70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0914 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_0914  protein of unknown function DUF497  100 
 
 
106 aa  219  7e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1052  protein of unknown function DUF497  64.15 
 
 
106 aa  142  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238312 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2135  hypothetical protein  55.1 
 
 
99 aa  110  6e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.000237812  normal  0.0140128 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2483  hypothetical protein  56.12 
 
 
99 aa  105  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1396  hypothetical protein  53.06 
 
 
99 aa  103  8e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3295  protein of unknown function DUF497  53.26 
 
 
103 aa  99  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.840265  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4127  protein of unknown function DUF497  47.83 
 
 
99 aa  94.7  4e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.186992  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1479  hypothetical protein  47.78 
 
 
105 aa  81.6  0.000000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0124462  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5629  protein of unknown function DUF497  44.83 
 
 
96 aa  78.2  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.384902 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2409  protein of unknown function DUF497  47.83 
 
 
97 aa  73.2  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.65469  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0265  protein of unknown function DUF497  39.53 
 
 
90 aa  65.5  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2952  hypothetical protein  37.08 
 
 
98 aa  65.5  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000403961 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5052  protein of unknown function DUF497  37.78 
 
 
94 aa  63.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.174132 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0729  protein of unknown function DUF497  38.71 
 
 
94 aa  60.1  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.132197  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0085  hypothetical protein  35.56 
 
 
102 aa  58.2  0.00000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1807  hypothetical protein  32.98 
 
 
110 aa  57.8  0.00000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.729301  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5048  protein of unknown function DUF497  35.23 
 
 
91 aa  57  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.127602 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2051  hypothetical protein  34.12 
 
 
102 aa  57  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0714  hypothetical protein  34.88 
 
 
125 aa  55.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0074508  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0832  hypothetical protein  34.48 
 
 
98 aa  55.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000000167324  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0788  hypothetical protein  30.95 
 
 
88 aa  55.5  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1715  protein of unknown function DUF497  32.18 
 
 
93 aa  54.7  0.0000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.643907  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0131  hypothetical cytosolic protein  32.58 
 
 
97 aa  54.7  0.0000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2195  hypothetical protein  32.58 
 
 
97 aa  54.3  0.0000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1757  hypothetical protein  37.21 
 
 
94 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2093  protein of unknown function DUF497  37.21 
 
 
94 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.177613  normal  0.105621 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3563  protein of unknown function DUF497  32.58 
 
 
101 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0533639 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3951  protein of unknown function DUF497  31.03 
 
 
91 aa  53.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.258424  hitchhiker  0.00220511 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0658  hypothetical protein  35.63 
 
 
97 aa  53.1  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.724327  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3974  hypothetical protein  31.82 
 
 
115 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.789792  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1537  protein of unknown function DUF497  36.05 
 
 
94 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0179855 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1353  hypothetical protein  38.04 
 
 
97 aa  53.5  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00336561  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2272  protein of unknown function DUF497  33.33 
 
 
94 aa  52.8  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.754948  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1103  hypothetical protein  34.88 
 
 
96 aa  52.4  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0124894  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2639  hypothetical protein  36.46 
 
 
97 aa  51.6  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0754679  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1105  hypothetical protein  35.23 
 
 
93 aa  52  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2884  hypothetical protein  32.95 
 
 
115 aa  51.6  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.443981  normal  0.0702268 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0092  hypothetical protein  32.26 
 
 
93 aa  51.6  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.978778 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3087  protein of unknown function DUF497  34.12 
 
 
92 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2518  protein of unknown function DUF497  35.53 
 
 
81 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1009  hypothetical protein  32.95 
 
 
91 aa  49.7  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3765  hypothetical protein  33.33 
 
 
93 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0665  hypothetical protein  33.72 
 
 
95 aa  49.7  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.45959  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3033  protein of unknown function DUF497  34.12 
 
 
92 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.692737  normal 
 
 
-
 
NC_013737  Slin_7052  protein of unknown function DUF497  30 
 
 
98 aa  48.9  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1635  hypothetical protein  39.77 
 
 
95 aa  49.3  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1969  protein of unknown function DUF497  34.15 
 
 
92 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4530  hypothetical protein  27.59 
 
 
92 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3748  protein of unknown function DUF497  29.55 
 
 
92 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1380  hypothetical protein  27.59 
 
 
92 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.26403  normal  0.829125 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1764  protein of unknown function DUF497  29.41 
 
 
94 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.324756  normal  0.194696 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1486  hypothetical protein  29.41 
 
 
94 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1034  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1315  protein of unknown function DUF497  30.77 
 
 
93 aa  47  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000162456 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1996  protein of unknown function DUF497  32.93 
 
 
92 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.80933  normal  0.0698328 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1518  hypothetical protein  32.26 
 
 
102 aa  45.4  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2045  protein of unknown function DUF497  29.67 
 
 
93 aa  45.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.242597  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2414  hypothetical protein  29.67 
 
 
93 aa  45.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.653132  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4512  protein of unknown function DUF497  32.94 
 
 
97 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0155  hypothetical protein  30.68 
 
 
95 aa  45.1  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.465237  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7347  protein of unknown function DUF497  40.26 
 
 
93 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.155028  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0188  hypothetical protein  31.82 
 
 
101 aa  44.3  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5046  hypothetical protein  30.23 
 
 
92 aa  44.3  0.0006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.896322  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3262  protein of unknown function DUF497  32.56 
 
 
90 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000202958  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2272  hypothetical protein  32.58 
 
 
99 aa  42.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4934  hypothetical protein  28.89 
 
 
95 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4941  hypothetical protein  28.89 
 
 
95 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.75621  normal  0.892041 
 
 
-
 
NC_013734  Slin_7016  protein of unknown function DUF497  28.28 
 
 
106 aa  42.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000453911  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3672  protein of unknown function DUF497  28.24 
 
 
88 aa  41.2  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2438  protein of unknown function DUF497  28.24 
 
 
88 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0435  putative toxin-antitoxin system, toxin component  29.67 
 
 
91 aa  40.4  0.008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000190302 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>