724327  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3951  protein of unknown function DUF497  34.83 
 
 		 91 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.258424  hitchhiker  0.00220511 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1103  hypothetical protein  32.97 
 
 		 96 aa  50.1  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0124894  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3087  protein of unknown function DUF497  30.34 
 
 		 92 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3033  protein of unknown function DUF497  30.34 
 
 		 92 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.692737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0085  hypothetical protein  32.97 
 
 		 102 aa  49.3  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3765  hypothetical protein  34.83 
 
 		 93 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3974  hypothetical protein  37.5 
 
 		 115 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.789792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1315  protein of unknown function DUF497  36.78 
 
 		 93 aa  47.8  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000162456 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3563  protein of unknown function DUF497  34.74 
 
 		 101 aa  47.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0533639 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1490  hypothetical protein  40 
 
 		 89 aa  47.8  0.00006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.755193  normal  0.548062 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1518  hypothetical protein  30.21 
 
 		 102 aa  47.4  0.00006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1353  hypothetical protein  31.46 
 
 		 97 aa  47.4  0.00006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00336561  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7347  protein of unknown function DUF497  39.24 
 
 		 93 aa  47  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.155028  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2221  protein of unknown function DUF497  32.61 
 
 		 97 aa  45.4  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000287405  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2639  hypothetical protein  32.58 
 
 		 97 aa  45.4  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0754679  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0788  hypothetical protein  31.4 
 
 		 88 aa  45.4  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1807  hypothetical protein  31.03 
 
 		 110 aa  45.4  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.729301  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0665  hypothetical protein  30 
 
 		 95 aa  45.1  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.45959  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0173  hypothetical protein  35.14 
 
 		 79 aa  45.4  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.600645  normal  0.57162 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1380  hypothetical protein  32.58 
 
 		 92 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.26403  normal  0.829125 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5048  protein of unknown function DUF497  34.07 
 
 		 91 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.127602 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4530  hypothetical protein  32.58 
 
 		 92 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2414  hypothetical protein  35.63 
 
 		 93 aa  44.7  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.653132  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2045  protein of unknown function DUF497  35.63 
 
 		 93 aa  44.7  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.242597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1537  protein of unknown function DUF497  38.04 
 
 		 94 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0179855 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1486  hypothetical protein  34.48 
 
 		 94 aa  42.7  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1764  protein of unknown function DUF497  34.48 
 
 		 94 aa  42.7  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.324756  normal  0.194696 
 
 
-
 
NC_013737  Slin_7052  protein of unknown function DUF497  28.26 
 
 		 98 aa  42  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0188  hypothetical protein  34.07 
 
 		 101 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2051  hypothetical protein  31.03 
 
 		 102 aa  42  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0092  hypothetical protein  35.63 
 
 		 93 aa  41.6  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.978778 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1098  hypothetical protein  32.58 
 
 		 97 aa  41.2  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.826789  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1635  hypothetical protein  32.58 
 
 		 95 aa  41.2  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2093  protein of unknown function DUF497  34.78 
 
 		 94 aa  40.8  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.177613  normal  0.105621 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1757  hypothetical protein  34.78 
 
 		 94 aa  40.8  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4942  hypothetical protein  27.78 
 
 		 93 aa  40  0.01  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>