58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6777 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_6777  protein of unknown function DUF497  100 
 
 		 97 aa  202  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0610097  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2093  protein of unknown function DUF497  40.91 
 
 		 94 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.177613  normal  0.105621 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1757  hypothetical protein  40.91 
 
 		 94 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0338  hypothetical protein  37.5 
 
 		 91 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4438  protein of unknown function DUF497  41.57 
 
 		 92 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1537  protein of unknown function DUF497  41.46 
 
 		 94 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0179855 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1486  hypothetical protein  37.35 
 
 		 94 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1764  protein of unknown function DUF497  37.35 
 
 		 94 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.324756  normal  0.194696 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3033  protein of unknown function DUF497  35.71 
 
 		 92 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.692737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3087  protein of unknown function DUF497  35.71 
 
 		 92 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2070  hypothetical protein  36.78 
 
 		 90 aa  51.6  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00017339  hitchhiker  0.0000419311 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1490  hypothetical protein  39.44 
 
 		 89 aa  50.8  0.000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.755193  normal  0.548062 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2438  protein of unknown function DUF497  34.94 
 
 		 88 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2249  hypothetical protein  46.15 
 
 		 67 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.367779 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3262  protein of unknown function DUF497  39.29 
 
 		 90 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000202958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2631  hypothetical protein  34.12 
 
 		 92 aa  48.5  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.268896  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1969  protein of unknown function DUF497  39.51 
 
 		 92 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4530  hypothetical protein  37.35 
 
 		 92 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3672  protein of unknown function DUF497  34.94 
 
 		 88 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1380  hypothetical protein  37.35 
 
 		 92 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.26403  normal  0.829125 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3748  protein of unknown function DUF497  38.2 
 
 		 92 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2414  hypothetical protein  38.2 
 
 		 93 aa  47.8  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.653132  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2045  protein of unknown function DUF497  38.2 
 
 		 93 aa  47.8  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.242597  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31950  hypothetical protein  33.33 
 
 		 89 aa  47.8  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4512  protein of unknown function DUF497  38.1 
 
 		 97 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2884  hypothetical protein  32.53 
 
 		 115 aa  47.8  0.00006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.443981  normal  0.0702268 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2295  hypothetical protein  37.18 
 
 		 83 aa  47  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0555295  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1315  protein of unknown function DUF497  39.29 
 
 		 93 aa  47  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000162456 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0665  hypothetical protein  32.14 
 
 		 95 aa  45.8  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.45959  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1996  protein of unknown function DUF497  38.27 
 
 		 92 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.80933  normal  0.0698328 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0832  hypothetical protein  30 
 
 		 98 aa  45.4  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000000167324  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3634  hypothetical protein  31.71 
 
 		 96 aa  45.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.20528  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0927  protein of unknown function DUF497  35.29 
 
 		 89 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.317041 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3974  hypothetical protein  33.72 
 
 		 115 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.789792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3823  hypothetical protein  36.14 
 
 		 92 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0126375  normal  0.293452 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1354  hypothetical protein  36.14 
 
 		 90 aa  45.1  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00877367  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1491  hypothetical protein  32.97 
 
 		 97 aa  44.3  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5046  hypothetical protein  36.47 
 
 		 92 aa  44.3  0.0006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.896322  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3100  hypothetical protein  34.09 
 
 		 92 aa  43.9  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0714  hypothetical protein  32.94 
 
 		 125 aa  43.9  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0074508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2478  hypothetical protein  32.47 
 
 		 88 aa  43.5  0.0009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.513735  normal  0.240444 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0914  protein of unknown function DUF497  29.21 
 
 		 106 aa  43.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2135  hypothetical protein  35.87 
 
 		 99 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.000237812  normal  0.0140128 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0417  protein of unknown function DUF497  32.39 
 
 		 91 aa  43.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.630479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0155  hypothetical protein  34.88 
 
 		 95 aa  43.5  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.465237  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3951  protein of unknown function DUF497  32.53 
 
 		 91 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.258424  hitchhiker  0.00220511 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1807  hypothetical protein  28.26 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.729301  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4127  protein of unknown function DUF497  32.94 
 
 		 99 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.186992  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1184  protein of unknown function DUF497  32.14 
 
 		 90 aa  42.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.030767  normal  0.28927 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1055  hypothetical protein  33.72 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0177574  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1009  hypothetical protein  36.9 
 
 		 91 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2763  hypothetical protein  34.57 
 
 		 82 aa  42  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0975  hypothetical protein  32.56 
 
 		 106 aa  42  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.024485  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0188  hypothetical protein  39.76 
 
 		 101 aa  41.2  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3971  protein of unknown function DUF497  40.43 
 
 		 78 aa  41.2  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101642 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2638  hypothetical protein  35.42 
 
 		 97 aa  41.2  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.619924 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2483  hypothetical protein  34.12 
 
 		 99 aa  41.2  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1006  hypothetical protein  31.71 
 
 		 90 aa  40.8  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.779657  normal  0.61 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>