156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1384 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_1384  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  100 
 
 
453 aa  925    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000311988  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0079  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  36.13 
 
 
443 aa  252  9.000000000000001e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000481582  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14350  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  34.04 
 
 
441 aa  240  4e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000459992  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0494  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  32.33 
 
 
440 aa  217  2.9999999999999998e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0552147  hitchhiker  0.00321553 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1081  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  32.79 
 
 
441 aa  216  5e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0983161 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0263  NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit RnfC  32.55 
 
 
437 aa  209  1e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0680  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  32.32 
 
 
435 aa  208  2e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0704  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  31.85 
 
 
435 aa  206  1e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1663  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  30.05 
 
 
436 aa  198  2.0000000000000003e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0304  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  31.47 
 
 
443 aa  197  3e-49  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.980459 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1310  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  31.28 
 
 
441 aa  197  3e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.643075 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1091  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  31.85 
 
 
437 aa  197  5.000000000000001e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.566886  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2430  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  30.68 
 
 
439 aa  196  8.000000000000001e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.216673  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1327  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  33.56 
 
 
439 aa  193  6e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000291101  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2628  electron transport complex protein RnfC  31.94 
 
 
532 aa  192  8e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2699  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  30.82 
 
 
440 aa  189  9e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0888227  normal  0.012306 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1529  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  30.89 
 
 
441 aa  189  9e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.427394  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0342  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  31.24 
 
 
445 aa  189  1e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0539  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  31.07 
 
 
438 aa  189  1e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1571  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  29.98 
 
 
438 aa  183  5.0000000000000004e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2593  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  29.23 
 
 
440 aa  183  7e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1733  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  30.59 
 
 
435 aa  182  1e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0269079  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0211  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  30.84 
 
 
439 aa  181  2e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.507749  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0688  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  28.07 
 
 
605 aa  177  3e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0508448  normal  0.631588 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0988  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  28.94 
 
 
441 aa  176  8e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0936  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  29.14 
 
 
609 aa  171  2e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.787123  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1792  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  29.77 
 
 
541 aa  171  2e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00273011 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2991  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  28.64 
 
 
481 aa  171  3e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0387  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  28.24 
 
 
435 aa  171  3e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1173  electron transport complex protein RnfC  27.78 
 
 
515 aa  169  7e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2895  electron transport complex protein RnfC  27.8 
 
 
523 aa  169  1e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.473495  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2017  electron transport complex protein RnfC  31.57 
 
 
558 aa  167  5e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0610  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  29.21 
 
 
440 aa  166  5.9999999999999996e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0321334  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0065  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  28.81 
 
 
448 aa  166  9e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.791332  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0285  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  27.4 
 
 
506 aa  164  3e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.51844  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0814  electron transport complex protein RnfC  27.66 
 
 
515 aa  163  6e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.338019 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1155  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  30.93 
 
 
441 aa  162  8.000000000000001e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.47563 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2401  electron transport complex protein RnfC  29.66 
 
 
745 aa  160  3e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3194  4Fe-4S ferredoxin, RnfC  28.38 
 
 
517 aa  160  6e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0306  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  28.21 
 
 
454 aa  159  7e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.521272  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3933  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  28.77 
 
 
517 aa  159  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00505107  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1161  electron transport complex protein RnfC  29.02 
 
 
570 aa  157  3e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0974  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  26.57 
 
 
438 aa  154  2e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1785  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  26.22 
 
 
567 aa  154  2.9999999999999998e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3194  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  27.25 
 
 
519 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0106168  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002947  electron transport complex protein RnfC  26.08 
 
 
916 aa  151  2e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.703595  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02966  electron transport complex protein RnfC  26.28 
 
 
912 aa  151  2e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1819  electron transport complex protein RnfC  27.59 
 
 
673 aa  150  3e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000614228 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2967  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  27.29 
 
 
890 aa  150  4e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.390488  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50960  Electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  28.61 
 
 
496 aa  148  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.228247  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1034  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  26.56 
 
 
704 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.321702  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3234  electron transport complex protein RnfC  29.03 
 
 
573 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02731  electron transport complex protein RnfC  28.31 
 
 
852 aa  146  7.0000000000000006e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.618008  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0838  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase, A subunit  27.92 
 
