71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1052 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1052  protein of unknown function DUF497  100 
 
 
106 aa  218  1.9999999999999999e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238312 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0914  protein of unknown function DUF497  64.15 
 
 
106 aa  142  2e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2135  hypothetical protein  55.56 
 
 
99 aa  110  6e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.000237812  normal  0.0140128 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4127  protein of unknown function DUF497  54.17 
 
 
99 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.186992  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1396  hypothetical protein  54.35 
 
 
99 aa  105  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2483  hypothetical protein  55.91 
 
 
99 aa  104  5e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3295  protein of unknown function DUF497  47.96 
 
 
103 aa  95.5  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.840265  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1479  hypothetical protein  48.39 
 
 
105 aa  88.6  3e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0124462  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5629  protein of unknown function DUF497  43.33 
 
 
96 aa  73.6  0.0000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.384902 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2409  protein of unknown function DUF497  46.74 
 
 
97 aa  73.2  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.65469  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0729  protein of unknown function DUF497  41.94 
 
 
94 aa  70.5  0.000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.132197  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0265  protein of unknown function DUF497  39.53 
 
 
90 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2952  hypothetical protein  39.08 
 
 
98 aa  64.3  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000403961 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0714  hypothetical protein  37.89 
 
 
125 aa  62  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0074508  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3974  hypothetical protein  35.79 
 
 
115 aa  60.5  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.789792  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0832  hypothetical protein  36.78 
 
 
98 aa  60.5  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000000167324  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0131  hypothetical cytosolic protein  35.56 
 
 
97 aa  59.7  0.00000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5048  protein of unknown function DUF497  38.64 
 
 
91 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.127602 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3563  protein of unknown function DUF497  36.27 
 
 
101 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0533639 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2195  hypothetical protein  35.56 
 
 
97 aa  58.5  0.00000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5052  protein of unknown function DUF497  38.2 
 
 
94 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.174132 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1807  hypothetical protein  32.94 
 
 
110 aa  57  0.00000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.729301  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0085  hypothetical protein  37.78 
 
 
102 aa  56.6  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1518  hypothetical protein  31.68 
 
 
102 aa  55.5  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2884  hypothetical protein  31.87 
 
 
115 aa  55.1  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.443981  normal  0.0702268 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4530  hypothetical protein  34.07 
 
 
92 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1380  hypothetical protein  34.07 
 
 
92 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.26403  normal  0.829125 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2272  protein of unknown function DUF497  35.63 
 
 
94 aa  52.8  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.754948  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1635  hypothetical protein  43.18 
 
 
95 aa  53.1  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1105  hypothetical protein  36.36 
 
 
93 aa  53.5  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0658  hypothetical protein  40.23 
 
 
97 aa  52.4  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.724327  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1715  protein of unknown function DUF497  32.58 
 
 
93 aa  52.8  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.643907  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1353  hypothetical protein  39.33 
 
 
97 aa  51.6  0.000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00336561  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1757  hypothetical protein  36.26 
 
 
94 aa  52  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2093  protein of unknown function DUF497  36.26 
 
 
94 aa  52  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.177613  normal  0.105621 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0665  hypothetical protein  31.46 
 
 
95 aa  51.2  0.000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.45959  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1103  hypothetical protein  36.49 
 
 
96 aa  50.8  0.000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0124894  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0188  hypothetical protein  36.78 
 
 
101 aa  50.8  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0788  hypothetical protein  32.14 
 
 
88 aa  50.4  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2221  protein of unknown function DUF497  32.97 
 
 
97 aa  50.4  0.000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000287405  n/a   
 
 
-
 
NC_013737  Slin_7052  protein of unknown function DUF497  32.29 
 
 
98 aa  50.1  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3765  hypothetical protein  32.97 
 
 
93 aa  50.1  0.000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3033  protein of unknown function DUF497  36.47 
 
 
92 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.692737  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1486  hypothetical protein  31.76 
 
 
94 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1034  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1764  protein of unknown function DUF497  31.76 
 
 
94 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.324756  normal  0.194696 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3087  protein of unknown function DUF497  36.47 
 
 
92 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3748  protein of unknown function DUF497  34.48 
 
 
92 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1009  hypothetical protein  34.09 
 
 
91 aa  48.9  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1315  protein of unknown function DUF497  31.4 
 
 
93 aa  48.5  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000162456 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2272  hypothetical protein  34.04 
 
 
99 aa  48.5  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2106  hypothetical protein  40.91 
 
 
95 aa  48.5  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000345649  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1537  protein of unknown function DUF497  38.04 
 
 
94 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0179855 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4942  hypothetical protein  34.44 
 
 
93 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5046  hypothetical protein  31.46 
 
 
92 aa  48.1  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.896322  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2051  hypothetical protein  34.12 
 
 
102 aa  47.8  0.00005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2639  hypothetical protein  33.33 
 
 
97 aa  47.4  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0754679  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4941  hypothetical protein  33.33 
 
 
95 aa  47.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.75621  normal  0.892041 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4934  hypothetical protein  33.33 
 
 
95 aa  47.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3823  hypothetical protein  34.78 
 
 
92 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0126375  normal  0.293452 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1969  protein of unknown function DUF497  35.63 
 
 
92 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3951  protein of unknown function DUF497  31.03 
 
 
91 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.258424  hitchhiker  0.00220511 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2518  protein of unknown function DUF497  35.53 
 
 
81 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2045  protein of unknown function DUF497  30.23 
 
 
93 aa  44.3  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.242597  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2414  hypothetical protein  30.23 
 
 
93 aa  44.3  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.653132  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1996  protein of unknown function DUF497  34.48 
 
 
92 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.80933  normal  0.0698328 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7347  protein of unknown function DUF497  40.23 
 
 
93 aa  43.5  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.155028  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0155  hypothetical protein  31.4 
 
 
95 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.465237  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0092  hypothetical protein  29.21 
 
 
93 aa  40.8  0.007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.978778 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4512  protein of unknown function DUF497  32.94 
 
 
97 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013734  Slin_7016  protein of unknown function DUF497  30.63 
 
 
106 aa  40  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000453911  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0173  hypothetical protein  34.67 
 
 
79 aa  40  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.600645  normal  0.57162 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>