40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1396 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_1396  hypothetical protein  100 
 
 
99 aa  207  4e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2135  hypothetical protein  65.31 
 
 
99 aa  136  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.000237812  normal  0.0140128 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2483  hypothetical protein  67.35 
 
 
99 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4127  protein of unknown function DUF497  60.2 
 
 
99 aa  125  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.186992  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3295  protein of unknown function DUF497  61.62 
 
 
103 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.840265  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1052  protein of unknown function DUF497  54.35 
 
 
106 aa  105  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238312 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0914  protein of unknown function DUF497  53.06 
 
 
106 aa  103  8e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2409  protein of unknown function DUF497  52.17 
 
 
97 aa  82.4  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.65469  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1479  hypothetical protein  45.36 
 
 
105 aa  80.5  0.000000000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0124462  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5629  protein of unknown function DUF497  45.65 
 
 
96 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.384902 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0729  protein of unknown function DUF497  41.05 
 
 
94 aa  69.7  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.132197  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5052  protein of unknown function DUF497  47.78 
 
 
94 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.174132 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0265  protein of unknown function DUF497  44.32 
 
 
90 aa  55.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0832  hypothetical protein  39.33 
 
 
98 aa  53.9  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000000167324  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1105  hypothetical protein  40.22 
 
 
93 aa  53.5  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1518  hypothetical protein  35.48 
 
 
102 aa  51.6  0.000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2952  hypothetical protein  37.08 
 
 
98 aa  50.8  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000403961 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1715  protein of unknown function DUF497  36.96 
 
 
93 aa  50.8  0.000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.643907  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0131  hypothetical cytosolic protein  34.94 
 
 
97 aa  50.4  0.000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2639  hypothetical protein  37.78 
 
 
97 aa  50.1  0.000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0754679  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2195  hypothetical protein  33.73 
 
 
97 aa  48.5  0.00003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1103  hypothetical protein  35.56 
 
 
96 aa  48.5  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0124894  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2518  protein of unknown function DUF497  39.47 
 
 
81 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0085  hypothetical protein  34.44 
 
 
102 aa  48.1  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2272  protein of unknown function DUF497  34.48 
 
 
94 aa  47.4  0.00006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.754948  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5048  protein of unknown function DUF497  38.89 
 
 
91 aa  47.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.127602 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3563  protein of unknown function DUF497  36.96 
 
 
101 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0533639 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0714  hypothetical protein  39.33 
 
 
125 aa  45.4  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0074508  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3765  hypothetical protein  34.83 
 
 
93 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3951  protein of unknown function DUF497  35.56 
 
 
91 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.258424  hitchhiker  0.00220511 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0658  hypothetical protein  38.96 
 
 
97 aa  43.5  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.724327  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2221  protein of unknown function DUF497  35.16 
 
 
97 aa  43.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000287405  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0788  hypothetical protein  36.84 
 
 
88 aa  43.5  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1098  hypothetical protein  36.26 
 
 
97 aa  43.5  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.826789  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2051  hypothetical protein  34.48 
 
 
102 aa  42.4  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1315  protein of unknown function DUF497  37.36 
 
 
93 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000162456 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1353  hypothetical protein  37.36 
 
 
97 aa  42  0.003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00336561  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1380  hypothetical protein  35.96 
 
 
92 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.26403  normal  0.829125 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4530  hypothetical protein  35.96 
 
 
92 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3974  hypothetical protein  37.65 
 
 
115 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.789792  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>