 
480 aa  145  1e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0144455  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0536  electron transport complex protein RnfC  26.51 
 
 
773 aa  145  2e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000392819  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1870  electron transport complex protein RnfC  27.33 
 
 
716 aa  144  4e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00517809  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1570  electron transport complex protein RnfC  26.41 
 
 
676 aa  138  2e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.133646  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01589  hypothetical protein  26.68 
 
 
694 aa  137  4e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00945839  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01599  electron transport complex protein RnfC  26.68 
 
 
740 aa  137  5e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0105357  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2012  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  26.68 
 
 
740 aa  137  5e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000275301  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2000  electron transport complex protein RnfC  26.68 
 
 
740 aa  137  5e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000227688  normal  0.287278 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2156  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  29.31 
 
 
673 aa  136  6.0000000000000005e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.261031  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1705  electron transport complex protein RnfC  26.68 
 
 
740 aa  137  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0365167  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1837  electron transport complex protein RnfC  26.68 
 
 
740 aa  137  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0944307  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1818  electron transport complex protein RnfC  26.46 
 
 
708 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.243946  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2341  electron transport complex protein RnfC  26.46 
 
 
772 aa  134  3e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0288695  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0699  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  26.59 
 
 
442 aa  133  5e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19250  electron transport complex protein RnfC  25.46 
 
 
688 aa  133  6e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1717  electron transport complex protein RnfC  26.92 
 
 
735 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1885  electron transport complex protein RnfC  26.92 
 
 
704 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1627  electron transport complex protein RnfC  26.92 
 
 
735 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0777449  normal  0.304577 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2239  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  27.55 
 
 
703 aa  132  1.0000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000974734 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1555  electron transport complex protein RnfC  26.92 
 
 
732 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.555385  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1567  electron transport complex protein RnfC  26.92 
 
 
735 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0379557 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1402  electron transport complex protein RnfC  27.48 
 
 
944 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.860812 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1918  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  25.93 
 
 
673 aa  130  6e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2023  electron transport complex protein RnfC  26.88 
 
 
747 aa  130  6e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2323  electron transport complex protein RnfC  28.25 
 
 
737 aa  129  9.000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1494  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  24.42 
 
 
503 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.454099 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1543  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  25.93 
 
 
981 aa  127  4.0000000000000003e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0195747 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2822  electron transport complex, C subunit  25.12 
 
 
495 aa  127  5e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1848  electron transport complex protein RnfC  26.33 
 
 
793 aa  125  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00264282  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2042  electron transport complex protein RnfC  25.62 
 
 
842 aa  125  1e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.875859  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18920  electron transport complex protein RnfC  26.19 
 
 
774 aa  125  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000329645  normal  0.0619935 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1909  electron transport complex protein RnfC  26.12 
 
 
799 aa  124  3e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.567258  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1865  electron transport complex protein RnfC  27.19 
 
 
731 aa  124  4e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2170  electron transport complex protein RnfC  26.95 
 
 
788 aa  123  5e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0332538  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2066  electron transport complex protein RnfC  26.73 
 
 
809 aa  123  6e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00275367  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0528  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  26.21 
 
 
427 aa  123  7e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2008  electron transport complex protein RnfC  27.01 
 
 
698 aa  122  9e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2510  electron transport complex protein RnfC  26.5 
 
 
790 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1896  electron transport complex protein RnfC  26.37 
 
 
698 aa  121  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.813056  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2252  electron transport complex protein RnfC  26.37 
 
 
659 aa  121  3e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00637467  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2174  electron transport complex protein RnfC  26.11 
 
 
846 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.234957  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4547  electron transport complex protein RnfC  27.25 
 
 
884 aa  119  9e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2261  electron transport complex protein RnfC  27.25 
 
 
884 aa  119  9e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0443736  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1638  electron transport complex protein RnfC  25.06 
 
 
776 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2558  electron transport complex protein RnfC  25.6 
 
 
784 aa  117  5e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0669031 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2355  electron transport complex protein RnfC  26.85 
 
 
825 aa  116  6.9999999999999995e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2063  electron transport complex protein RnfC  26.5 
 
 
885 aa  116  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00525621  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>