47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_2490 on replicon NC_007968
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007968  Pcryo_2490  putative inner membrane protein  100 
 
 
47 aa  99.8  1e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.288099  normal  0.980067 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2221  protein of unknown function DUF497  65.91 
 
 
97 aa  63.9  0.0000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000287405  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2272  hypothetical protein  63.04 
 
 
99 aa  60.1  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4941  hypothetical protein  60.87 
 
 
95 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.75621  normal  0.892041 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4934  hypothetical protein  60.87 
 
 
95 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4942  hypothetical protein  58.7 
 
 
93 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1112  protein of unknown function DUF497  56.82 
 
 
101 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.402358  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0265  protein of unknown function DUF497  50 
 
 
90 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5033  hypothetical protein  52.17 
 
 
105 aa  52  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.659592  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3974  hypothetical protein  53.19 
 
 
115 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.789792  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3563  protein of unknown function DUF497  65.62 
 
 
101 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0533639 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5048  protein of unknown function DUF497  48.89 
 
 
91 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.127602 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0714  hypothetical protein  64.52 
 
 
125 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0074508  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1715  protein of unknown function DUF497  51.28 
 
 
93 aa  48.1  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.643907  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0085  hypothetical protein  54.05 
 
 
102 aa  47.4  0.00006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0788  hypothetical protein  41.3 
 
 
88 aa  47  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4530  hypothetical protein  47.73 
 
 
92 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0188  hypothetical protein  45.65 
 
 
101 aa  45.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1807  hypothetical protein  55.56 
 
 
110 aa  45.4  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.729301  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1380  hypothetical protein  47.73 
 
 
92 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.26403  normal  0.829125 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0832  hypothetical protein  58.06 
 
 
98 aa  46.2  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000000167324  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0092  hypothetical protein  51.06 
 
 
93 aa  45.4  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.978778 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3748  protein of unknown function DUF497  50 
 
 
92 aa  45.1  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4512  protein of unknown function DUF497  43.48 
 
 
97 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3765  hypothetical protein  46.81 
 
 
93 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0131  hypothetical cytosolic protein  60 
 
 
97 aa  44.7  0.0005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3908  hypothetical protein  45.65 
 
 
102 aa  44.3  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2952  hypothetical protein  44.68 
 
 
98 aa  44.3  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000403961 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1105  hypothetical protein  50 
 
 
93 aa  44.3  0.0006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2518  protein of unknown function DUF497  64.29 
 
 
81 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2939  hypothetical protein  61.29 
 
 
85 aa  43.5  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2195  hypothetical protein  56.67 
 
 
97 aa  43.1  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5052  protein of unknown function DUF497  41.86 
 
 
94 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.174132 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2272  protein of unknown function DUF497  44.44 
 
 
94 aa  42.7  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.754948  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1103  hypothetical protein  42.22 
 
 
96 aa  42.4  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0124894  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3087  protein of unknown function DUF497  47.83 
 
 
92 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3033  protein of unknown function DUF497  47.83 
 
 
92 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.692737  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1969  protein of unknown function DUF497  41.3 
 
 
92 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1996  protein of unknown function DUF497  41.3 
 
 
92 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.80933  normal  0.0698328 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0665  hypothetical protein  42.22 
 
 
95 aa  41.2  0.005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.45959  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3823  hypothetical protein  40.91 
 
 
92 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0126375  normal  0.293452 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0658  hypothetical protein  50 
 
 
97 aa  41.2  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.724327  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1009  hypothetical protein  40.91 
 
 
91 aa  41.2  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2884  hypothetical protein  44.68 
 
 
115 aa  41.2  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.443981  normal  0.0702268 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5046  hypothetical protein  42.55 
 
 
92 aa  40.4  0.008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.896322  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1098  hypothetical protein  47.73 
 
 
97 aa  40.4  0.008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.826789  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1635  hypothetical protein  51.35 
 
 
95 aa  40.4  0.008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>