44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_5629 on replicon NC_011758
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011758  Mchl_5629  protein of unknown function DUF497  100 
 
 		 96 aa  200  4e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.384902 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2409  protein of unknown function DUF497  60 
 
 		 97 aa  110  6e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.65469  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0914  protein of unknown function DUF497  44.83 
 
 		 106 aa  78.2  0.00000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0729  protein of unknown function DUF497  47.19 
 
 		 94 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.132197  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1396  hypothetical protein  45.65 
 
 		 99 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1052  protein of unknown function DUF497  43.33 
 
 		 106 aa  73.6  0.0000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238312 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2135  hypothetical protein  46.74 
 
 		 99 aa  73.2  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.000237812  normal  0.0140128 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3295  protein of unknown function DUF497  43.43 
 
 		 103 aa  69.7  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.840265  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2483  hypothetical protein  45.56 
 
 		 99 aa  69.3  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4127  protein of unknown function DUF497  41.11 
 
 		 99 aa  64.3  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.186992  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0832  hypothetical protein  36.78 
 
 		 98 aa  58.2  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000000167324  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2952  hypothetical protein  34.88 
 
 		 98 aa  55.1  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000403961 
 
 
-
 
NC_013737  Slin_7052  protein of unknown function DUF497  34.09 
 
 		 98 aa  53.9  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1103  hypothetical protein  40.79 
 
 		 96 aa  53.1  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0124894  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0265  protein of unknown function DUF497  38.64 
 
 		 90 aa  52.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1479  hypothetical protein  36.78 
 
 		 105 aa  52  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0124462  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0085  hypothetical protein  35.56 
 
 		 102 aa  52.8  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1715  protein of unknown function DUF497  32.56 
 
 		 93 aa  52.4  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.643907  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5052  protein of unknown function DUF497  36.36 
 
 		 94 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.174132 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2195  hypothetical protein  29.55 
 
 		 97 aa  50.8  0.000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0131  hypothetical cytosolic protein  29.55 
 
 		 97 aa  48.9  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0788  hypothetical protein  39.08 
 
 		 88 aa  48.9  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3087  protein of unknown function DUF497  31.82 
 
 		 92 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3033  protein of unknown function DUF497  31.82 
 
 		 92 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.692737  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1807  hypothetical protein  33.33 
 
 		 110 aa  47.4  0.00006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.729301  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3765  hypothetical protein  34.83 
 
 		 93 aa  47.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1105  hypothetical protein  34.09 
 
 		 93 aa  46.2  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2272  protein of unknown function DUF497  33.33 
 
 		 94 aa  46.6  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.754948  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2518  protein of unknown function DUF497  33.77 
 
 		 81 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5048  protein of unknown function DUF497  33.72 
 
 		 91 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.127602 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3974  hypothetical protein  35.63 
 
 		 115 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.789792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0658  hypothetical protein  31.82 
 
 		 97 aa  44.7  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.724327  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1380  hypothetical protein  30 
 
 		 92 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.26403  normal  0.829125 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4530  hypothetical protein  30 
 
 		 92 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4512  protein of unknown function DUF497  32.18 
 
 		 97 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1764  protein of unknown function DUF497  30.34 
 
 		 94 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.324756  normal  0.194696 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1486  hypothetical protein  30.34 
 
 		 94 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2639  hypothetical protein  32.89 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0754679  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1518  hypothetical protein  34.48 
 
 		 102 aa  43.5  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3823  hypothetical protein  32.97 
 
 		 92 aa  42  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0126375  normal  0.293452 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2051  hypothetical protein  30.26 
 
 		 102 aa  41.2  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3951  protein of unknown function DUF497  28.41 
 
 		 91 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.258424  hitchhiker  0.00220511 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0665  hypothetical protein  28.89 
 
 		 95 aa  40.4  0.009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.45959  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0155  hypothetical protein  32.94 
 
 		 95 aa  40  0.01  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.465237  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>