66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_3295 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_3295  protein of unknown function DUF497  100 
 
 		 103 aa  213  7e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.840265  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2135  hypothetical protein  65.96 
 
 		 99 aa  135  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.000237812  normal  0.0140128 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2483  hypothetical protein  62.24 
 
 		 99 aa  127  6e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1396  hypothetical protein  61.62 
 
 		 99 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4127  protein of unknown function DUF497  57.14 
 
 		 99 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.186992  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0914  protein of unknown function DUF497  53.26 
 
 		 106 aa  99  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1052  protein of unknown function DUF497  47.96 
 
 		 106 aa  95.5  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238312 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1479  hypothetical protein  44.33 
 
 		 105 aa  77.4  0.00000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0124462  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2409  protein of unknown function DUF497  51.09 
 
 		 97 aa  77  0.00000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.65469  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5629  protein of unknown function DUF497  43.43 
 
 		 96 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.384902 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0131  hypothetical cytosolic protein  34.44 
 
 		 97 aa  64.7  0.0000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2195  hypothetical protein  34.44 
 
 		 97 aa  64.3  0.0000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0729  protein of unknown function DUF497  40.43 
 
 		 94 aa  63.2  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.132197  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0265  protein of unknown function DUF497  42.05 
 
 		 90 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5052  protein of unknown function DUF497  39.56 
 
 		 94 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.174132 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0832  hypothetical protein  36.96 
 
 		 98 aa  59.3  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000000167324  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1105  hypothetical protein  38.2 
 
 		 93 aa  57  0.00000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0658  hypothetical protein  38.96 
 
 		 97 aa  55.8  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.724327  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2272  protein of unknown function DUF497  33.33 
 
 		 94 aa  55.8  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.754948  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2952  hypothetical protein  37.08 
 
 		 98 aa  55.1  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000403961 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3951  protein of unknown function DUF497  34.83 
 
 		 91 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.258424  hitchhiker  0.00220511 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1715  protein of unknown function DUF497  35.96 
 
 		 93 aa  54.3  0.0000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.643907  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1518  hypothetical protein  36.56 
 
 		 102 aa  53.9  0.0000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0085  hypothetical protein  33.7 
 
 		 102 aa  53.9  0.0000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0788  hypothetical protein  36.05 
 
 		 88 aa  52  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2884  hypothetical protein  32.61 
 
 		 115 aa  52  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.443981  normal  0.0702268 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2518  protein of unknown function DUF497  36.84 
 
 		 81 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3563  protein of unknown function DUF497  33.33 
 
 		 101 aa  51.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0533639 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5048  protein of unknown function DUF497  36.26 
 
 		 91 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.127602 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4941  hypothetical protein  36.96 
 
 		 95 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.75621  normal  0.892041 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4934  hypothetical protein  36.96 
 
 		 95 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2221  protein of unknown function DUF497  33.7 
 
 		 97 aa  50.1  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000287405  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2639  hypothetical protein  32.61 
 
 		 97 aa  49.7  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0754679  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1486  hypothetical protein  34.48 
 
 		 94 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1103  hypothetical protein  31.46 
 
 		 96 aa  49.3  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0124894  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1764  protein of unknown function DUF497  34.48 
 
 		 94 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.324756  normal  0.194696 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4942  hypothetical protein  32.61 
 
 		 93 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3033  protein of unknown function DUF497  34.48 
 
 		 92 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.692737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3087  protein of unknown function DUF497  34.48 
 
 		 92 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0714  hypothetical protein  36.26 
 
 		 125 aa  47.4  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0074508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013737  Slin_7052  protein of unknown function DUF497  30.53 
 
 		 98 aa  47.4  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1353  hypothetical protein  30.77 
 
 		 97 aa  47.4  0.00007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00336561  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0173  hypothetical protein  33.78 
 
 		 79 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.600645  normal  0.57162 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1055  hypothetical protein  38.46 
 
 		 88 aa  45.8  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0177574  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3262  protein of unknown function DUF497  32.97 
 
 		 90 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000202958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1009  hypothetical protein  31.46 
 
 		 91 aa  44.3  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3974  hypothetical protein  33.33 
 
 		 115 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.789792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2272  hypothetical protein  33.33 
 
 		 99 aa  43.9  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4530  hypothetical protein  33.71 
 
 		 92 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2523  protein of unknown function DUF497  32.97 
 
 		 87 aa  43.5  0.0009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1380  hypothetical protein  33.71 
 
 		 92 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.26403  normal  0.829125 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5046  hypothetical protein  28.57 
 
 		 92 aa  43.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.896322  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3765  hypothetical protein  29.67 
 
 		 93 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0188  hypothetical protein  33.71 
 
 		 101 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0665  hypothetical protein  31.87 
 
 		 95 aa  42  0.003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.45959  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1331  hypothetical protein  36.36 
 
 		 86 aa  42  0.003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.600585  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1112  protein of unknown function DUF497  28.57 
 
 		 101 aa  42  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.402358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2939  hypothetical protein  32.76 
 
 		 85 aa  41.6  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1720  hypothetical protein  30 
 
 		 99 aa  41.2  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000140414  unclonable  0.000000009426 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1807  hypothetical protein  28.74 
 
 		 110 aa  40.8  0.006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.729301  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2093  protein of unknown function DUF497  35.79 
 
 		 94 aa  40.8  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.177613  normal  0.105621 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1757  hypothetical protein  35.79 
 
 		 94 aa  40.8  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1537  protein of unknown function DUF497  36.84 
 
 		 94 aa  40.4  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0179855 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1490  hypothetical protein  33.33 
 
 		 89 aa  40.4  0.008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.755193  normal  0.548062 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1969  protein of unknown function DUF497  31.46 
 
 		 92 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3823  hypothetical protein  31.18 
 
 		 92 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0126375  normal  0.293452 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>